Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi
Yıl: 2019 Cilt: 23 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 247 - 253 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.29050/harranziraat.487490 İndeks Tarihi: 29-12-2020
Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi
Öz: Bu çalışmada, Hereford ırkı sığır populasyonunda Stearoyl CoA Desaturase (SCD) genpolimorfizmi belirlenmiştir. SCD geni ekson V bölgesi gen dizi bilgilerine göre A702G, T762C veC878T tek nükleotid polimorfizmleri (SNP) tespit edilmiştir. A702G bölgesinde AA, AG ve GGgenotiplerinin frekansları sırasıyla; %20.69, 44.83 ve 34.45, T762C bölgesinde TT, TC ve CCgenotiplerinin frekansları sırasıyla; %13.79, 62.07 ve 24.14, C878T bölgesinde CC, CT ve TTgenotiplerinin frekansları sırasıyla; %44.83, 31.03 ve 24.14 olarak hesaplanmıştır. Bununlaberaber, A702G bölgesinde A ve G allel frekansları 0.431 ve 0.569, T762C bölgesinde T ve Callel frekansları 0.448 ve 0.552, C878T bölgesinde C ve T allel frekansları 0.603 ve 0.397'dir.Ayrıca ilgili SNP’ler bakımından populasyonun Hardy-Weinberg dengesinde olmadığıbelirlenmiştir (P>0.05).
Anahtar Kelime: Polymorphism of stearoyl-CoA desaturase (SCD) gene in Hereford cattle breed
Öz: In this study, Stearoyl CoA Desaturase (SCD) gene polymorphism was determined in Hereford cattle breed. A702G, T762C and C878T single nükleotid polymorfphisms (SNPs) have been identified based on DNA sequence information of exon V region in SCD gene. AA, AG and GG genotype frequencies were 20.69%, 44.83% and 34.45% in A702G region, and TT, TC and CC genotype frequencies were 13.79%, 62.07% and 24.14% T762C region, and CC, CT and TT genotype frequencies were %44.83, 31.03 and 24.14 in C878T region, respectively. In addition, A and G allele frequencies were 0.431 and 0.569 in A702G region, T and C allele frequencies were 0.448 and 0.552 in T762C region, and C and T allele frequencies were 0.603 and 0.397 in C878T region, respectively. In addition, it was found that the population was not at Hardy- Weinberg equilibrium in terms of related SNP genotypes.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- Bölükbaşı, C., Erhan, M.K., & Çelebi, Ş. (2005). The effects of dietary conjugated linoleic acid (CLA), sunflower oil and soybean oil on fatty acid composition of yolk and egg quality in laying hen. Journal of Food Technology, 3(3), 427-429.
- Chung, M., Ha, S., Jeong, S., Bok, J., Che, K., Baik, M., & Choi, Y. (2000). Cloning and characterization of bovine Stearoyl CoA desaturase cDNA from adipose tissues. Bioscience, Biotechnology and Biochemistry, 64, 1526-1530.
- Conte, G., Mele, M., Castiglinoni, B., Serra, A., Viva, M., Chessa, S., Pagnacco, G., & Secchiari, P. (2006). Relationship between bovine SCD polymorphism locus and mammary gland desaturation activity. In: Proceedings of the 8th World congress on genetics applied to livestock production (pp. 22-37). Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil,13-18 August.
- Elmas, H., Koncagül, S., & Kiraz, S. (2015). Sığırlarda SCD (stearoyl-coa desaturase) geni. GAP VII. Tarım Kongresi Bildiri Kitabı, 28 Nisan -01 Mayıs. HRÜ. Şanlıurfa.
- Kgwatalala, P.M., Ibeagha-Awemu, E.M., Mustafa, A.F., & Zhao, X. (2009). Influence of Stearoyl coenzyme a desaturase 1 genotype and stage of lactation on fatty acid composition jersey cows. Journal of Dairy Science, 92, 1220-1228.
- Köknaroğlu, H. (2007). Beslemenin sığır eti konjuge linoleik asit miktarına etkisi. Hayvansal Üretim, 48(1), 1-7.
- Loor, J.J., Lin, X.B., & Herbein, J.H. (2003). Effects of dietary cis-9, trans-11-18:2, trans-10, cis-12- 18:2, or vaccenic acid (trans-11-18:1) during lactation on body composition, tissue fatty acid profiles, and litter growth in mice. British Journal of Nutrition, 90, 1039-1048.
- Macciota, N.P.P., Mele, M., Conte, G., Serra, A., Cassandro, M., Dal Zotto, R., Borlino, A.C., Pagnacco, G., & Secchiari, P. (2008). Association between a polymorphism at the Stearoyl-CoA desaturase locus and milk production traits in Italian Holsteins. Journal of Dairy Science, 91, 3184-3189.
- Matsuhashi, T., Maruyama, S., Uemoto, Y., Kobayashi, N., Manen, H., Abe, T., Sakaguch, S., & Kobayashi, E. (2011). Effects of bovine fatty acid synthase, Stearoyl coenzyme a desaturase, sterol regulatory element-binding protein 1, and growth hormone gene polymorphisms on fatty acid composition and carcass traits in Japanese black cattle. Journal of Animal Science, 89, 12- 22.
- Milanesi, E., Nicoloso, L., & Crepaldi, P. (2007). Stearoyl CoA Desaturase (SCD) gene polymorphisms in Italian cattle breeds. sezione di zootecnica agraria, dipartimento di scienze animali, Universita Delgi Studi di Milano, Milamo, Italy.
- Milanesi, E., Nicoloso, L., & Crepaldi, P. (2008). Stearoyl CoA desaturase (SCD) gene polymorphisms in Italian cattle breeds. Journal of Animal Breeding and Genetics, 125(1), 63-67.
- Peterson, D.G., Kelsey, J.A., & Bauman, D.E. (2002). Analysis of variation in cis-9, trans-11 conjugated linoleic acid (CLA) in milk fat of dairy cows. Journal Dairy Science, 85: 2164-2172.
- Stockdale, C.R., Walker, G.P., Wales, W.J., Dalley, D.E., Bırkett, A., Shen, Z., & Doyle, P.T. (2003). Influence of pasture and concentrates in the diet of grazing dairy cows on the fatty acid composition of milk. Journal of Dairy Research, 70, 267-276.
- Tanuguchi, M., Utsugi, T., Oyama, K., Manen, H., Kobayashi, M., Tanabe, Y., Ogino, A & Tsuji, S. (2004). Genotype of Stearoly Coenzyme-A Desaturase is Associated with Fatty Acid Composition in Japanese Black Cattle. Mammalian Genome, 14, 142-150.
- Yeh, F.C., Yang, R.C., Boyle, T.B.J., & Mao, J.X. (1997). Theuser-Friendly Share Ware for Population Genetic Analysis. University of Alberta, Canada.
| APA | Nergis H, Koncagül S, KIRAZ S (2019). Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. , 247 - 253. 10.29050/harranziraat.487490 |
| Chicago | Nergis Hazniye,Koncagül Seyrani,KIRAZ SELAHADDIN Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. (2019): 247 - 253. 10.29050/harranziraat.487490 |
| MLA | Nergis Hazniye,Koncagül Seyrani,KIRAZ SELAHADDIN Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. , 2019, ss.247 - 253. 10.29050/harranziraat.487490 |
| AMA | Nergis H,Koncagül S,KIRAZ S Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. . 2019; 247 - 253. 10.29050/harranziraat.487490 |
| Vancouver | Nergis H,Koncagül S,KIRAZ S Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. . 2019; 247 - 253. 10.29050/harranziraat.487490 |
| IEEE | Nergis H,Koncagül S,KIRAZ S "Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi." , ss.247 - 253, 2019. 10.29050/harranziraat.487490 |
| ISNAD | Nergis, Hazniye vd. "Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi". (2019), 247-253. https://doi.org/10.29050/harranziraat.487490 |
| APA | Nergis H, Koncagül S, KIRAZ S (2019). Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi, 23(2), 247 - 253. 10.29050/harranziraat.487490 |
| Chicago | Nergis Hazniye,Koncagül Seyrani,KIRAZ SELAHADDIN Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi 23, no.2 (2019): 247 - 253. 10.29050/harranziraat.487490 |
| MLA | Nergis Hazniye,Koncagül Seyrani,KIRAZ SELAHADDIN Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi, vol.23, no.2, 2019, ss.247 - 253. 10.29050/harranziraat.487490 |
| AMA | Nergis H,Koncagül S,KIRAZ S Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi. 2019; 23(2): 247 - 253. 10.29050/harranziraat.487490 |
| Vancouver | Nergis H,Koncagül S,KIRAZ S Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi. Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi. 2019; 23(2): 247 - 253. 10.29050/harranziraat.487490 |
| IEEE | Nergis H,Koncagül S,KIRAZ S "Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi." Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi, 23, ss.247 - 253, 2019. 10.29050/harranziraat.487490 |
| ISNAD | Nergis, Hazniye vd. "Hereford ırkı sığırlarda stearoyl-CoA desaturase (SCD) gen polimorfizmi". Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi 23/2 (2019), 247-253. https://doi.org/10.29050/harranziraat.487490 |
