Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma
Yıl: 2020 Cilt: 54 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 638 - 646 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/mb.69837 İndeks Tarihi: 10-06-2021
Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma
Öz: Maya mantarları, başta Candida türleri olmak üzere yüksek mortalite ve morbidite ile seyreden sağlık hizmeti ile ilişkili kan enfeksiyonlarına neden olmaktadır. Kandidemiler, hastanelerde uzamış yatış süreleri ve artan maliyetlere neden olmaktadır. Hayatı tehdit eden bu kan enfeksiyonlarını başarılı bir şekilde ön-lemek veya tedavi edebilmek için etkenler ile ilgili ulusal epidemiyolojik veriler hazır olmalıdır. Türkiye’de, çok merkezli ulusal kandidemi verisi eksiktir. Bu retrospektif çalışmada, klinisyenlerin erken ve uygun an-tifungal tedavi seçimlerine katkıda bulunabilmek amacıyla, Türkiye’deki altı farklı merkezden 2011-2016 yılları arasındaki veriler toplanarak maya türlerinin dağılımı ve sıklığı analiz edilmiştir. Çalışma kapsamında yer alan tüm laboratuvarlarda izolatların eldesi için otomatize kan kültür sistemleri kullanılmıştır. İzolatla-rın tanımlanması, çalışmada yer alan merkezlerin kendileri tarafından çimlenme borusu testi, mısır unlu tween 80 agar ve kromojenik besiyerindeki görünüm gibi konvansiyonel yöntemlerle gerçekleştirildikten sonra API 20C AUX, API ID 32C veya “matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spect-rophotometry (MALDI-TOF MS)” yöntemleri ile doğrulanmıştır. Sonuçlar, yoğun bakım üniteleri (YBÜ), diğer yatan hasta klinikleri (DYHK) ve toplam tüm klinikler (TK) bazında değerlendirilmiştir. Çalışmada yer alan merkezlerden altı yıllık dönemde, 2.547 maya izolatı elde edilmiştir. Toplam TK verilerine göre, en sık saptanan maya türü Candida albicans (%43.1) olurken, bu türü Candida parapsilosis kompleks (%29.1), Candida glabrata (%10.1), Candida tropicalis (%7.5), Candida krusei (%2.4), Candida kefyr (%1.6) ve di-ğer maya türleri (%6.2) izlemiştir. Candida türlerinin yıllara göre dağılımında, C.parapsilosis kompleks için 2016 yılında gözlenen artış (p= 0.02) dışında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmamıştır. Çalışma süresince, merkezlerin YBÜ’lerinden toplam 1.054 maya izolatı elde edilmiştir. YBÜ’lerde, C.albicans 476 (%45.2) izolat ile ilk sırada yer alırken, C.parapsilosis kompleks (%28.7), C.glabrata (%10.7) ve C.tropicalis(%7.3) bu türü izlemiştir. Çalışmada yer alan altı merkezin DYHK’lerinden elde edilen toplam 1.493 maya izolatı içerisinde 622 (%41.7) izolat ile C.albicans en sık saptanan tür olmuştur. DYHK’lerde sık saptanan diğer türler, YBÜ’lerdeki sonuçlara benzer şekilde C.parapsilosis kompleks (%29.5), C.glabrata (%9.6) ve C.tropicalis (%7.6) olarak belirlenmiştir. Sonuç olarak, Türkiye’nin farklı coğrafi bölgelerinde yer alan altı farklı merkezde C.albicans, halen fungal kan enfeksiyonlarının en sık nedenidir.
Anahtar Kelime: Distribution of Yeast Species Isolated from Blood Cultures for a Six Year Period in Turkey: a Multicentre Study
Öz: Bloodstream infections due to yeast species especially Candida spp. have been reported to be im-portant healthcare associated infections with high mortality and morbidity rates. Candidemia causes prolonged hospital stays as well as increased cost. In order to prevent or treat these life-threatening bloodstream infections successfully, nationwide epidemiological data should be available about the eti-ological agents of these infections. Multi-centre national epidemiological data on yeast bloodstream infections in Turkey is lacking. A retrospective study was designed and data from six different centres in Turkey between 2011 and 2016 years were gathered and analysed for the distribution and frequency of yeast species in order to assist clinicians in their choice of early and appropriate antifungal therapy. All laboratories used automated blood culture systems for the isolation of blood strains. All the participating centres performed the identification of their own isolates by conventional methods using germ tube test, morphology on corn meal agar with tween 80 and chromogenic media and the identification was confirmed by API 20C AUX, API ID 32C or matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrophotometry (MALDI-TOF MS) systems. The analysis of the results was performed on the basis of intensive care units (ICUs), other inpatient clinics (OICs) and totally all clinics (ACs). Totally 2547 yeast isolates were determined from six participating centres during six years. According to the total ACs results, Candida albicans was the most prevalent species (43.1%), followed by Candida parapsilosis com-plex (29.1%), Candida glabrata (10.1%), Candida tropicalis (7.5%), Candida krusei (2.4%) and Candida kefyr (1.6%) and the remaining (6.2%) of them consisted of other yeast species. The distribution of the Candida species did not show statistically significant difference between the years, however the increase of C.parapsilosis complex in 2016 was statistically significant, (p= 0.02). During the study period, total-ly 1054 yeast isolates were obtained from the ICUs of the centres. C.albicans predominated with 476 (45.2%) isolates and C.parapsilosis complex (28.7%), C.glabrata (10.7%) and C.tropicalis (7.3%) were the other leading species in ICUs. Among 1493 isolates of the OICs of six centres participated in the study, C.albicans was the most prevalent species with 622 (41.7%) isolates. The other frequent species of OICs were C.parapsilosis complex (29.5%), C.glabrata (9.6%) and C.tropicalis (7.6%) resembling ICU results. It can be concluded that C.albicans is still the leading cause of bloodstream infections in the six different centres located in various geographical areas of Turkey.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Kısa Bildiri Erişim Türü: Bibliyografik
- 1. Li C, Wang H, Yin M, Han H, Yue JF, Zhang F, et al. The differences in the epidemiology and predictors of death between candidemia acquired in intensive care units and other hospital settings. Intern Med 2015;54(23):3009-16.
- 2. Montagna MT, Lovero G, Borghi E, Amato G, Andreoni S, Campion L, et al. Candidemia in intensive care unit: a nationwide prospective observational survey (GISIA-3 study) and review of the European literature from 2000 through 2013. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2014;18(5):661-74.
- 3. Colombo AL, Guimarães T, Sukienik T, Pasqualotto AC, Andreotti R, Queiroz-Telles F, et al. Prognostic factors and historical trends in the epidemiology of candidemia in critically ill patients: an analysis of five multicenter studies sequentially conducted over a 9-year period. Intensive Care Med 2014;40(10):1489-98.
- 4. Sievert DM, Ricks P, Edwards JR, Schneider A, Patel J, Srinivasan A, et al. Antimicrobial-resistant pathogens associated with healthcare-associated infections: summary of data reported to the National Healthcare Safety Network at the Centers for Disease Control and Prevention, 2009-2010. Infect Control Hosp Epidemiol 2013;34(1):1-14.
- 5. Wisplinghoff H, Bischoff T, Tallent SM, Seifert H, Wenzel RP, Edmond MB. Nosocomial bloodstream infections in US hospitals: analysis of 24,179 cases from a prospective nationwide surveillance study. Clin Infect Dis 2004;39(3):309-17.
- 6. Guinea J. Global trends in the distribution of Candida species causing candidemia. Clin Microbiol Infect 2014;20(Suppl 6):5-10.
- 7. Al-Rawahi GN, Roscoe DL. Ten-year review of candidemia in a Canadian tertiary care centre: Predominance of non-albicans Candida species. Can J Infect Dis Med Microbiol 2013;24(3):e65-8.
- 8. Klingspor L, Tortorano AM, Peman J, Willinger B, Hamal P, Sendid B, et al. Invasive Candida infections in surgical patients in intensive care units: a prospective, multicentre survey initiated by the European Confederation of Medical Mycology (ECMM) (2006-2008). Clin Microbiol Infect 2015;21(1):87.e1-10.
- 9. Orasch C, Marchetti O, Garbino J, Schrenzel J, Zimmerli S, Mühlethaler K, et al. Candida species distribution and antifungal susceptibility testing according to European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing and new vs. old Clinical and Laboratory Standards Institute clinical breakpoints: a 6-year prospective candidaemia survey from the fungal infection network of Switzerland. Clin Microbiol Infect 2014;20(7):698-705.
- 10. Asmundsdottir LR, Erlendsdottir H, Gottfredsson M. Nationwide study of candidemia, antifungal use, and antifungal drug resistance in Iceland, 2000 to 2011. J Clin Microbiol 2013;51(3):841-8.
- 11. Hesstvedt L, Gaustad P, Andersen CT, Haarr E, Hannula R, Haukland HH, et al;. Twenty-two years of candidaemia surveillance: results from a Norwegian national study. Clin Microbiol Infect 2015;21(10):938-45.
- 12. Pfaller M, Neofytos D, Diekema D, Azie N, Meier-Kriesche HU, Quan SP, et al. Epidemiology and outcomes of candidemia in 3648 patients: data from the Prospective Antifungal Therapy (PATH Alliance®) registry, 2004-2008. Diagn Microbiol Infect Dis 2012;74(4):323-31.
- 13. Cleveland AA, Harrison LH, Farley MM, Hollick R, Stein B, Chiller TM, et al. Declining incidence of candidemia and the shifting epidemiology of Candida resistance in two US metropolitan areas, 2008-2013: results from population-based surveillance. PLoS One 2015;10(3):e0120452.
- 14. Tan BH, Chakrabarti A, Li RY, Patel AK, Watcharananan SP, Liu Z, et al. Incidence and species distribution of candidaemia in Asia: a laboratory-based surveillance study. Clin Microbiol Infect 2015;21(10):946-53.
- 15. Alp S, Arikan-Akdagli S, Gulmez D, Ascioglu S, Uzun O, Akova M. Epidemiology of candidaemia in a tertiary care university hospital: 10-year experience with 381 candidaemia episodes between 2001 and 2010. Mycoses 2015;58(8):498-505.
- 16. Kazak E, Akin H, Ener B, Sigirli D, Ozkan O, Gurcuoglu E, et al. An investigation of Candida species isolated from blood cultures during 17 years in a university hospital. Mycoses 2014;57(10):623-9.
- 17. Bakir M, Cerikcioğlu N, Barton R, Yagci A. Epidemiology of candidemia in a Turkish tertiary care hospital. APMIS 2006;114(9):601-10.
- 18. Yapar N, Akan M, Avkan-Oguz V, Ergon MC, Hancer M, Doluca M. Risk factors, incidence and outcome of candidemia in a Turkish intensive care unit: a five-year retrospective cohort study. Anaesth Pain & Intensive Care 2014;18(3):265-71.
- 19. Mesini A, Mikulska M, Giacobbe DR, Del Puente F, Gandolfo N, Codda G, et al. Changing epidemiology of candidaemia: Increase in fluconazole-resistant Candida parapsilosis. Mycoses 2020;63(4):361-8.
- 20. Lortholary O, Renaudat C, Sitbon K, Madec Y, Denoeud-Ndam L, Wolff M, et al. Worrisome trends in incidence and mortality of candidemia in intensive care units (Paris area, 2002-2010). Intensive Care Med 2014;40(9):1303-12.
- 21. Pfaller MA, Messer SA, Moet GJ, Jones RN, Castanheira M. Candida bloodstream infections: comparison of species distribution and resistance to echinocandin and azole antifungal agents in intensive care unit (ICU) and non-ICU settings in the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (2008-2009). Int J Antimicrob Agents 2011;38(1):65-9.
- 22. Eliakim-Raz N, Babaoff R, Yahav D, Yanai S, Shaked H, Bishara J. Epidemiology, microbiology, clinical characteristics, and outcomes of candidemia in internal medicine wards-a retrospective study. Int J Infect Dis 2016;52:49-54.
| APA | Ergon M, Doluca Dereli M, Ener B, Atalay M, KOC A, Çerikçioğlu N, erturan z, aksaray s (2020). Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma. , 638 - 646. 10.5578/mb.69837 |
| Chicago | Ergon Mahmut Cem,Doluca Dereli Mine,Ener Beyza,Atalay Mustafa Altay,KOC A. Nedret,Çerikçioğlu Nilgün,erturan zayre,aksaray sebahat Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma. (2020): 638 - 646. 10.5578/mb.69837 |
| MLA | Ergon Mahmut Cem,Doluca Dereli Mine,Ener Beyza,Atalay Mustafa Altay,KOC A. Nedret,Çerikçioğlu Nilgün,erturan zayre,aksaray sebahat Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma. , 2020, ss.638 - 646. 10.5578/mb.69837 |
| AMA | Ergon M,Doluca Dereli M,Ener B,Atalay M,KOC A,Çerikçioğlu N,erturan z,aksaray s Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma. . 2020; 638 - 646. 10.5578/mb.69837 |
| Vancouver | Ergon M,Doluca Dereli M,Ener B,Atalay M,KOC A,Çerikçioğlu N,erturan z,aksaray s Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma. . 2020; 638 - 646. 10.5578/mb.69837 |
| IEEE | Ergon M,Doluca Dereli M,Ener B,Atalay M,KOC A,Çerikçioğlu N,erturan z,aksaray s "Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma." , ss.638 - 646, 2020. 10.5578/mb.69837 |
| ISNAD | Ergon, Mahmut Cem vd. "Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma". (2020), 638-646. https://doi.org/10.5578/mb.69837 |
| APA | Ergon M, Doluca Dereli M, Ener B, Atalay M, KOC A, Çerikçioğlu N, erturan z, aksaray s (2020). Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma. Mikrobiyoloji Bülteni, 54(4), 638 - 646. 10.5578/mb.69837 |
| Chicago | Ergon Mahmut Cem,Doluca Dereli Mine,Ener Beyza,Atalay Mustafa Altay,KOC A. Nedret,Çerikçioğlu Nilgün,erturan zayre,aksaray sebahat Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma. Mikrobiyoloji Bülteni 54, no.4 (2020): 638 - 646. 10.5578/mb.69837 |
| MLA | Ergon Mahmut Cem,Doluca Dereli Mine,Ener Beyza,Atalay Mustafa Altay,KOC A. Nedret,Çerikçioğlu Nilgün,erturan zayre,aksaray sebahat Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.54, no.4, 2020, ss.638 - 646. 10.5578/mb.69837 |
| AMA | Ergon M,Doluca Dereli M,Ener B,Atalay M,KOC A,Çerikçioğlu N,erturan z,aksaray s Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma. Mikrobiyoloji Bülteni. 2020; 54(4): 638 - 646. 10.5578/mb.69837 |
| Vancouver | Ergon M,Doluca Dereli M,Ener B,Atalay M,KOC A,Çerikçioğlu N,erturan z,aksaray s Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma. Mikrobiyoloji Bülteni. 2020; 54(4): 638 - 646. 10.5578/mb.69837 |
| IEEE | Ergon M,Doluca Dereli M,Ener B,Atalay M,KOC A,Çerikçioğlu N,erturan z,aksaray s "Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma." Mikrobiyoloji Bülteni, 54, ss.638 - 646, 2020. 10.5578/mb.69837 |
| ISNAD | Ergon, Mahmut Cem vd. "Türkiye’de Altı Yıllık Zaman Dilimi İçerisinde Kan Kültürlerinden Soyutlanan Maya Mantarlarının Tür Dağılımı: Çok Merkezli Bir Çalışma". Mikrobiyoloji Bülteni 54/4 (2020), 638-646. https://doi.org/10.5578/mb.69837 |
