Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University

Özbakır, Ömer; SOYUER, Işın; gökahmetoğlu, selma; BOZDAYI, Mithat; YILDIZ, Orhan; AYGEN, Bilgehan; ÖZBAL, Yusuf

Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University

Selma GÖKAHMETOĞLU, (Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Kayseri, Türkiye)

Mithat BOZDAYI, (Ankara Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Gastroenteroloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Ömer ÖZBAKIR, (Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Gastroenteroloji Anabilim Dalı, Kayseri, Türkiye)

Bilgehan AYGEN, (Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, İnfeksiyon Bölümü, Kayseri, Türkiye)

Yusuf ÖZBAL, (Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Kayseri, Türkiye)

Işın SOYUER, (Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Patoloji Anabilim Dalı, Kayseri, Türkiye)

Orhan YILDIZ (Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, İnfeksiyon Bölümü, Kayseri, Türkiye)

Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi

10 0

Yıl: 2007 Cilt: 37 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 35 - 38 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University

Öz:

Hepatit C virusu tüm dünyada kronik karaciğer hastalığının önemli bir etkenidir. Altı HCV genotipi bulunmaktadır. Genotip 1b ile infekte hastalarda ciddi karaciğer hastalığı görülür ve interferon tedavisine yanıt düşüktür. Bu çalışmanın amacı Kayseri'de kronik hepatit C'li hastalarda HCV genotipini araştırmaktır. Kronik hepatit C'li 57 hasta çalışmaya dahil edilmiştir. HCV RNA düzeyi gerçek zamanlı PCR yöntemi ile araştırılmıştır. HCV genotipleri 'Restriction Fragment Length Polymorphism' metodu ile belirlenmiştir. HCV genotiplerinin 55 (%96.5)'i tip 1b, 2 (%3.5)'si tip 1a olarak bulundu. Sonuç olarak Kayseri bölgesinde kronik hepatit C'li hastalarda genotip 1b en sık genotiptir. Bu çalışmanın sonuçları bölgemizdeki kronik hepatit C'li hastaların takip ve tedavisi açısından önemli bilgi sağlamaktadır.

Anahtar Kelime: Kayseri Hepacivirus Genotip Polimeraz zincir reaksiyonu Hepatit C, kronik Hepatit C Hepatit C antikorları

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Viroloji Enfeksiyon Hastalıkları

Erciyes Üniversitesi'nde saptanan Hepatit C virüs genotipleri

Öz:

Hepatitis C virus is an important cause of chronic liver disease worldwide. There has been at least 6 genotypes of HCV and genotype 1b has been associated with more severe liver disease and poor response to therapy. The purpose of this study was to investigate the distribution of HCV genotypes among patients with chronic hepatitis C in Kayseri. Fifty seven patients with chronic hepatitis C were included in this study. HCV RNA viral load were determined by real time PCR method. HCV RNA positive sera were genotyped by restriction fragment length polymorphism method. Type 1b and type 1a were detected in 55 ( 96.5 %) of patients and 2 ( 3.5 %) of the patients respectively. HCV genotype 1b is the predominant genotype in patients with chronic hepatitis C in Kayseri. The results of our study contribute important information to the management and treatment of chronic hepatitis C in our region.

Anahtar Kelime: Hepatitis C, Chronic Hepatitis C Hepatitis C Antibodies Kayseri Hepacivirus Genotype Polymerase Chain Reaction

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Viroloji Enfeksiyon Hastalıkları

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Kiyosawa K, Sodeyama T, Tanaka E, Gibo Y, Yoshizawa K, Nakano Y, et al: Interrelationship of blood transfusion, non-A, non-B hepatitis, and hepatocellular carcinoma: analysis by detection of antibody to hepatitis C virus. Hepatology 1990; 12:671.
2. Lemon MS, Brown EA : Hepatitis C virus. In: Mandell GL, Bennet JE, Dolin R (eds) Mandell, Douglas and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, Fifth Edition, Philadelphia, Churchill Livingstone, 2000; pp 1736.
3. Dusheiko GM, Schmilovitz-Weiss H, Brown D, McOmish F, Yap PL, Sherlock S, et al. Hepatitis C virus genotypes: an investigation of type-specific differences in geographic origin and disease. Hepatology 1994; 19:13.
4. Maggi F, Vatteroni ML, Pistello M, Avio M, Cecconi N, Panicucci F, Bendinelli M. Serological reactivity and viral genotypes in hepatitis C virus infection. J Clin Microbiol 1995;33: 209.
5.Mahaney K, Tedeschi V, Maertens G, Bisceglie AM, Vergalla J, Hoofnagle JH, Sallie R: Genotypic analysis of Hepatitis C virus in American patients. Hepatology 1994; 20:1405.
6. Mcomish F, Yap PL, Dow BC, Follett EAC, Keller AJ, Cobain TJ, et al. Geographical distribution of Hepatitis C virus genotypes in blood donors: an internetional collaborative study. J Clin Microbiol 1994; 32: 884.
7. Yotsuyagani H, Koike K, Yasuda K, Moriya K, Hino K, Kurokowa K, Lino S. Hepatitis C virus genotypes and development of hepatocellular carcinoma. Cancer 1995; 76(8); 1352.
8. Zein NN: Clinical significance of hepatitis C virus genotypes. Clin Microbiol Rev 2000; 13(2): 223.
9. Ray SC, Arthur RR, Carella A, Bukh J, Thomas DL. Genetic epidemiology of Hepatitis C virus throughout Egypt. J Infect Dis 2000; 182: 698.
10. Sönmez E, Taflyaran MA, Kızılkaya N, Korkut H, Tombul Z, Akçam ZC, et al. The distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in 59 HCV infected patients: A multicenter study. Flora 1996; 2: 92.
11. Yarkın F, Hafta A. The distribution of hepatitis C virus genotpes in patients with chronic hepatitis C infection. Vir Hepatit Derg 2000; 3: 164.
12. Takeuchi T, Katsume A, Tanaka T, Abe A, Inoue K, Tsukiyama-Kohara K, et al. Real-time detection system for quantification of hepatitis C virus genome.Gastroenterology 1999; 116(3) 636.
13. Chan SW, Mcomish F, Holmes EC, Dow B, Peutherer JF, Follet E, Yap PL, Simmonds P. Analysis of a new hepatitis C virus type and its phylogenetic relationship to existing variants. J Gen Virol 1992; 73: 1131.
14. Simmonds P, Alberti A, Alter HJ, Bonino F, Bradley DW, Brechot C, et al. A proposed system for the nomenclature of hepatitis C viral genotypes. Hepatology 1994;19(suppl): 1321.
15. Altuğlu İ, Sertöz RY, Özacar T, Erensoy S. HCV genotyping by restriction fragment length polymorfism in diagnostic virology laboratory. Turkish J Molecul Diagn 2005;2: 13.
16. Abacıoğlu YH, Davidson F, Tuncer S, Yap PL, Ustaçelebi fi, Yuluğ N, Simmonds P. The distribution of hepatitis C virus genotypes in Turkish patients. J Viral Hepatitis 1995;2(6): 297.
17. Tuncer S, Özkuyumcu C, Arıkan S, Davidson F, Follett EA, Abacıoğlu YH, Ustaçelebi fi. The relation of serological reactivities with HCV-PCR result and genotypes. Viral Hepatit Derg 1996; (1): 10.
18. Yalçın K, Değertekin, Akkız H. HCV genotypes in HCV related chronic hepatitis in Southeast Anatolia. Turkish Gastroenterol 1999; 10: 249.
19. Kılıç H, Taşkopan H, fiahin i, Köksal F, Utaş C. Hepatitis C virus genotypes in chronic hemodialysis patients. Nephron 2000; 84: 379.
20. Pistello M, Maggi F, Vatteroni L, Cecconi N, Panicucci F, Bresci GP, et al. Prevalance of Hepatitis C virus genotypes in Italy. J Clin Microbiol 1994; 32: 232.
21. Silini B, Bono F, Cividini A, Cerino A, Bruno S, Rossi S, et al. Differantial distribution of hepatitis C virus genotypes in patients with and without liver function abnormalities. Hepatology 1995; 21: 285.

APA	gökahmetoğlu s, BOZDAYI M, Özbakır Ö, AYGEN B, ÖZBAL Y, SOYUER I, YILDIZ O (2007). Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. , 35 - 38.
Chicago	gökahmetoğlu selma,BOZDAYI Mithat,Özbakır Ömer,AYGEN Bilgehan,ÖZBAL Yusuf,SOYUER Işın,YILDIZ Orhan Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. (2007): 35 - 38.
MLA	gökahmetoğlu selma,BOZDAYI Mithat,Özbakır Ömer,AYGEN Bilgehan,ÖZBAL Yusuf,SOYUER Işın,YILDIZ Orhan Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. , 2007, ss.35 - 38.
AMA	gökahmetoğlu s,BOZDAYI M,Özbakır Ö,AYGEN B,ÖZBAL Y,SOYUER I,YILDIZ O Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. . 2007; 35 - 38.
Vancouver	gökahmetoğlu s,BOZDAYI M,Özbakır Ö,AYGEN B,ÖZBAL Y,SOYUER I,YILDIZ O Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. . 2007; 35 - 38.
IEEE	gökahmetoğlu s,BOZDAYI M,Özbakır Ö,AYGEN B,ÖZBAL Y,SOYUER I,YILDIZ O "Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University." , ss.35 - 38, 2007.
ISNAD	gökahmetoğlu, selma vd. "Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University". (2007), 35-38.

APA	gökahmetoğlu s, BOZDAYI M, Özbakır Ö, AYGEN B, ÖZBAL Y, SOYUER I, YILDIZ O (2007). Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 37(1), 35 - 38.
Chicago	gökahmetoğlu selma,BOZDAYI Mithat,Özbakır Ömer,AYGEN Bilgehan,ÖZBAL Yusuf,SOYUER Işın,YILDIZ Orhan Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 37, no.1 (2007): 35 - 38.
MLA	gökahmetoğlu selma,BOZDAYI Mithat,Özbakır Ömer,AYGEN Bilgehan,ÖZBAL Yusuf,SOYUER Işın,YILDIZ Orhan Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, vol.37, no.1, 2007, ss.35 - 38.
AMA	gökahmetoğlu s,BOZDAYI M,Özbakır Ö,AYGEN B,ÖZBAL Y,SOYUER I,YILDIZ O Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2007; 37(1): 35 - 38.
Vancouver	gökahmetoğlu s,BOZDAYI M,Özbakır Ö,AYGEN B,ÖZBAL Y,SOYUER I,YILDIZ O Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2007; 37(1): 35 - 38.
IEEE	gökahmetoğlu s,BOZDAYI M,Özbakır Ö,AYGEN B,ÖZBAL Y,SOYUER I,YILDIZ O "Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University." Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 37, ss.35 - 38, 2007.
ISNAD	gökahmetoğlu, selma vd. "Hepatitis C virus genotypes detected in Erciyes University". Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 37/1 (2007), 35-38.