Yıl: 2010 Cilt: 44 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 647 - 650 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri

Öz:
Hepatit C virusu (HCV), gerek ülkemizde gerekse dünyada hepatit, siroz ve hepatoselüler kanserin önemli bir etkenidir. Altı genotipi ve 50’den fazla alt tipi tanımlanan HCV’nin genotiplendirilmesi, tedavi protokolünün seçilmesi ve klinik sürecin takibinde önem taşımaktadır; zira genotip 1 ile enfekte olgularda tedaviye yanıt ve tedavi başarısı oranı düşük olup tedavi süresi daha uzundur. Bu çalışmada, Zonguldak bölgesindeki kronik hepatit C hastalarında HCV genotip profillerinin saptanması ve bölgemize ait ilk verilerin sunulması amaçlanmıştır. Çalışmaya, Mayıs 2007-Temmuz 2009 tarihleri arasında laboratuvarımızda anti-HCV ve HCV-RNA pozitif olarak saptanan ve retrospektif tarama ile belirlenen kronik hepatit C’li 44 hasta (26 kadın, 18 erkek; yaş aralığı: 29-89 yıl, yaş ortalaması: 60.05 ± 10.81 yıl) dahil edilmiştir. Hastaların alanin aminotransferaz (ALT) düzeyleri 8-160 IU/L arasında (ortalama: 63.99 ± 37.15 IU/L); aspartat aminotransferaz (AST) düzeyleri ise 17-160 IU/L arasında (ortalama: 62.77 ± 36.75 IU/L) değişmektedir. HCV antikor pozitifliği ELISA (Abbott Laboratories, ABD) yöntemi ile, HCV-RNA varlığı ise gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu temelli iki ayrı sistem kullanılarak [Cobas Taqman (Roche Diagnostic, ABD) ve Rotor-Gene 6000 (Corbett Research, ABD)] belirlenmiştir. HCV genotiplendirmesi, ters hibridizasyon temelli bir yöntem olan Versant ® HCV Genotype Assay (LiPA) 2.0 (Bayer Health Care, Belçika) ile yapılmıştır. Genotiplendirme çalışması sonunda; HCV-RNA düzeyi düşük olan 5 (%11.4) hastada genotip belirlenememiş; genotip tayini yapılabilen 39 (%88.6) hastanın 38 (%97.4)’inde genotip 1b, 1 (%2.6) hastada ise genotip 1a tespit edilmiştir. Sonuç olarak, Zonguldak bölgesinden elde edilen bu ilk veriler, ülkemizde yapılan diğer çalışmalar ile uyumlu olarak, en sık rastlanan HCV tipinin genotip 1b olduğunu göstermektedir.
Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Viroloji

Hepatitis C virus genotypes in a province of western black-sea region, Turkey

Öz:
Hepatitis C virus (HCV) is one of the significant causes of hepatitis, cirrhosis and hepatocellular carcinoma all throughout the world. There are six genotypes and more than 50 subtypes of HCV. HCV genotyping is of crucial importance in the determination of the treatment protocols and the follow-up of the clinical course since treatment success is low and the duration of treatment is longer in HCV genotype 1 infected cases. The aim of the present study was to evaluate the HCV genotype profiles of the patients with chronic hepatitis C in Zonguldak, providing the first data about HCV genotypes from wes- tern Black-Sea region, Turkey. The HCV genotypes of 44 patients (26 female, 18 male; age range: 29-89 years, mean age: 60.05 ± 10.81 years) with positive anti-HCV antibody and HCV-RNA results, admitted to the hospital between May 2007 and July 2009, were retrospectively evaluated and included in the study. Alanine aminotransferase (ALT) levels of the patients were between 8-160 IU/L (mean 63.99 ± 37.15 IU/L) and the aspartate aminotransferase (AST) levels were between 17-160 IU/L (mean 62.77 ± 36.75 IU/L). HCV antibody was determined by ELISA method (Abbott Laboratories, USA), and HCV-RNA was determined by two commercial real-time polymerase chain reaction systems [Cobas Taqman (Roche Diagnostic, USA) and Rotor-Gene 6000 (Corbett Research, USA)]. The genotyping was performed by a reverse hybridization based method, Versant®HCV Genotype Assay (LiPA) 2.0 (Bayer Health Care, Belgium). HCV genotypes could not be determined for 5 (11.4%) patients since HCV-RNA levels were low. Genotyping could be performed for 39 (88.6%) patients and 38 (97.4%) had genotype 1b and one (2.6%) patient had genotype 1a. In conclusion, in concordance with the other studies conducted in our country, genotype 1b was found to be the most prevalent genotype in patients from our region.
Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Viroloji
Belge Türü: Makale Makale Türü: Kısa Bildiri Erişim Türü: Bibliyografik
  • 1. Lee CM, Hung CH, Lu SN, Changchien CS. Hepatitis C virus genotypes: clinical relevance and therapeutic implications. Chang Gung Med J 2008; 31: 16-25.
  • 2. Czepiel J, Biesiada G, Mach T. Viral hepatitis C. Pol Arch Med Wewn 2008; 118: 734-40.
  • 3. McOmish F, Yap PL, Dow BC, et al. Geographical distribution of hepatitis C virus genotypes in blood donors: an international collaborative survey. J Clin Microbiol 1994; 32: 884-92.
  • 4. Shepard CW, Finelli L, Alter MJ. Global epidemiology of hepatitis C virus infection. Lancet Infect Dis 2005; 5: 558-67.
  • 5. Bellentani S, Miglioli L, Bedogni G. Epidemiology of hepatitis C virus infection. Minerva Gastroenterol Dietol 2005; 51: 15-29.
  • 6. Abacıoglu YH, Davidson F, Tuncer S, et al. The distribution of hepatitis C virus genotypes in Turkish patients. J Viral Hepat 1995; 2: 297-301.
  • 7. Sönmez E, Taşyaran MA, Kızılkaya N, et al. The distribution of hepatitis C virus (HCV) genotypes in 59 HCV infected patients: a multicenter study. FLORA 1996; 1: 92-5.
  • 8. Yalçın K, Değertekin H, Akkız H. HCV genotypes in HCV related chronic hepatitis in Southeast Anatolia. Turkish J Gastroenterol 1999; 10: 249-52.
  • 9. Yarkın F, Hafta A. Kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virüs (HCV) genotiplerinin dağılımı. Viral Hepatit Derg 2000; 6: 164-8.
  • 10. Bozdayı G, Verdi H, Rota S ve ark. Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. Mikrobiyol Bul 2002; 36: 291-304.
  • 11. Bozdayi AM, Aslan N, Bozdayi G, Turkyilmaz AR, et al. Molecular epidemiology of hepatitis B, C and D viruses in Turkish patients. Arch Virol 2004; 149: 2115-29.
  • 12. Çil T, Özekinci T, Göral V, Altıntaş A. Güneydoğu Anadolu Bölgesi’nde hepatit C virüsü genotipleri. Türkiye Klinikleri J Med Sci 2007; 27: 496-500.
  • 13. Ural O, Arslan U, Fındık D. Konya bölgesinde hepatit C virusu genotip dağılımı. İnfeksiyon Derg 2007; 21: 175-81.
  • 14. Verbeeck J, Stanley MJ, Shieh J, et al. Evaluation of Versant Hepatitis C Virus Genotype Assay (LiPA) 2.0. J Clin Microbiol 2008; 46: 1901-6.
  • 15. Nadarajah R, Khan GY, Miller AS. Evaluation of a new-generation line-probe assay that detects 5' untranslated and core regions to genotype and subtype hepatitis C Virus. Am J Clin Pathol 2007; 128: 300-4.
APA AKTAŞ E, ÖGEDEY E, KÜLAH C, CÖMERT B (2010). Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri. , 647 - 650.
Chicago AKTAŞ Elif,ÖGEDEY Esra Deniz,KÜLAH Canan,CÖMERT BEĞENDİK Füsun Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri. (2010): 647 - 650.
MLA AKTAŞ Elif,ÖGEDEY Esra Deniz,KÜLAH Canan,CÖMERT BEĞENDİK Füsun Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri. , 2010, ss.647 - 650.
AMA AKTAŞ E,ÖGEDEY E,KÜLAH C,CÖMERT B Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri. . 2010; 647 - 650.
Vancouver AKTAŞ E,ÖGEDEY E,KÜLAH C,CÖMERT B Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri. . 2010; 647 - 650.
IEEE AKTAŞ E,ÖGEDEY E,KÜLAH C,CÖMERT B "Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri." , ss.647 - 650, 2010.
ISNAD AKTAŞ, Elif vd. "Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri". (2010), 647-650.
APA AKTAŞ E, ÖGEDEY E, KÜLAH C, CÖMERT B (2010). Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri. Mikrobiyoloji Bülteni, 44(4), 647 - 650.
Chicago AKTAŞ Elif,ÖGEDEY Esra Deniz,KÜLAH Canan,CÖMERT BEĞENDİK Füsun Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri. Mikrobiyoloji Bülteni 44, no.4 (2010): 647 - 650.
MLA AKTAŞ Elif,ÖGEDEY Esra Deniz,KÜLAH Canan,CÖMERT BEĞENDİK Füsun Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.44, no.4, 2010, ss.647 - 650.
AMA AKTAŞ E,ÖGEDEY E,KÜLAH C,CÖMERT B Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri. Mikrobiyoloji Bülteni. 2010; 44(4): 647 - 650.
Vancouver AKTAŞ E,ÖGEDEY E,KÜLAH C,CÖMERT B Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri. Mikrobiyoloji Bülteni. 2010; 44(4): 647 - 650.
IEEE AKTAŞ E,ÖGEDEY E,KÜLAH C,CÖMERT B "Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri." Mikrobiyoloji Bülteni, 44, ss.647 - 650, 2010.
ISNAD AKTAŞ, Elif vd. "Zonguldak bölgesinde hepatit C virusu genotipleri". Mikrobiyoloji Bülteni 44/4 (2010), 647-650.