Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi

Giriş: Kan kültürü bakteriyemi ve fungeminin tanısında altın standart yöntemdir. Bakteriyemi ve fungemili hastalarda patojenin hızlı tanımlanması ve antimikrobiyal duyarlılığının belirlenmesi tedavi ve prognozda büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmanın amacı, Akdeniz Üniversitesi Hastanesi Merkez Laboratuvarında kan kültürü şişelerinde pozitif sinyal veren izolatları değerlendirmek ve pozitiflik zamanlarını karşılaştırmaktır. Materyal ve Metod: Bu çalışmaya Akdeniz Üniversitesi Hastanesi Merkez Laboratuvarına Şubat 2020 ve Ekim 2020 tarihleri arasında gelen toplam 6167 kan kültürü şişesi dahil edilmiştir. Kan kültürü şişeleri BD BACTEC™ FX (Becton Dickinson, ABD) otomatize sisteminde takip edilmiştir. Cihazda pozitif sinyal veren tüm şişelerin aerobik ve anaerobik kültürleri yapıldı, elde edilen koloniler MALDI-TOF MS (Bruker Daltonics, Almanya) ile tanımlandı. Çalışmada ayrıca, metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) ile metisiline duyarlı Staphylococcus aureus (MSSA), karbapenemaz üreten ve karbapenemaz üretmeyen Enterobacterales, geniş spektrumlu beta-laktamaz (ESBL) üreten ve üretmeyen Enterobacterales; vankomisine dirençli (VRE) ve vankomisine duyarlı enterokok (VSE) izolatları ve Candida türleri arasında kan kültürü şişelerinin pozitiflik zamanları karşılaştırılmıştır. Bulgular: Kan kültürlerinin %20.6’sı pozitif sinyal verdi ve bunların %13.6’sı patojen olarak kabul edilirken, %5.8’i kontaminasyon olarak tanımlandı. En sık izole edilen ajanlar gram-pozitif koklardı (%51.3). Daha sonra sırasıyla Enterobacterales üyeleri (%21,5), nonfermentatif gram-negatif basiller (%13.6) ve mayalar (%10.6) izole edildi. Örneklerin pozitiflik zamanı 2-113 saat arasında değişmekteydi. Enterococcus türleri, Staphylococcus aureus, Klebsiella türleri, Escherichia coli, Acinetobacter türleri, Pseudomonas türleri ve Candida albicans için ortalama pozitif sinyalleşme süreleri, sırasıyla, 15.1 ± 11.5, 15.9 ± 15.0, 14.2 ± 13.0, 12.1 ± 9.9, 11.7 ± 7.2, 16.8 ± 10.2, 32.1 ± 18.6 saatti. Etken patojenlerin %40.8’i ilk 12 saatte, %82.3’ü ilk 24 saatte ve %96.2’si 48 saat içinde pozitif sinyal verdi. Etken patojenlerin pozitiflik süresi (17.9 ± 13.8 saat) kontaminasyonlardan (30.4 ± 19.3 saat) daha düşüktü. Bu fark istatistiksel olarak anlamlıydı (p< 0.05). Ortalama pozitiflik zamanı, karbapenemaz üreten Enterobacterales için 12.3 ± 7.4 saat, karbapenemaz üretmeyen Enterobacterales için 12.4 ± 11.6 saat (p= 0.942); MRSA’lar için 14.8 ± 8.6 saat, MSSA’lar için 16.5 ± 17.2 saat (p= 0.657); ESBL üreten Enterobacterales türleri için 11.7 ± 8.9 saat, ESBL üretmeyenler için 13.7 ± 11.9 saat (p= 0.443); VRE’ler için 18.2 ± 11.4 saat, VSE’ler için ise 14.2 ± 11.6 saat (p= 0.155) bulunmuştur. Sonuç: Pozitif sinyal veren kan kültürlerinde en sık izole edilen faktörler gram-pozitif koklar, Enterobacterales üyeleri, nonfermentatif gram-negatif basiller ve mayalardır. Sonuçlarımız, kan kültürü şişelerinin pozitif sinyal süresinin, kontaminasyon olarak kabul edilen ajanlar ile patojen ajanları ayırt etmede önemli bir rol oynayabileceğini, ancak pozitiflik süresinin izolatların direnç profili ile ilgili olmadığını göstermiştir.

Anahtar Kelime:

Evaluation of Positivity Times of Isolates Growing in Blood Cultures

Öz:

Introduction: Blood culture is the gold standard method in the diagnosis of bacteremia and fungemia. Rapid identification of the pathogen and determination of its antimicrobial susceptibility have great importance in treatment and prognosis in patients with bacteremia and fungemia. The aim of this study was to evaluate the isolates that have positive signals in blood culture bottles and to compare the positivity times in Central Laboratory of Akdeniz University Hospital. Materials and Methods: A total 6167 of blood culture bottles that came to Central Laboratory of Akdeniz University Hospital between 2020 February and October were included in this study. The blood culture bottles were monitored on the BD BACTEC™ FX automated system (Becton Dickinson, USA). All machine signal positive bottles were sub-cultured on aerobic and anaerobic media and the resulted colonies were identified by MALDI-TOF MS (Bruker Daltonics, Germany). The study also compared the positivity times of blood culture bottles in which methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) versus methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (MSSA), carbapenemase- producing versus non-carbapenemase-producing Enterobacterales, extended-spectrum beta-lactamases Enterobacterales (ESBL) producing and not producing; vancomycin-resistant (VRE) versus vancomycin-susceptible enterococci (VSE) isolates and among Candida species. Results: Of the blood cultures 20.6% yielded positive signals and 13.6% of them were accepted as pathogens, while 5.8% were identified as contaminants. The most commonly isolated agents were Gram-positive cocci (51.3%). Then, Enterobacterales members (21.5%), nonfermentative gram-negative bacilli (13.6%) and yeasts (10.6%) were, respectively, isolated. The positivity times ranged from 2-113 hours. The average durations of signaling positive were 15.1 ± 11.5, 15.9 ± 15.0, 14.2 ± 13.0, 12.1 ± 9.9, 11.7 ± 7.2, 16.8 ± 10.2, 32.1 ± 18.6 hours for Enterococcus species, Staphylococcus aureus, Klebsiella species, Escherichia coli, Acinetobacter species, Pseudomonas species, and Candida albicans, respectively. 40.8% of the causative pathogens gave positive signals in the first 12 hours, 82.3% in the first 24 hours and 96.2 % within 48 hours. The positivity time of causative pathogens (17.9 ± 13.8 hours) were lower than contaminations (30.4 ± 19.3 hours). This difference was statistically significant (p< 0.05). Mean positivity times were found as 12.3 ± 7.4 hours for carbapenemase-producing Enterobacterales, 12.4 ± 11.6 hours for non-carbapenemase-producing Enterobacterales (p= 0.942); 14.8 ± 8.6 hours for MRSAs, 16.5 ± 17.2 hours for MSSAs (p= 0.657); 11.7 ± 8.9 hours for ESBLproducing Enterobacterales species, 13.7 ± 11.9 hours (p= 0.443) for non-ESBL-producing species, 18.2 ± 11.4 hours for VREs, and 14.2 ± 11.6 hours (p= 0.155) for VSEs. Conclusion: The most commonly isolated factors in positive-signaling blood cultures are gram-positive cocci, Enterobacterales members, nonfermentative gram-negative bacilli, and yeasts. Our results showed that the positive signal duration of blood culture bottles can be an important role in distinguishing between the agents considered as contamination and pathogenic agents, but, the positivity time are not related to the resistance profile of the isolates.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Öztürk Engin D, Aslan T, Alpay Y, Evren E, Şenbayrak S, Karahan G (Çev). Bölüm 2 Mikrobiyolojiye Giriş Kısım ‖: Örneklerin Alınması, Taşınması, İşlenmesi, Analizi ve Kültürlerin Raporlanması, pp:66-110. In:Procop GW, Church DL, Hall GS, Janda WM, Koneman EW, Schreckenkenberger PC, Woods GL (eds). Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology, 2017, 7th ed. Wolters Kluwer Health, Philadelphia.
2. Lodise TP, McKinnon PS, Swiderski L, Rybak MJ. Outcomes analysis of delayed antibiotic treatment for hospital-acquired Staphylococcus aureus bacteremia. Clin Infect Dis 2003;36(11):1418-23. https://doi.org/10.1086/375057
3. Lamy B, Sundqvist M, Idelevich EA; ESCMID Study Group for Bloodstream Infections, Endocarditis and Sepsis (ESGBIES). Bloodstream infections - Standard and progress in pathogen diagnostics. Clin Microbiol Infect 2020;26(2):142- 50. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.11.017
4. Siméon S, Le Moing V, Tubiana S, Duval X, Fournier D, Lavigne JP, et al. VIRSTA/AEPEI Study Group. Time to blood culture positivity: An independent predictor of infective endocarditis and mortality in patients with Staphylococcus aureus bacteraemia. Clin Microbiol Infect 2019;25(4):481- 8. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2018.07.015
5. Raad I, Hanna HA, Alakech B, Chatzinikolaou I, Johnson MM, Tarrand J. Differential time to positivity: A useful method for diagnosing catheter-related bloodstream infections. Ann Intern Med 2004;140(1):18-25. https://doi. org/10.7326/0003-4819-140-1-200401060-00007
6. Lamy B. Blood culture time-to-positivity: Making use of the hidden information. Clin Microbiol Infect 2019;25(3):268- 71. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2018.12.001
7. Marra AR, Edmond MB, Forbes BA, Wenzel RP, Bearman GM. Time to blood culture positivity as a predictor of clinical outcome of Staphylococcus aureus bloodstream infection. J Clin Microbiol 2006;44(4):1342-6. https://doi. org/10.1128/JCM.44.4.1342-1346.2006
8. Khatib R, Riederer K, Saeed S, Johnson LB, Fakih MG, Sharma M, et al. Time to positivity in Staphylococcus aureus bacteremia: Possible correlation with the source and outcome of infection. Clin Infect Dis 2005;41(5):594-8. https://doi. org/10.1086/432472
9. Kim J, Gregson DB, Ross T, Laupland KB. Time to blood culture positivity in Staphylococcus aureus bacteremia: Association with 30-day mortality. J Infect 2010;61(3):197-204. https://doi.org/10.1016/j.jinf.2010.06.001
10. Baysallar M, Erensoy MS, Esen B, Fındık D, Zarakolu Köşker IP, Levent B ve ark. Tıbbi Mikrobiyoloji Uzmanları İçin Klinik Örnekten Sonuç Raporuna Uygulama Rehberi-Kan Dolaşımı Örnekleri. 2017. Ankara: Çağhan Ofset.
11. Leber A. Blood Cultures, In: Leber AL (eds), Clinical Microbiology Procedures Handbook. 2016, 4th ed. ASM Press, Washington, DC. pp: 3.4.1.1-3.4.2.6.
12. CLSI. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. 31st ed. CLSI supplement M100. Clinical and Laboratory Standarts Institute; 2021.
13. Diekema DJ, Hsueh PR, Mendes RE, Pfaller MA, Rolston KV, Sader HS, et al. The microbiology of bloodstream ınfection: 20-Year trends from the SENTRY antimicrobial surveillance program. Antimicrob Agents Chemother 2019;63(7):e00355-19. https://doi.org/10.1128/ AAC.00355-19
14. Ece G. The evaluation of the distribution and antimicrobial susceptibility profile of the strains ısolated from blood cultures. Med Bull Haseki 2013;51:151-6 https://doi. org/10.4274/Haseki.1044
15. Erbay A, Sayılır K, Çolpan A, Akıncı E, Balaban N, Bodur H. Kan kültürlerinde üreme saptanan 380 olgunun değerlendirilmesi. Klimik Dergisi 2003;16(1):25-30
16. Sevim S, Öztürk Ş, Coşkuner A, Özgenç O, Avcı M. Bactec kan kültür sistemi ile izole edilen mikroorganizmaların değerlendirilmesi. İnfeksiyon Derg 2007;21(3):135-40
17. Durmaz G, Us T, Aydinli A, Kiremitci A, Kiraz N, Akgün Y. Optimum detection times for bacteria and yeast species with the BACTEC 9120 aerobic blood culture system: Evaluation for a 5-year period in a Turkish university hospital. J Clin Microbiol 2003;41(2):819-21. https://doi.org/10.1128/ JCM.41.2.819-821.2003
18. Yıldız S. Bactec Plus Aerobic / F ve Bactec Plus Anaer-obic/ F Otomatize Erişkin Kan Kültür Şişelerindeki İzolatla-rın Üremelerinin ve Üreme Zamanlarının Karşılaştırılmas (ıtez). Eskişehir:Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi, 2017.
19. Puerta-Alcalde P, Cardozo C, Suárez-Lledó M, Rodríguez- Núñez O, Morata L, Fehér C, et al. Current time-to-positivity of blood cultures in febrile neutropenia: a tool to be used in stewardship de-escalation strategies. Clin Microbiol Infect 2019;25(4):447-53. https://doi.org/10.1016/j. cmi.2018.07.026
20. Balıkçı A, Belas Z, Eren Topkaya A. Blood culture positivity: Is it pathogen or contaminant? Mikrobiyol Bul 2013;47(1):135-40. https://doi.org/10.5578/mb.4181
21. Lefebvre CE, Renaud C, Chartrand C. Time to positivity of blood cultures in ınfants 0 to 90 days old presenting to the emergency department: Is 36 hours enough? J Pediatric Infect Dis Soc 2017;6(1):28-32. https://doi.org/10.1093/ jpids/piv078
22. Gopi A, Ravikumar KL, Ambarish MG, Shwethalatha NN, Keerthi Shree S, Ashwini KV at al.Time to Positivity of microorganisms with BACTEC 9050: An 18-month study among children of 28 days to 60 months in an South Indian Tertiary Hospital Intl J. Microbiol Res 2011;2(1):12-7.
23. Lai CC, Wang CY, Liu WL, Huang YT, Hsueh PR. Time to positivity of blood cultures of different Candida species causing fungaemia. J Med Microbiol 2012;61(5):701-4. https:// doi.org/10.1099/jmm.0.038166-0
24. Ben-Ami R, Weinberger M, Orni-Wasserlauff R, Schwartz D, Itzhaki A, Lazarovitch T, et al. Time to blood culture positivity as a marker for catheter-related candidemia. J Clin Microbiol 2008;46(7):2222-6. https://doi.org/10.1128/ JCM.00214-08
25. Cobos-Trigueros N, Kaasch AJ, Soriano A, Torres JL, Vergara A, Morata L, et al. Time to positivity and detection of growth in anaerobic blood culture vials predict the presence of Candida glabrata in candidemia: A two-center European cohort study. J Clin Microbiol 2014;52(8):3082-4. https:// doi.org/10.1128/JCM.01198-14
26. Naber CK. Staphylococcus aureus bacteremia: Epidemiology, pathophysiology, and management strategies. Clin Infect Dis 2009;48(4):S231-7. https://doi. org/10.1086/598189
27. Álvarez R, Viñas-Castillo L, Lepe-Jiménez JA, García-Cabrera E, Cisneros-Herreros JM. Time to positivity of blood culture association with clinical presentation, prognosis and ESBL-production in Escherichia coli bacteremia. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2012;31(9):2191-5. https://doi. org/10.1007/s10096-012-1554-5

APA	Karpuz T, YAZISIZ H, KOYUNCU OZYURT O, Çetinkaya Ö, Ozhak B, Ongut G, Çolak D, Ogunc D (2022). Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi. , 218 - 226. 10.5578/flora.20229805
Chicago	Karpuz Tuncer,YAZISIZ HATİCE,KOYUNCU OZYURT OZLEM,Çetinkaya Özgül,Ozhak Betil,Ongut Gozde,Çolak Dilek,Ogunc Dilara Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi. (2022): 218 - 226. 10.5578/flora.20229805
MLA	Karpuz Tuncer,YAZISIZ HATİCE,KOYUNCU OZYURT OZLEM,Çetinkaya Özgül,Ozhak Betil,Ongut Gozde,Çolak Dilek,Ogunc Dilara Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi. , 2022, ss.218 - 226. 10.5578/flora.20229805
AMA	Karpuz T,YAZISIZ H,KOYUNCU OZYURT O,Çetinkaya Ö,Ozhak B,Ongut G,Çolak D,Ogunc D Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi. . 2022; 218 - 226. 10.5578/flora.20229805
Vancouver	Karpuz T,YAZISIZ H,KOYUNCU OZYURT O,Çetinkaya Ö,Ozhak B,Ongut G,Çolak D,Ogunc D Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi. . 2022; 218 - 226. 10.5578/flora.20229805
IEEE	Karpuz T,YAZISIZ H,KOYUNCU OZYURT O,Çetinkaya Ö,Ozhak B,Ongut G,Çolak D,Ogunc D "Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi." , ss.218 - 226, 2022. 10.5578/flora.20229805
ISNAD	Karpuz, Tuncer vd. "Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi". (2022), 218-226. https://doi.org/10.5578/flora.20229805

APA	Karpuz T, YAZISIZ H, KOYUNCU OZYURT O, Çetinkaya Ö, Ozhak B, Ongut G, Çolak D, Ogunc D (2022). Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 27(2), 218 - 226. 10.5578/flora.20229805
Chicago	Karpuz Tuncer,YAZISIZ HATİCE,KOYUNCU OZYURT OZLEM,Çetinkaya Özgül,Ozhak Betil,Ongut Gozde,Çolak Dilek,Ogunc Dilara Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 27, no.2 (2022): 218 - 226. 10.5578/flora.20229805
MLA	Karpuz Tuncer,YAZISIZ HATİCE,KOYUNCU OZYURT OZLEM,Çetinkaya Özgül,Ozhak Betil,Ongut Gozde,Çolak Dilek,Ogunc Dilara Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, vol.27, no.2, 2022, ss.218 - 226. 10.5578/flora.20229805
AMA	Karpuz T,YAZISIZ H,KOYUNCU OZYURT O,Çetinkaya Ö,Ozhak B,Ongut G,Çolak D,Ogunc D Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2022; 27(2): 218 - 226. 10.5578/flora.20229805
Vancouver	Karpuz T,YAZISIZ H,KOYUNCU OZYURT O,Çetinkaya Ö,Ozhak B,Ongut G,Çolak D,Ogunc D Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2022; 27(2): 218 - 226. 10.5578/flora.20229805
IEEE	Karpuz T,YAZISIZ H,KOYUNCU OZYURT O,Çetinkaya Ö,Ozhak B,Ongut G,Çolak D,Ogunc D "Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi." Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 27, ss.218 - 226, 2022. 10.5578/flora.20229805
ISNAD	Karpuz, Tuncer vd. "Kan Kültürlerinde Üreyen İzolatların Pozitiflik Zamanlarının Değerlendirilmesi". Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 27/2 (2022), 218-226. https://doi.org/10.5578/flora.20229805