Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması

Gumus, Hatice Hale; YARKIN, Fügen

doi:10.5798/dicletip.1086358

Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması

Hatice Hale GÜMÜŞ, (Başkent Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Doktor Turgut Noyan Uygulama ve Araştırma Merkezi, Adana, Türkiye)

Fügen YARKIN (Çukurova Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Adana, Türkiye)

Dicle Tıp Dergisi

1 0

Yıl: 2022 Cilt: 49 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 176 - 186 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5798/dicletip.1086358 İndeks Tarihi: 21-09-2022

Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması

Öz:

Amaç: Respiratory syncytial virus (RSV) bütün dünyada infant ve çocuklarda yüksek mortalite ve morbidite ile seyreden alt solunum yolu enfeksiyonlarının majör sebebidir. Bu çalışmada amacımız hastanede yatan ve alt solunum yolu enfeksiyonu olan infant ve çocuklarda RSV enfeksiyonlarınıninsidansının araştırmak ve tanı yöntemi olarak direkt immunfloresan test ile ters transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu (Reverse Transcription Polymerase Chain Recation; RT-PCR) testlerini karşılaştırmaktır. Yöntemler: Çalışmaya Ocak 2011 ve Ocak 2012 tarihleri arasında alt solunum yolu enfeksiyonu olup hastaneye yatırılan toplam 323 hastayı (0-15 yaş) dahil ettik. Floklueküvyon (Copan Diagnostics, Italy) ile alınan nazofaringeal sürüntü örneklerinde RSV antijenini direkt immunfloresan test (Argene SA, France) ile, RSV RNA varlığını ise in-housenested RT PCR yöntemi ile araştırdık. Bulgular: Toplam 323 örneğin 95’inde (%29,4) RT-PCR ile RSV RNA, 88’inde (%27,6) ise direkt immunfloresan test yöntemi ile RSV antijen pozitifliği tespit ettik. Örneklerin 80’inini (%25) her iki yöntem ile pozitif, 220’sini (%68) ise her iki yöntem ile negatif bulduk. RT-PCR testine göre kıyasladığımızda direkt immunfloresan testinin sensitivitesini %84,2, spesifitesini %96,5, pozitif prediktif değerini %91 ve negatif prediktif değerini %93,6 bulduk. Sonuç: Çalışma grubunda RSV enfeksiyonlarının insidansının (%29,4) oldukça yüksek olduğunu tespit ettik. Sonuç olarak antiviral tedavinin erken başlanması ve nozokomiyal yayılımın azaltılması için %84 gibi yüksek sensitivite gösteren, daha hızlı bir test (2.5 saate karşılık 12 saat) olan direkt immunfloresan testinin ilk tanı testi olarak kullanılmasını ve test sonucu negatif bulunan örneklerin RT-PCR ile çalışılmasını öneriyoruz.

Anahtar Kelime:

The Investigation of Respiratory syncytial virus (RSV) Infection Incidence in Children with Lower Respiratory Tract Infection

Öz:

Objective: Respiratory syncytial virus (RSV) is a leading cause of lower respiratory tract infections in infants and children worldwide. In this study, our aim is to investigate the incidence of RSV infections in hospitalized infants and children with lower respiratory tract infections, and to compare direct immunofluorescence test and reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) tests as a diagnostic method. Methods: We conducted the study with a total of 323 patients (0-15 years old) hospitalized with lower respiratory tract infections between January 2011 and January 2012. We investigated the RSV antigen by direct immunofluorescence test (Argene SA, France), and the presence of RSV RNA by in-house nested RT-PCR method in nasopharyngeal swab samples taken with a flocked swab (Copan Diagnostics, Italy). Results: We detected RSV RNA positivity in 95 (29.4%) of 323 samples by RT-PCR, and RSV antigen positivity in 88 (27.6%) samples by direct immunofluorescence test method. We found that 80 (25%) of the samples were positive, and 220 (68%) were negative with both diagnostic methods. We found that the direct immunofluorescence test had a sensitivity of 84.2%, a specificity 96.5%, a positive predictive value 91%, and a negative predictive value 93.6% when compared to the RT-PCR test. Conclusion: We found that the incidence of RSV infections (29.4%) in the study group was quite high. We recommend that the direct immunofluorescence test, which is a faster test (2.5 hours vs 12 hours) with a high sensitivity of 84%, should be used as the first diagnostic test for early initiation of antiviral treatment and reduction of nosocomial spread, and the samples with negative results should be studied by RT-PCR.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Shi T, McAllister DA, O'Brien KL, et al. RSV Global Epidemiology Network. Global, regional, and national disease burden estimates of acute lower respiratory infections due to respiratory syncytial virus in young children in 2015: a systematic review and modelling study. Lancet. 2017; 390: 946-58.
2. The World Health Organization. Avalaible at: https://cdn.who.int/media/docs/default source/biologicals/vaccine standardization/respiratory-syncytial-virus-(rsv)- vaccines/annex_2_rsv_vaccines_trs_1024.pdf?sfvrs n=5d7aefa7_3&download=true) (Accessed date: October 5, 2021).
3. TC Hükümeti-UNICEF 2001-2005 İşbirliği Programı. Türkiye'de çocuk ve kadınların durumu raporu. 2000; 103-85.
4. Rima B, Collins P, Easton A, et al. ICTV Virus Taxonomy Profile: Pneumoviridae. J Gen Virol. 2017; 98: 2912-13.
5. Nair H, Nokes DJ, Gessner BD, et al. Global Burden of Acute Lower Respiratory Infections due to Respiratory Syncytial Virus in Young Children: a Systematic Review and Meta-analysis. Lancet. 2010; 375(9725): 1545-55.
6. Ohuma EO, Okiro EA, Ochola R, et al. The natural history of respiratory syncytial virus in a birth cohort: the influence of age and previous infection on reinfection and disease. Am J Epidemiol. 2012; 176: 794-802.
7. The World Health Organization. WHO Strategy for Global Respiratory Syncytial Virus Surveillance Project Based On The Influenza Platform. Avalaible at: https://cdn.who.int/media/docs/default source/influenza/rsv-surveillance/who-rsv surveillance-strategy-phase-26mar2021.- final.pdf?sfvrsn=d8b1c36a_9 (Accessed date: October 5, 2021).
8. Suleiman-Martos N, Caballero-Vázquez A, Gómez Urquiza JL, et al. Prevalence and Risk Factors of Respiratory Syncytial Virus in Children under 5 Years of Age in the WHO European Region: A Systematic Review and Meta-Analysis. J Pers Med. 2021; 11: 416.
9. Zylbersztejn A, Pembrey L, Goldstein H, et al. Respiratory syncytial virus in young children: community cohort study integrating serological surveys, questionnaire and electronic health records, Born in Bradford cohort, England, 2008 to 2013. Euro Surveill. 2021; 26: 2000023.
10. Tong S, Amand C, Kieffer A, et al. Incidence of respiratory syncytial virus related health care utilization in the United States. J Glob Health. 2020; 10: 020422.
11. Nascimento-Carvalho AC, Vilas-Boas AL, Fontoura MSH, et al. PNEUMOPAC-E_cacy Study Group. Respiratory viruses among children with non-severe community-acquired pneumonia: A prospective cohort study. J Clin Virol. 2018; 105: 77- 83.
12. Da Silva Mesquita F, de Oliveira DBL, Crema D, et al. Rapid antigen detection test for respiratory syncytial virus diagnosis as a diagnostic tool. J Pediatr. 2017; 93: 246-52.
13. Yassine HM, Sohail MU, Younes N, et al. Systematic Review of the Respiratory Syncytial Virus (RSV) Prevalence, Genotype Distribution, and Seasonality in Children from the Middle East and North Africa (MENA) Region. Microorganisms. 2020; 8: 713.
14. Ching NS, Kotsanas D, Easton ML, et al. Respiratory virus detection and co-infection in children and adults in a large Australian hospital in 2009–2015. J Paediatr Child Health. 2018; 54: 1321- 28.
15. Alan S, Erdeve O, Cakir U, et al. The TurkNICU RSV Trial Group (2016) Outcome of the Respiratory Syncytial Virus related acute lower respiratory tract infection among hospitalized newborns: a prospective multicenter study. J Matern Fetal Neonatal Med. 2016; 13: 2186-193.
16. Sağlık İ, Mutlu D, Öngüt G, et al. Çocuklarda Respiratuvar Sinsityal Virüs (RSV) Enfeksiyonlarının Tanısında Hücre Kültürü ve Direkt Floresan Antikor Testi Yöntemlerinin Karşılaştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2015; 45: 22-9.
17. Şık G, Demirbuğa A, Annayev A, et al. Çocuk Yoğun Bakım Ünitesinde Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Tanısıyla Yatan Hastalarda Viral Patojen Sıklığı ve Hastaların Klinik Özellikleri. J Pediatr Inf. 2020; 14: 27-32.
18. Pelit S, Bayraktar B, Bulut ME, et al. Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuk Hastalarda Viral Etkenlerin İmmunofluoresan ve İmmunokromatografik Yöntemler ile Araştırılması. Şişli Etfal Hastanesi Tıp Bülteni. 2015: 49: 118-21.
19. Koyuncu E, Arı ME, Yoldaş T, et al. Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Nedeni ile Hastaneye Yatırılan İki Yaş Altı Çocuklarda RSV Enfeksiyonu Sıklığı ve Risk Faktörleri. Mustafa Kemal Üniv Tıp Derg. 2017; 8: 1- 9.
20. Karakoyun M, Ataoğlu EA, Büyükkayhan D, et al. Solunum Yolu Enfeksiyonu Bulguları ile Başvuran 2 Yaş Altı Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus Enfeksiyonlarının Sıklığı ve Klinik Özellikleri. Türk Sağlık Bilimleri Dergisi. 2018; 3: 56-69.
21. Zimmermann P, Curtis Nigel. Coronavirus Infections in Children Including COVID-19. Pediatr Infect Dis J. 2020; 39: 355-68.
22. Kurt NG, Çamcı M. COVID-19 and Other Viral Pneumonias. Dicle Med J. 2021; 48: 40-6.

APA	Gumus H, YARKIN F (2022). Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması. , 176 - 186. 10.5798/dicletip.1086358
Chicago	Gumus Hatice Hale,YARKIN Fügen Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması. (2022): 176 - 186. 10.5798/dicletip.1086358
MLA	Gumus Hatice Hale,YARKIN Fügen Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması. , 2022, ss.176 - 186. 10.5798/dicletip.1086358
AMA	Gumus H,YARKIN F Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması. . 2022; 176 - 186. 10.5798/dicletip.1086358
Vancouver	Gumus H,YARKIN F Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması. . 2022; 176 - 186. 10.5798/dicletip.1086358
IEEE	Gumus H,YARKIN F "Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması." , ss.176 - 186, 2022. 10.5798/dicletip.1086358
ISNAD	Gumus, Hatice Hale - YARKIN, Fügen. "Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması". (2022), 176-186. https://doi.org/10.5798/dicletip.1086358

APA	Gumus H, YARKIN F (2022). Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması. Dicle Tıp Dergisi, 49(1), 176 - 186. 10.5798/dicletip.1086358
Chicago	Gumus Hatice Hale,YARKIN Fügen Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması. Dicle Tıp Dergisi 49, no.1 (2022): 176 - 186. 10.5798/dicletip.1086358
MLA	Gumus Hatice Hale,YARKIN Fügen Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması. Dicle Tıp Dergisi, vol.49, no.1, 2022, ss.176 - 186. 10.5798/dicletip.1086358
AMA	Gumus H,YARKIN F Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması. Dicle Tıp Dergisi. 2022; 49(1): 176 - 186. 10.5798/dicletip.1086358
Vancouver	Gumus H,YARKIN F Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması. Dicle Tıp Dergisi. 2022; 49(1): 176 - 186. 10.5798/dicletip.1086358
IEEE	Gumus H,YARKIN F "Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması." Dicle Tıp Dergisi, 49, ss.176 - 186, 2022. 10.5798/dicletip.1086358
ISNAD	Gumus, Hatice Hale - YARKIN, Fügen. "Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Respiratory Syncytial Virus (RSV) Enfeksiyon İnsidansının Araştırılması". Dicle Tıp Dergisi 49/1 (2022), 176-186. https://doi.org/10.5798/dicletip.1086358