Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi
Yıl: 2022 Cilt: 35 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 36 - 39 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.36519/kd.2022.3573 İndeks Tarihi: 03-05-2023
Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi
Öz: Amaç: Çalışmada, dispeptik şikayetlerle başvuran hastalardan alınan mide antrum biyopsi örneklerinde, hızlı üreaz testi (HÜT), kültür ve histoloji yöntemleriyle Helicobacter pylori infeksiyonu varlığının araştırılması; izolatların amoksisilin, klaritromisin, levofloksasin ve metronidazole karşı dirençlerinin antibiyotik gradyan yöntemiyle belirlenmesi amaçlandı. Yöntemler: Antrum ve korpus bölgelerinden alınan 278 biyopsi örneğinin mikrobiyolojik ve histopatolojik incelemeleri yapıldı. Biyopsi örneklerinde H. pylori varlığı; kültür, histoloji ve HÜT testleri ile araştırıldı. İzolatların; amoksisilin, kla- ritromisin, levofloksasin ve metronidazole karşı antimikrobiyal dirençleri antibiyotik gradyan yöntemiyle tespit edildi. Kültür altın standard yöntem olarak belirlendi ve histoloji ve HÜT için duyarlılık ve özgüllük hesaplandı. Ayrıca histoloji ve HÜT’ün birlikte pozitifliği altın standard kriteri kabul edilerek kültür için duyarlılık ve özgüllük oranları hesaplandı. Bulgular: Çalışmada, H. pylori pozitifliği; 278 hastanın 140’ında kültür, 174’ünde histoloji ve 191’nde HÜT ile belir- lendi. Kültür, histoloji ve HÜT yöntemlerinin duyarlılık oranları %76.5 ve %88.3, %87.8 ve özgüllükleri %63, %94.2 ve %57.2 olarak tespit edildi. Kültürden izole edilen 140 H. pylori suşunda antibiyotik gradyan yöntemiyle antibiyotik direnci araştırıldı; amoksisilin, klaritromisin, levofloksasin ve metronidazole karşı direnç oranları sırasıyla 9 (%6.4), 22 (%15.7), 17 (%12.1), 57 (%40.7) olarak tespit edildi. Sonuçlar: Çalışmada; kültür, HÜT ve histoloji yöntemleri arasında en duyarlı testin HÜT olduğu görüldü. Kültür yönteminin özgüllüğünü yüksek olarak tespit etmemize rağmen, duyarlılığı diğer yöntemlere göre oldukça düşüktü. H. pylori kültürünün duyarlılığının düşük olması; bakterinin nazlı, güç üreyen bir mikroorganizma olması, klinik örneğin alınması ve transport koşullarının izolasyon şansını doğrudan etkilemesi gibi faktörlerden kaynaklanabilir.
Anahtar Kelime: Evaluation of Diagnostic Performance of Culture, Rapid Urease Test and Histopathology in the Diagnosis of Helicobacter pylori Infection, and In Vitro Activity of Various Antimicrobials Against Helicobacter pylori
Öz: Objective: The aim of this study, is to investigate the presence of Helicobacter pylori (H. pylori) infection by culture, histology and rapid urease test (RUT) in gastric antrum biopsy samples taken from patients presenting with dyspeptic complaints and to determine the resistance of the isolates to amoxicillin, clarithromycin, levofloxacin and metronida- zole by antibiotic gradient method (E-test). Methods: Microbiological and histopathological examinations of 278 biopsy specimens taken from antrum and corpus regions were performed. The presence of H. pylori in biopsy samples was investigated by culture, histology and RUT. Antimicrobial resistance of the isolates against amoxicillin, clarithromycin, levofloxacin and metronidazole was de- termined by antibiotic gradient method. Sensitivity and specificity of histology and RUT were calculated by accepting culture as the gold standard. Sensitivity and specificity for culture was also calculated by taking the co-positivity of both histology and RUT as the gold standard. Results: H. pylori positivity was detected in 140 of 278 patients with culture, 174 with histology, and 191 with RUT. Sensitivity and specificity of the culture, histology and RUT methods of the patients were 76.5% and 88.3%, 87.8% and 63%, 94.2% and 57.2%, respectively. Antibiotic resistance was investigated by antibiotic gradient method in 140 H. pylori strains isolated from culture. The resistance rates of H. pylori strains to the amoxillin, clarithromycin, levoflox- acin and metronidazole were detected as 9 (%6.4), 22 (%15.7), 17 (%12.1), 57 (%40.7), respectively. Conclusions: In the study, RUT was found to be the most sensitive test among culture, histology and RUT methods. Although the specificity of the culture method was high, its sensitivity was found to be quite low compared to other methods. The low sensitivity of H. pylori culture may be caused by factors that affect the chances of direct isolation such as dealing with a fastidious microorganism, clinical sample retrieval and transport conditions
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- 1. Warren J. R., Marshall B. Unidentified curved bacilli on gastric epithelium in active chronic gastritis. Lancet. 1983:1273-5.
- 2. Dunn BE, Cohen H, Blaser MJ. Helicobacter pylori. Clin Microbiol Rev. 1997; 42:720-41. [CrossRef]
- 3. Rothenbacher D, Brenner H. Burden of Helicobacter pylori and Helicobacter pylori-related diseases in developed countries: recent developments and future implications. Microb Infect. 2003;5:693-703. [CrossRef]
- 4. Lehours P, Yılmaz O. Epidemiology of Helicobacter pylori infection. Helico- bacter. 2007;12 Suppl 1:1-3. [CrossRef]
- 5. Pajares-Garcia JM. Diagnosis of Helicobacter pylori: Invasive methods. Ital J Gastroenterol Hepatol. 1998;30 Suppl 3:S320-3.
- 6. Uyanık MH, Aktaş O. Helicobacter pylori’nin Mikrobiyolojik Tanısı. EAJM. 2007;39:205-9.
- 7. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicro- bial susceptibility testing. Eighteenth informational supplement, M2-A9, M7-A7, and M100-S18. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute; 2008.
- 8. Brandi G, Biavati B, Calabrese C, et al. Urease-positive bacteria other than Helicobacter pylori in human gastric juice and mucosa. Am J Gastroenterol. 2006;101(8):1756-61. [CrossRef]
- 9. Chomvarin C, Chantarasuk Y, Mairiang P, et al. Sensitivity and specificity of an in-house rapid urease test for detecting Helicobacter pylori infection on gastric biopsy. Southeast Asian J Trop Med Public Health. 2006;37(2):312-9.
- 10. Korkmaz H, Kesli R, Karabaglı P, Terzi Y. Comparison of the diagnostic accu- racy of 5 different stool antigen tests for the diagnosis of Helicobacter pylori infection. Helicobacter, 2013, 18(5):384-91.
- 11. Weiss J, Mecca J, da Silva E, Gassner D. Comparison of PCR and other diagnostic techniques for detection of Helicobacter pylori infection in dyspeptic patients. J Clin Microbiol. 1994;32(7):1663-8. [CrossRef]
- 12. Khalifehgholi M, Shamsipour F, Ajhdarkosh H, et al. Comparison of five di- agnostic methods for Helicobacter pylori. Iran J Microbiol. 2013;5(4):396-401.
- 13. Cosgun Y, Yildirim A, Yucel M, et al. Evaluation of invasive and noninvasive methods for the diagnosis of Helicobacter pylori infection. Asian Pac J Cancer Prev. 2016;17(12):5265-72. [CrossRef]
- 14. Ozçay F, Koçak N, Saltik Temizel IN, et al. Helicobacter pylori infection in Turkish children: comparison of diagnostic tests, evaluation of eradication rate, and changes in symptoms after eradication. Helicobacter. 2004;9(3):242- 8. [CrossRef]
- 15. Kaklıkkaya N, Çubukçu K, Yazıcı Y, et al. Gastrointestinal yakınması olan hasta- larda gram boyama, ureaz ve kultur testleri ile Helicobacter pylori varlığının belirlenmesi. İnfeksiyon Derg. 2003;17(3):329-32.
- 16. Dzieniszewski J, Jarosz M. Guidelines in the medical treatment of Helicobacter pylori infection. J Physiol Pharmacol. 2006;57 Suppl 3:143-54.
- 17. Megraud F, Lehours P. Helicobacter pylori detection and antimicrobial suscep- tibility testing. Clin Microbiol Rev. 2007;20(2):280-322. [CrossRef]
- 18. Hu CT, Wu CC, Lin CY, et al. Resistance rate to antibiotics of Helicobacter pylori isolates in eastern Taiwan. J Gastroenterol Hepatol. 2007;22(5):720-3. [CrossRef]
- 19. Bakir Ozbey S, Ozakin C, Keskin M. [Antibiotic resistance rates of Helicobacter pylori isolates and the comparison of E-test and fluorescent in situ hybridization methods for the detection of clarithromycin resistant strains]. Mikrobiyol Bul. 2009;43(2):227-34.
- 20. Eng NF, Ybazeta G, Chapman K, et al. Antimicrobial susceptibility of Canadian isolates of Helicobacter pylori in Northeastern Ontario. Can J Infect Dis Med Microbiol. 2015;26(3):137-44. [CrossRef]
- 21. Hakemi Vala M, Eyvazi S, Goudarzi H, Sarie HR, Gholami M. Evaluation of clarithromycin resistance among Iranian Helicobacter pylori isolates by E-test and real-time polymerase chain reaction methods. Jundishapur J Microbiol. 2016;9(5):e29839. [CrossRef]
- 22. Boehnke KF, Valdivieso M, Bussalleu A, et al. Antibiotic resistance among Helicobacter pylori clinical isolates in Lima, Peru. Infect Drug Resist. 2017;10:85- 90. [CrossRef]
- 23. Demiray-Gürbüz E, Yılmaz Ö, Olivares AZ, et al. Rapid identification of Heli- cobacter pylori and assessment of clarithromycin susceptibility from clinical specimens using FISH. J Pathol Clin Res. 2016;3(1):29-37. [CrossRef]
- 24. Shiota S, Reddy R, Alsarraj A, El-Seraq HB and Graham DY. Antibiotic resistance of Helicobacter pylori among male United States Veterans. Clin Gastroenterol Hepatol. 2015;13(9):1616-24. [CrossRef]
- 25. Caliskan R, Tokman HB, Erzin Y, blet al. Antimicrobial resistance of Helico- bacter pylori strains to five antibiotics, including levofloxacin, in Northwestern Turkey. Rev Soc Bras Med Trop. 2015;48(3):278-84. [CrossRef]
- 26. Ağel E, Durmaz B, Tevfik MR, Aşgın N. The isolation and antibiotic resistant pattern of Helicobacter pylori in dyspeptic patients. Turk J Med Sci. 2000;30(2):143-6.
| APA | Kesli R, bilgin h, Ünlü Y, Gungor G (2022). Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi. , 36 - 39. 10.36519/kd.2022.3573 |
| Chicago | Kesli Recep,bilgin huseyin,Ünlü Yaşar,Gungor Gokhan Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi. (2022): 36 - 39. 10.36519/kd.2022.3573 |
| MLA | Kesli Recep,bilgin huseyin,Ünlü Yaşar,Gungor Gokhan Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi. , 2022, ss.36 - 39. 10.36519/kd.2022.3573 |
| AMA | Kesli R,bilgin h,Ünlü Y,Gungor G Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi. . 2022; 36 - 39. 10.36519/kd.2022.3573 |
| Vancouver | Kesli R,bilgin h,Ünlü Y,Gungor G Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi. . 2022; 36 - 39. 10.36519/kd.2022.3573 |
| IEEE | Kesli R,bilgin h,Ünlü Y,Gungor G "Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi." , ss.36 - 39, 2022. 10.36519/kd.2022.3573 |
| ISNAD | Kesli, Recep vd. "Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi". (2022), 36-39. https://doi.org/10.36519/kd.2022.3573 |
| APA | Kesli R, bilgin h, Ünlü Y, Gungor G (2022). Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi. Klimik Dergisi, 35(1), 36 - 39. 10.36519/kd.2022.3573 |
| Chicago | Kesli Recep,bilgin huseyin,Ünlü Yaşar,Gungor Gokhan Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi. Klimik Dergisi 35, no.1 (2022): 36 - 39. 10.36519/kd.2022.3573 |
| MLA | Kesli Recep,bilgin huseyin,Ünlü Yaşar,Gungor Gokhan Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi. Klimik Dergisi, vol.35, no.1, 2022, ss.36 - 39. 10.36519/kd.2022.3573 |
| AMA | Kesli R,bilgin h,Ünlü Y,Gungor G Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi. Klimik Dergisi. 2022; 35(1): 36 - 39. 10.36519/kd.2022.3573 |
| Vancouver | Kesli R,bilgin h,Ünlü Y,Gungor G Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi. Klimik Dergisi. 2022; 35(1): 36 - 39. 10.36519/kd.2022.3573 |
| IEEE | Kesli R,bilgin h,Ünlü Y,Gungor G "Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi." Klimik Dergisi, 35, ss.36 - 39, 2022. 10.36519/kd.2022.3573 |
| ISNAD | Kesli, Recep vd. "Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi". Klimik Dergisi 35/1 (2022), 36-39. https://doi.org/10.36519/kd.2022.3573 |
