Yıl: 2012 Cilt: 46 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 341 - 351 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması

Öz:
Metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA)’a bağlı enfeksiyonlar tüm dünyada yaygın olarak karşımıza çıkmaktadır. MRSA daha çok nozokomiyal enfeksiyonlardan izole edilmekle birlikte toplumdan kazanılmış MRSA enfeksiyonları da görülmektedir. Metisilin direnci, SCCmec gen kasetiyle taşınan mecA geni varlığı ile kazanılmaktadır. Bu gen kasetinin farklı tipleri bulunmaktadır. Hastaneden kazanılmış ve toplumdan kazanılmış (TK-) MRSA suşlarında farklı SCCmec tipleri saptanabilmektedir. TK-MRSA suşları, deri ve yumuşak doku enfeksiyonları için önemli bir virülans faktörü olan Panton-Valentine lökosidini (PVL)’ni de taşıyabilirler. PVL taşıyan suşlar sağlam deriden penetre olabilmekte ve ciddi enfeksiyonlara yol açabilmektedir. Bu çalışmanın amacı, bir üniversite hastanesinde deri ve yumuşak doku enfeksiyonlarıdan izole edilen S.aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve PVL geni varlığının belirlenmesi ve diğer enfeksiyonlardan izole edilen S.aureus suşlarıyla karşılaştırılmasıdır. Çalışmaya, deri ve yumuşak doku enfeksiyonlarından izole edilen 285 ve diğer örneklerden (53 kan, 48 alt solunum yolu örneği, 30 steril vücut sıvısı, 30 genitoüriner sistem örneği) tabakalandırma ve rastgele seçim yöntemiyle kontrol grubu olarak seçilen 161 S.aureus suşu alınmıştır. Deri ve yumuşak doku infeksiyonlarından elde edilen suşların %46.7’si yatan hastalardan, %48.4’ü kadınlardan izole edilmiş, hastaların ortalama yaşı 45.5 yıl olarak saptanmıştır. Kontrol grubundaki suşların ise %60.9’u yatan hastalardan, %41.6’sı kadınlardan seçilmiş; ortalama yaş 50.2 yıl olarak hesaplanmıştır. İzolatların tanımlanması Phoenix sistemi (Becton Dickinson, ABD) ile yapılmış ve tüpte koagülaz testiyle doğrulanmıştır. Metisilin direnci oksasilin ve sefoksitin minimum inhibitör konsantrasyonlarını belirleyen Phoenix sistemine ek olarak oksasilin agar tarama yöntemi ve/veya disk difüzyon yöntemiyle sefoksitin zon çapının belirlenmesi ile değerlendirilmiştir. mecA varlığı, SCCmec tipi ve PVL geni, özgül primerler kullanılarak polimeraz zincir reaksiyonuyla belirlenmiştir. Deri ve yumuşak doku enfeksiyonlarının 58 (%20.3)’inde ve seçilen kontrol grubunun 39 (%24.2)’unda izolatların metisiline dirençli olduğu saptanmıştır. İzole edilen 97 MRSA suşundan 85’i ek bir dcs bölgesi içeren SCCmec tip III-benzeri bir patern, üçü tip IV, üçü tip IIIa, biri tip IIIb, biri tip II bulunmuş; dördü ise tiplendirilememiştir. Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları grubu ile diğer enfeksiyonlar (kontrol) grubu arasında SCCmec tiplerinin dağılımı açısından istatistiksel olarak anlamlı fark gözlenmemiştir (p> 0.05). Saptanan üç SCCmec tip IV suşunun ikisinin tip IVa olduğu görülmüştür. Üçü kontrol grubunda olmak üzere 10 (%2.2) PVL pozitif suş saptanmış ve hepsinin metisiline duyarlı S.aureus (MSSA) olduğu izlenmiştir. Çalışılan suşlarda PVL pozitif MRSA bulunmamış olmasına karşın, TK-MRSA için bir belirteç olan SCCmec tip IVa’nın ve PVL pozitif MRSA için rezervuar olabildiği bilinen PVL pozitif MSSA’nın görülmesi, sürveyans çalışmalarının önemine işaret etmektedir.
Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik
  • 1. Vandenesch F, Naimi T, Enright MC, et al. Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus carrying Panton-Valentine leukocidin genes: worldwide emergence. Emerg Infect Dis 2003; 9(8): 978-84.
  • 2. Schneider-Lindner V, Delaney JA, Dial S, Dascal A, Suissa S. Antimicrobial drugs and community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus, United Kingdom. Emerg Infect Dis 2007; 13(7): 994-1000.
  • 3. Katayama Y, Ito T, Hiramatsu K. A new class of genetic element, staphylococcus cassette chromosome mec, encodes methicillin resistance in Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother 2000; 44(6): 1549- 55.
  • 4. International Working Group on the Classification of Staphylococcal Cassette Chromosome Elements (IWGSCC). Classification of staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec): guidelines for reporting novel SCCmec elements. Antimicrob Agents Chemother 2009; 53(12): 4961-7.
  • 5. Yamamoto T, Nishiyama A, Takano T, et al. Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus: community transmission, pathogenesis, and drug resistance. J Infect Chemother 2010; 16(4): 225-54.
  • 6. Okuma K, Iwakawa K, Turnidge JD, et al. Dissemination of new methicillin-resistant Staphylococcus aureus clones in the community. J Clin Microbiol 2002; 40(11): 4289-94.
  • 7. O’Brien FG, Lim TT, Chong FN, et al. Diversity among community isolates of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Australia. J Clin Microbiol 2004; 42(7): 3185-90.
  • 8. Abdel-Haq N, Al-Tatari H, Chearskul P, et al. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in hospitalized children: correlation of molecular analysis with clinical presentation and antibiotic susceptibility testing (ABST) results. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2009; 28(5): 547-551.
  • 9. Ender M, McCallum N, Adhikari R, Berger-Bachi B. Fitness cost of SCCmec and methicillin resistance levels in Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother 2004; 48(6): 2295-7.
  • 10. Diep BA, Sensabaugh GF, Somboona NS, Carleton HA, Perdreau-Remington F. Widespread skin and softtissue infections due to two methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains harboring the genes for Panton- Valentine leucocidin. J Clin Microbiol 2004; 42(5): 2080-4.
  • 11. Lina G, Piemont Y, Godail-Gamot F, et al. Involvement of Panton-Valentine leukocidin-producing Staphylococcus aureus in primary skin infections and pneumonia. Clin Infect Dis 1999; 29(5): 1128-32.
  • 12. Gonzalez BE, Martinez-Aguilar G, Hulten KG, et al. Severe staphylococcal sepsis in adolescents in the era of community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Pediatrics 2005; 115(3): 642-8.
  • 13. Gillet Y, Issartel B, Vanhems P, et al. Association between Staphylococcus aureus strains carrying gene for Panton-Valentine leukocidin and highly lethal necrotising pneumonia in young immunocompetent patients. Lancet 2002; 359(9308): 753-9.
  • 14. Boubaker K, Diebold P, Blanc DS, et al. Panton-valentine leukocidin and staphyloccoccal skin infections in schoolchildren. Emerg Infect Dis 2004; 10(1): 121-4.
  • 15. Oliveira DC, de Lencastre H. Multiplex PCR strategy for rapid identification of structural types and variants of the mec element in methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother 2002; 46(7): 2155-61.
  • 16. Ito T, Katayama Y, Asada K, et al. Structural comparison of three types of staphylococcal cassette chromosome mec integrated in the chromosome in methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother 2001; 45(5): 1323-36.
  • 17. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. Eighteenth Informational Supplement M100-S18. 2008. CLSI, Wayne, PA.
  • 18. Unal S, Hoskins J, Flokowitsch JE, et al. Detection of methicillin-resistant staphylococci by using the polymerase chain reaction. J Clin Microbiol 1992; 30(7): 1685-91.
  • 19. Gonzalez BE, Rueda AM, Shelburne SA 3rd, et al. Community-associated strains of methicillin-resistant Staphylococccus aureus as the cause of healthcare-associated infection. Infect Control Hosp Epidemiol 2006; 27(10): 1051-6.
  • 20. Ergon MC, Biçmen M, Gülay Z. Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli Staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. ANKEM 2010; 24(2): 65-70.
  • 21. Deurenberg RH, Vink C, Oudhuis GJ, et al. Different clonal complexes of methicillin-resistant Staphylococcus aureus are disseminated in the Euregio Meuse-Rhine region. Antimicrob Agents Chemother 2005; 49(10): 4263-71.
  • 22. Budimir A, Deurenberg RH, Plecko V, et al. Molecular characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus bloodstream isolates from Croatia. J Antimicrob Chemother 2006; 57(2): 331-4.
  • 23. Akoglu H, Zarakolu P, Altun B, Unal S. Epidemiological and molecular characteristics of hospital-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains isolated in Hacettepe Universty Adult Hospital in 2004- 2005. Mikrobiyol Bul 2010; 44(3): 343-355.
  • 24. Tekeli A, Koyuncu E, Dolapci I, Akan OA, Karahan ZC. Molecular characteristics of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains isolated from blood cultures between 2002-2005 in Ankara University Hospital. Mikrobiyol Bul 2009; 43(1): 1-10.
  • 25. Karahan ZC, Tekeli A, Adaleti R, et al. Investigation of Panton-Valentine leukocidin genes and SCCmec types in clinical Staphylococcus aureus isolates from Turkey. Microb Drug Resist 2008; 14(3): 203-10.
  • 26. Kilic A, Guclu AU, Senses Z, et al. Staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) characterization and panton-valentine leukocidin gene occurrence for methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Turkey, from 2003 to 2006. Antonie Van Leeuwenhoek 2008; 94(4): 607-14.
  • 27. Chongtrakool P, Ito T, Ma XX, et al. Staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) typing of methicillin- resistant Staphylococcus aureus strains isolated in 11 Asian countries: a proposal for a new nomenclature for SCCmec elements. Antimicrob Agents Chemother 2006; 50(3): 1001-12.
  • 28. Ozkul H, Oktem IM, Gulay Z. Investigation of the presence of panton-valentin leucocidin (PVL) in Staphylococcus aureus strains isolated from clinical samples. Mikrobiyol Bul 2007; 41(3): 357-62.
  • 29. Demir T, Coplu N, Bayrak H, et al. Panton-Valentine leucocidin gene carriage among Staphylococcus aureus strains recovered from skin and soft tissue infections in Turkey. J Antimicrob Chemother 2012; 67(4): 837-40.
  • 30. Rasigade JP, Laurent F, Lina G, et al. Global distribution and evolution of Panton-Valentine leukocidin-positive methicillin-susceptible Staphylococcus aureus, 1981-2007. J Infect Dis 2010; 201(10): 1589-97.
APA Gülmez D, SANCAK B, ERCİS S, Karakaya J, Hascelik G (2012). Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması. , 341 - 351.
Chicago Gülmez Dolunay,SANCAK Banu,ERCİS Serpil,Karakaya Jale,Hascelik Gulsen Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması. (2012): 341 - 351.
MLA Gülmez Dolunay,SANCAK Banu,ERCİS Serpil,Karakaya Jale,Hascelik Gulsen Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması. , 2012, ss.341 - 351.
AMA Gülmez D,SANCAK B,ERCİS S,Karakaya J,Hascelik G Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması. . 2012; 341 - 351.
Vancouver Gülmez D,SANCAK B,ERCİS S,Karakaya J,Hascelik G Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması. . 2012; 341 - 351.
IEEE Gülmez D,SANCAK B,ERCİS S,Karakaya J,Hascelik G "Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması." , ss.341 - 351, 2012.
ISNAD Gülmez, Dolunay vd. "Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması". (2012), 341-351.
APA Gülmez D, SANCAK B, ERCİS S, Karakaya J, Hascelik G (2012). Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, 46(3), 341 - 351.
Chicago Gülmez Dolunay,SANCAK Banu,ERCİS Serpil,Karakaya Jale,Hascelik Gulsen Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni 46, no.3 (2012): 341 - 351.
MLA Gülmez Dolunay,SANCAK Banu,ERCİS Serpil,Karakaya Jale,Hascelik Gulsen Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.46, no.3, 2012, ss.341 - 351.
AMA Gülmez D,SANCAK B,ERCİS S,Karakaya J,Hascelik G Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2012; 46(3): 341 - 351.
Vancouver Gülmez D,SANCAK B,ERCİS S,Karakaya J,Hascelik G Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2012; 46(3): 341 - 351.
IEEE Gülmez D,SANCAK B,ERCİS S,Karakaya J,Hascelik G "Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması." Mikrobiyoloji Bülteni, 46, ss.341 - 351, 2012.
ISNAD Gülmez, Dolunay vd. "Toplumdan kazanılmış ve nozokomiyal staphylococcus aureus suşlarında SCCmec tiplerinin ve Panton-Valentine lökosidin varlığının araştırılması: Deri ve yumuşak doku enfeksiyonları ile diğer enfeksiyonların karşılaştırılması". Mikrobiyoloji Bülteni 46/3 (2012), 341-351.