Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi

KOÇTÜRK ALKIŞ, Sümeyra; ERDOĞMUŞ, Pınar; GÜL, MUSTAFA; Çalışkan, Ahmet; Kirişci, Özlem

Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi

Özlem KİRİŞÇİ, (Sağlık Bakanlığı, Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Kahramanmaraş, Türkiye)

Ahmet ÇALIŞKAN, (Sağlık Bakanlığı, Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Kahramanmaraş, Türkiye)

Sümeyra KOÇTÜRK ALKIŞ, (Sağlık Bakanlığı, Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Kahramanmaraş, Türkiye)

Pınar ERDOĞMUŞ, (Sağlık Bakanlığı, Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Kahramanmaraş, Türkiye)

Mustafa GÜL (Sağlık Bakanlığı, Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Kahramanmaraş, Türkiye)

Viral Hepatitis Journal

3 0

Yıl: 2013 Cilt: 19 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 67 - 70 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi

Öz:

Amaç: Dünya genelinde yaklaşık 170-300,000,000 kişinin HCV ile enfekteolduğu tahmin edilmektedir. HCV akut enfeksiyonların %20sine ve kronikaktif hepatit olgularının % 70ine neden olmaktadır. Asemptomatik seyir vekronikleşme; HCV vakalarında en önemli sorundur. Virüsün hızlı replikasyonu veRNA transkripsiyon hatalarının hızlı çoğalması kronikleşmede önemli bir rolesahiptir. Transkripsiyon hatalarının bir sonucu olarak, HCV farklı genetik dizilerigörünür. Genotip 4, 5, 6 yalnızca belirli bölgelerde görülebilir iken genotip 1a,1b, 2a, 2b, 3a ise dünya genelinde gözlenebilmektedir. Bu çalışmada NecipFazıl Kahramanmaraş Şehir Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gelen HCVRNA pozitif 100 hastadan elde edilen yeni tanı konmuş ve tedavi edilmemişhasta kan örneklerinin HCV genotipleri ve ALT AST profilleri incelenmiştir.Gereç ve Yöntemler: Laboratuvarımıza gönderilen kan örneklerinin RNAekstraksiyonu (Qıagen, Qıasymphony Dsp Virus/Patojen Midi Kit,Almanya)ile ve kantitasyonu ise Rotor-Gene Rg-3000 (Corbett Araştırma, Qiagen)ile yapıldı. Örneklerin genotiplemesi Real Time PCR reaktif kiti (GenomeDiagnostics, India) ile gerçekleştirilmiştir.Bulgular: Çok değişkenli analizimizde, demografik veriler ile farklı genotiplerideğerlendirirken cinsiyetler arasında genotip dağılımında anlamlı bir birlikteliksaptanmış; genotip 3ün erkek hastalar arasında yaygın olduğu görülmüştür(p=0.0001) (Tablo 1). Yine genotip 3 genç hastalarda yaygın görülürken (Ortalama yaş: 23 ); genotip 1 ise daha yaşlı hastalarda (ortalama yaş: 58,5)gözlendi. Sonuç: Genotip dağılımı ile HCV RNA yükü (p> 0,005) ve AST seviyeleriarasındaistatistiksel olarak anlamlı bir ilişkiye rastlanmamıştır fakat genotip3 hastalarında ALT seviyeleri anlamlı derecede yüksek görülmüştü (p= 0,0001).Genotip 1 hastalarının; yüksek oranda (% 60) tespit edilmesi de sonuçlarınülkemizdeki diğer literatürle uyum göstermekte bu da demografik veri katkısıoluşturmaktadır.

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Viroloji

The Relationship Between Distribution of HCV-RNA and ALT-AST Levels with Genotypes of Hepatitis C Virus Infected Patients

Öz:

Objective: Approximately 170-300 million people worldwide are estimated to beinfected with HCV. HCV is the causative agent about 20% of acute infections and%70 of chronic active hepatitis cases. Asymptomatic course and leading chronicityis the most important problem in HCV cases. The rapid replication of the virus andRNA transcription errors have important role in chronicity. As a result of errors,different genetic sequences of HCV appear. These genotypes 1a, 1b, 2a, 2b, 3a maypresent worldwide, while the genotypes 4, 5, 6 were only in certain regions. In thisstudy, we investigated HCV genotypes and ALT, AST profiles of newly diagnosedand untreated blood samples obtained from 100 patients positive for HCV RNAadmitted to Necip Fazil Kahramanmaras City Hospital microbiology laboratory. Materials and Methods: Blood samples were sent to our laboratory and extractedto yield RNA (Qıagen, Qıasymphony Dsp Virus/Patogen Midi Kit,Germany) andhad the RNA quantitation with Rotor-Gene RG-3000 (Corbett Research, Qiagen).Genotyping of samples was carried out with Real Time PCR Reagents Kit (GenomeDiagnostics, India). Results: In our multivariable analysis, while evaluating the association of thedifferent genotypes with demographic data, we find a notable difference ingenotype distribution among genders and it was obviously seen that genotype 1was common among older patients, while genotype 3 was common among youngersubjects. Conclusion: This study demonstrated the existence of genotype 1 patientshighly prevalant (%60) in our study. Although there was no statistically significantrelationship between genotype distrubition and HCV RNA load (p>0.005) and ASTlevels, ALT levels in group of genotype 3 were significantly higher (p=0.0001). Genotype 1 patients were 60% of all and the results of prevalence rates areconsistent with other literature in Turkey.

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Viroloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Koff RS. Hepatitis C. In: Gorbach SL, Bartlett JG, Blacklow NR, eds. Infectious Diseases. 3rd ed. Philadelphia: Lippincott Williams. 2004: 779-84.
2. Akız H. Kronik C hepatitinde tedavi. Çakaloğlu Y, Ökten A, ed. Kronik Viral Hepatitlerde Tedavi Yaklaşımları. Ankara: Bilimsel Tıp Yayınevi. 1998: 57-62.
3. Sünbül M, Leblebicioğlu H. Kronik hepatit C tedavisinde PEG- interferonların kullanımı. Flora. 2003; 8: 3-16.
4. Sherlock S, Dooley J. Diseases of the Liver and Biliary System. 11th ed. London: Blackwell Publishing Ltd. 2002: 305-19.
5. Davis GL. Hepatitis C genotypes and quasispecies. Am J Med. 1999; 107: 21-26.
6. Forns X, Bukh J. The molecular biology of hepatitis C virus, genotypes and quasispecies. Clinics in Liver Diseases. 1999; 3: 693-716.
7. Thomas DL, Lemon SM. Hepatitis C. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R, eds. Principles and Practice of Infectious Diseases. 6 th ed. Philadelphia: Churchill Livingstone. 2005: 1950-1981.
8. Sünbül M, Leblebicioğlu H. Kronik hepatit C tedavisinde PEG- interferonların kullanımı. Flora. 2003; 8: 3-16.
9. Kobayashi Y, Watanabe S, Konishi M, et al. Quantitation and typing of serum hepatitis C treated with interferon-beta. Hepatology. 1994; 18: 1319-1325.
10. McOmish F, Yap PL, Dow BC, et al. Geographical distribution of hepatitis C virus genotypes in blood donors: An international collaborative study. J Clin Microbiol. 1994; 32: 884-892.
11. Tosun S. Viral Hepatitlerin Ülkemizdeki Değişen Epidemiyolojisi. Ankem Derg. 2013; 27: 128-134.
12. Abacıoğlu YH, Davidson F, Tuncer S, et al. The distrubition of hepatitis C virus genotype in Turkish patients. J Viral Hepat. 1995; 2: 297-301.
13. Yarkın F, Hafta A. Kronik hepatit C infeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotiplerinin dağılımı. Viral Hepatit Dergisi. 2000; 3: 164-167.
14. Erensoy S, Göksel S, Akarca US, Özkahya M, Canatan D. Hepatit C virusun polimeraz zincir reaksiyonu ürünlerinin doğrudan dizi analizi ile genotiplendirilmesi. Flora. 2002; 7: 104-111.
15. Ural O, Uğur A, Fındık D. Konya Bölgesinde Hepatit C Virüsü Genotip Dağılımı. İnfeksiyon Dergisi. 2007; 21: 175-181
16. Yıldız E, Öztan A, Sur F, et al. Molecular characterization of a full genome Turkish hepatitis C virus 1b isolate (HCV-TR1): A predominant viral form in Turkey. Virus Gene. 2002; 25: 169- 177.
17. Mahfaud Z, Kassak K, Kreidieh K, Shamra S, Ramia S. Distribution of hepatitis C virus genotypes among injecting drug user in Lebanon. Virology Journal 2010; 7:96.
18. Cenci M, De Soccio G, Recchia O. Prevalence of hepatitis C virus(HCV) genotypes in central Italy. Anticancer Res. 2003; 23: 5129-5132.
19. Davis GL. Hepatitis C genotypes and quasispecies. Am J Med. 1999; 107: 21-26.
20. Chakravarti A, Dogra G, Verma V, Srivastava AP. Distribution pattern of HCV genotypes & its association with viral load. Indian J Med Res. 2011; 133(3): 326-331.
21. Gökahmetoğlu S, Atalay MA, Kılınç A. Hepatit C Virüs Genotiplerinin Pirosekanslama Yöntemi ile Belirlenmesi. Erciyes Tıp Dergisi. 2011; 338( 2): 99-102.
22. Cross TJ, Quaglia A, Hughes S, Joshi D, Harrison PM. The impact of hepatic steatosis on the natural history of chronic hepatitis C infection. J Viral Hepat. 2009 Jul; 16(7) :492-9. Epub 2009 Feb 5.
23. Özkara S, Tosun İ, Sarı B, Kılıç G, Aker V.F., Sezikli M et al. The Correlation of Serum Transaminase Values with Fibrosis Staging and Necroinflammatory Activity Scores in Chronic Hepatitis. Turkiye Klinikleri J Med Sci 2011; 31(1): 68-74
24. Genetic organization and diversity of the Hepatitis C virus .Q.- L. Choo, et al. Proc. Nat. 1 Acad. Sci. USA Vol. 88, pp.2451-5, March 1991.

APA	Kirişci Ö, Çalışkan A, KOÇTÜRK ALKIŞ S, ERDOĞMUŞ P, GÜL M (2013). Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. , 67 - 70.
Chicago	Kirişci Özlem,Çalışkan Ahmet,KOÇTÜRK ALKIŞ Sümeyra,ERDOĞMUŞ Pınar,GÜL MUSTAFA Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. (2013): 67 - 70.
MLA	Kirişci Özlem,Çalışkan Ahmet,KOÇTÜRK ALKIŞ Sümeyra,ERDOĞMUŞ Pınar,GÜL MUSTAFA Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. , 2013, ss.67 - 70.
AMA	Kirişci Ö,Çalışkan A,KOÇTÜRK ALKIŞ S,ERDOĞMUŞ P,GÜL M Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. . 2013; 67 - 70.
Vancouver	Kirişci Ö,Çalışkan A,KOÇTÜRK ALKIŞ S,ERDOĞMUŞ P,GÜL M Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. . 2013; 67 - 70.
IEEE	Kirişci Ö,Çalışkan A,KOÇTÜRK ALKIŞ S,ERDOĞMUŞ P,GÜL M "Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi." , ss.67 - 70, 2013.
ISNAD	Kirişci, Özlem vd. "Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi". (2013), 67-70.

APA	Kirişci Ö, Çalışkan A, KOÇTÜRK ALKIŞ S, ERDOĞMUŞ P, GÜL M (2013). Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. Viral Hepatitis Journal, 19(2), 67 - 70.
Chicago	Kirişci Özlem,Çalışkan Ahmet,KOÇTÜRK ALKIŞ Sümeyra,ERDOĞMUŞ Pınar,GÜL MUSTAFA Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. Viral Hepatitis Journal 19, no.2 (2013): 67 - 70.
MLA	Kirişci Özlem,Çalışkan Ahmet,KOÇTÜRK ALKIŞ Sümeyra,ERDOĞMUŞ Pınar,GÜL MUSTAFA Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. Viral Hepatitis Journal, vol.19, no.2, 2013, ss.67 - 70.
AMA	Kirişci Ö,Çalışkan A,KOÇTÜRK ALKIŞ S,ERDOĞMUŞ P,GÜL M Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. Viral Hepatitis Journal. 2013; 19(2): 67 - 70.
Vancouver	Kirişci Ö,Çalışkan A,KOÇTÜRK ALKIŞ S,ERDOĞMUŞ P,GÜL M Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi. Viral Hepatitis Journal. 2013; 19(2): 67 - 70.
IEEE	Kirişci Ö,Çalışkan A,KOÇTÜRK ALKIŞ S,ERDOĞMUŞ P,GÜL M "Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi." Viral Hepatitis Journal, 19, ss.67 - 70, 2013.
ISNAD	Kirişci, Özlem vd. "Kahramanmaraş İli Hepatit C Virüs ile Enfekte BireylerdeGenotip Dağılımı ve Genotipin HCV-RNA Yükü ve ALT-AST İlişkisi". Viral Hepatitis Journal 19/2 (2013), 67-70.