Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması

Yıl: 2016 Cilt: 50 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 122 - 132 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması

Öz:
Klinik ve Laboratuvar Standartlar Enstitüsü (Clinical and Laboratory Standards Institute; CLSI) Antifungal Duyarlılık Testleri Alt Komitesi fl ukonazol ve vorikonazol için yeni türe özgü klinik direnç sınır değerleri (clinical breakpoint; CBP) önermiştir. CBP belirlenemediğinde, vahşi tip minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) dağılımları saptanır ve epidemiyolojik eşik değerleri (epidemiological cutoff value; ECV) direncin gösterilmesinde yararlıdır. Bu çalışmanın amacı, yeni CLSI CBP'yi kullanarak, Candida izolatlarında triazollere dirençli türleri belirlemektir. Çalışmaya, 2011-2012 döneminde Türkiye'deki çeşitli yoğun bakım ünitelerinde yatan invazif kandidozlu hastaların kan kültürlerinden izole edilen ve referans laboratuvarımıza gönderilen 140 Candida kökeni alınmıştır. İzolatlar, konvansiyonel yöntemler ile tanımlanmış; fl ukonazol, itrakonazol ve vorikonazol için duyarlılık testleri, CLSI sıvı mikrodilüsyon (BMD) metodu ile 24 saatlik inkübasyon sonrası değerlendirilmiştir. Kökenlerin azol direnç oranları, yeni türe özgü CBP'ler ve uygun olduğunda ECV'ler kullanılarak saptanmıştır. İzolatların tür dağılımı; C.parapsilosis (n= 31), C.tropicalis (n= 26), C.glabrata (n= 21), C.albicans (n= 18), C.lusitaniae (n=16), C.krusei (n= 16), C.kefyr (n= 9), C.guilliermondii (n= 2) ve C.dubliniensis (n= 1) şeklindedir. Yeni belirlenen CLSI CBP'ye göre, fl ukonazol ve C.albicans, C.parapsilosis, C.tropicalis [duyarlı (S), <= 2 ?g/ml; doza bağlı duyarlı (SDD), 4 ?g/ml; dirençli (R), >= 8 ?g/ml) ve C.glabrata (SDD, <= 32 ?g/ml; R, >= 64 ?g/ml) için üç C.albicans, bir C.parapsilosis ve bir C.glabrata izolatı; vorikonazol ve C. albicans, C.parapsilosis, C.tropicalis (S, <= 0.12 ?g/ml; SDD, 0.25-0.5 ?g/ml; R, >= 1 ?g/ml) ve C.krusei (S, <= 0.5 ?g/ml; SDD, 1 ?g/ml; R, >= 2 ?g/ml) için iki C.albicans ve iki C.tropicalis izolatı dirençli bulunmuştur. Vorikonazol için vahşi tip (MIC <= ECV) C.glabrata kökenlerini, vahşi olmayan tip (MIC > ECV) kökenlerden ayırmak amacıyla ECV 0.5 ?g/ml değeri kullanılmıştır. Beş C.glabrata izolatı vorikonazol için vahşi olmayan tip olarak değerlendirilmiştir. Nadir türler için CBP'nin belirlenmemesi nedeniyle fl ukonazol, itrakonazol ve vorikonazol için ECV değerleri, sırasıyla, C.lusitaniae (2 ?g/ml, 0.5 ?g/ml, 0.03 ?g/ml), C.guilliermondii (8 ?g/ml, 1 ?g/ml, 0.25 ?g/ml), C.dubliniensis (0.5 ?g/ml, 0.25 ?g/ml, 0.03 ?g/ml), ve C.kefyr (1 ?g/ml, 0.015 ?g/ml) vahşi ve vahşi olmayan tip ayırımında kullanılmıştır. Epidemiyolojik eşik değerlere göre fl ukonazol için birer C.lusitaniae, C.dubliniensis ve C.kefyr izolatı ve vorikonazol için, üç C.lusitaniae ve bir C.kefyr izolatı vahşi olmayan tip olarak değerlendirilmiştir. Sonuç olarak, toplam 140 kökenden beşi fl ukonazole ve dördü vorikonazole dirençli bulunmuş ve bu dirençli kökenler arasından birer C.parapsilosis, C.tropicalis, C.glabrata, C.lusitaniae, C.kefyr ve üç C.albicans izolatının en az iki triazole çapraz dirençli olduğu saptanmıştır. Sonuç olarak, in vitro olarak dirençli ve vahşi olmayan tip olarak tanımladığımız kökenlerin, klinik geçerliliğinin saptanabilmesi için moleküler ve in vivo çalışmalarla desteklenmesi gerekmektedir
Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Antifungal Susceptibility Profi les of Candida Species to Triazole: Application of New CLSI Species-Specifi c Clinical Breakpoints and Epidemiological Cutoff Values for Characterization of Antifungal Resistance

Öz:
The Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) Subcommittee on Antifungal Susceptibility Testing has newly introduced species-specifi c clinical breakpoints (CBPs) for fl uconazole and voriconazole. When CBPs can not be determined, wild-type minimal inhibitory concentration (MIC) distributions are detected and epidemiological cutoff values (ECVs) provide valuable means for the detection of emerging resistance. The aim of this study is to determine triazole resistance patterns in Candida species by the recently revised CLSI CBPs. A total of 140 Candida strains isolated from blood cultures of patients with invasive candidiasis hospitalized in various intensive care units in Turkey and sent to our reference laboratory between 20112012, were included in the study. The isolates were identifi ed by conventional methods, and susceptibility testing was performed against fl uconazole, itraconazole and voriconazole, by the 24-h CLSI broth microdilution (BMD) method. Azole resistance rates for all Candida species were determined using the new species-specifi c CLSI CBPs and ECVs criteria, when appropriate. The species distribution of the isolates were as follows; C.parapsilosis (n= 31 ), C.tropicalis (n= 26 ), C.glabrata (n= 21), C.albicans (n= 18), C.lusitaniae (n= 16), C.krusei (n= 16), C.kefyr (n= 9), C.guilliermondii (n= 2), and C.dubliniensis (n= 1). According to the newly determined CLSI CBPs for fl uconazole and C.albicans, C.parapsilosis, C.tropicalis [susceptible (S), <= 2 ?g/ml; dose-dependent susceptible (SDD), 4 ?g/ml; resistant (R), >= 8 ?g/ml], and C.glabrata (SDD, <= 32 ?g/ml; R>= 64 ?g/ml) and for voriconazole and C.albicans, C.parapsilosis, C.tropicalis (S, <= 0.12 ?g/ml; SDD, 0.25-0.5 ?g/ml; R, >= 1 ?g/ml), and C.krusei (S, <= 0.5 ?g/ml; SDD, 1 ?g/ml; R, >= 2 ?g/ml), it was found that three of C.albicans, one of C.parapsilosis and one of C.glabrata isolates were resistant to fl uconazole, while two of C.albicans and two of C.tropicalis were resistant to voriconazole. The ECVs of 0.5 ?g/ml for voriconazole and C.glabrata were used to differentiate wild-type (MIC <= ECV) from non-wild-type (MIC > ECV) strains. Five of C.glabrata were non-WT for voriconazole. Due to the lack of CBPs for the less common species, the ECVs for fl uconazole, itraconazole and voriconazole, respectively, were used for C.lusitaniae (2 ?g/ml, 0.5 ?g/ml, 0.03 ?g/ml), C.guilliermondii (8 ?g/ml, 1 ?g/ml, 0.25 ?g/ml), C.dubliniensis (0.5 ?g/ml, 0.25 ?g/ml, 0.03 ?g/ml), and C.kefyr (1 ?g/ml, 0.015 ?g/ml) to categorize isolates of these species as wildand non-wild-type. When the ECVs were used for fl uconazole, one each of C.lusitaniae, C.dubliniensis and C.kefyr; for voriconazole, three of C.lusitaniae and one of C.kefyr were detected as non-wild-type. Overall, a total of fi ve Candida species were resistant to fl uconazole and four to voriconazole and among these species one each of C.parapsilosis, C.tropicalis, C.glabrata, C.lusitaniae, C.kefyr and three of C.albicans exhibited cross-resistance at least against two azoles. It was concluded that, the strains identifi ed as resistant and non-wild-type in this in vitro study should be supported by molecular and in vivo studies for the determination of their clinical validity
Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Tıbbi Laboratuar Teknolojisi
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik
  • Pfaller MA, Andes DR, Diekema DJ, et al. Epidemiology and outcomes of invasive candidiasis due to non-al- bicans species of Candida in 2,496 patients: data from the Prospective Antifungal Therapy (PATH) Registry 2004-2008. Plos One 2014; 9(7): e101510.
  • Pfaller MA, Messer SA, Woosley LN, Jones RN, Castanheira M. Echinocandin and triazole antifungal suscepti- bility profi les of opportunistic yeast and mould clinical isolates (2010-2011): application of new CLSI clinical breakpoints and epidemiological cutoff values to characterize geographic and temporal trends of antifungal resistance. J Clin Microbiol 2013; 51(8): 2571-81.
  • Pappas PG, Kauffman CA, Andes D, et al. Clinical practice guidelines for the management of candidiasis: 2009 update by the Infectious Diseases Society of America. Clin Infect Dis 2009; 48(5): 503-35.
  • Arendrup MC, Dzajic E, Jensen RH, et al. Epidemiological changes with potential implication for antifungal prescription recommendations for fungaemia: data from a nationwide fungaemia surveillance programme. Clin Microbiol Infect 2013; 19(8): E343-53.
  • Pfaller MA. Antifungal drug resistance: mechanisms, epidemiology, and consequences for treatment. Am J Med 2012; 125(1 Suppl): S3-13.
  • Johnson EM. Issues in antifungal susceptibility testing. J Antimicrob Chemother 2008; 61 (Suppl 1): i13-8.
  • Clinical and Laboratory Standards Institute. Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts. 4th Informational Supplement. M27-S4, 2012. CLSI, Wayne, PA.
  • Clinical and Laboratory Standards Institute. Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts. Approved Standard M27-A3. 2008, 3rd ed. CLSI, Wayne, PA.
  • Arendrup MC, Cuenca-Estrella M, Lass-Flörl C, Hope W; EUCAST-AFST. EUCAST technical note on the EU- CAST defi nitive document EDef 7.2: method for the determination of broth dilution minimum inhibitory concentrations of antifungal agents for yeasts EDef 7.2 (EUCAST-AFST). Clin Microbiol Infect 2012; 18(7): E246-7.
  • Pfaller MA, Andes D, Diekema DJ, Espinel-Ingroff A, Sheehan D; CLSI Subcommittee for Antifungal Sus- ceptibility Testing. Wild-type MIC distributions, epidemiological cutoff values and species-specifi c clinical breakpoints for fl uconazole and Candida: time for harmonization of CLSI and EUCAST broth microdilution methods. Drug Resist Updat 2010;13(6): 180-195.
  • Pfaller MA, Espinel-Ingroff A, Boyken L, et al. Comparison of the broth microdilution (BMD) method of the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing with the 24-hour CLSI BMD method for testing susceptibility of Candida species to fl uconazole, posaconazole, and voriconazole by use of epidemi- ological cutoff values. J Clin Microbiol 2011; 49(3): 845-50.
  • Pfaller MA, Diekema DJ. Progress in antifungal susceptibility testing of Candida spp. by use of Clinical and Laboratory Standards Institute broth microdilution methods, 2010 to 2012. J Clin Microbiol 2012; 50(9): 2846-56.
  • Pfaller MA, Espinel-Ingroff A, Canton E, et al. Wild-type MIC distributions and epidemiological cutoff values for amphotericin B, fl ucytosine, and itraconazole and Candida spp. as determined by CLSI broth microdilu- tion. J Clin Microbiol 2012; 50(6): 2040-6.
  • Fothergill AW, Sutton DA, McCarthy DI, Wiederhold NP. Impact of new antifungal breakpoints on antifungal resistance in Candida species. J Clin Microbiol 2014; 52(3): 994-7.
  • Won EJ, Shin JH, Choi MJ, et al. Antifungal susceptibilities of bloodstream isolates of Candida species from nine hospitals in Korea: application of new antifungal breakpoints and relationship to antifungal usage. Plos One 2015; 10(2): e0118770.
  • Gülmez D, Ayçık ÖD, Akdağlı SA. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarında önceki ile karşılaştırmalı olarak yeni CLSI direnç sınır değerlerinin triazol duyarlılık kategorilerinin belirlenmesine etkisi. 1. Ulusal Tıbbi Mikrobiyoloji Kongresi, 24-26 Eylül 2016, Ankara. Kongre Kitabı, s: 78-9.
  • Borman AM, Szekely A, Palmer MD, et. al. Assessment of accuracy of identifi cation of pathogenic yeasts in microbiology laboratories in the United Kingdom. J Clin Microbiol 2012; 50(8): 2639-44.
  • Larone DH. Yeast and yeastlike organisms. Laboratory Technique. Media, pp: 109-143, 325-49. In: Larone DH (ed), Medically Important Fungi: A Guide To Identifi cation. 2002, 4th ed. ASM Press, Washington, DC.
  • Hazen KC, Howell SA. Full Identifi cation of Yeasts, p: 8.8. In: Garcia LS, Isenberg HD, Jorgensen JH, Pfaller M, Landry ML (eds), Clinical Microbiology Procedures Handbook. 2007, 3rd ed. ASM Press, Washington, DC.
  • Azie N, Neofytos D, Pfaller M, Meier-Kriesche HU, Quan SP, Horn D. The PATH (Prospective Antifungal Therapy) Alliance® registry and invasive fungal infections: update 2012. Diagn Microbiol Infect Dis 2012; 73(4): 293-300.
  • Cleveland AA, Farley MM, Harrison LH, et al. Changes in incidence and antifungal drug resistance in can- didemia: results from population-based laboratory surveillance in Atlanta and Baltimore, 2008-2011. Clin Infect Dis 2012; 55(10): 1352-61.
  • Clinical and Laboratory Standards Institute. Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts. 3rd Informational Supplement. M27-S3, 2008. CLSI, Wayne, PA.
  • Altuncu E, Bilgen H, Cerikçioğlu N ve ark. Neonatal Candida enfeksiyonları ve etkenlerinin antifungal du- yarlılıkları. Mikrobiyol Bul 2010; 44(4): 593-603.
  • Aydin F, Bayramoglu G, Guler NC, Kaklikkaya N, Tosun I. Bloodstream yeast infections in a university hospi- tal in Northeast Turkey: a 4-year survey. Med Mycol 2011; 49(3): 316-9.
  • Saracli MA, Gumral R, Gul HC, Gonlum A, Yildiran ST. Species distribution and in vitro susceptibility of Can- dida bloodstream isolates to six new and current antifungal agents in a Turkish tertiary care military hospital, recovered through 2001 and 2006. Mil Med 2009; 174(8): 860-5.
  • Gurcuoglu E, Ener B, Akalin H, et al. Epidemiology of nosocomial candidaemia in a university hospital: a 12-year study. Epidemiol Infect 2010; 138(9): 1328-35.
  • Tosun I, Akyuz Z, Guler NC, et al. Distribution, virulence attributes and antifungal susceptibility patterns of Candida parapsilosis complex strains isolated from clinical samples. Med Mycol 2013; 51(5): 483-92.
  • Gültekin B, Eyigör M, Tiryaki Y, Kırdar S, Aydın N. Investigation of antifungal susceptibilities and some viru- lence factors of Candida strains isolated from blood cultures and genotyping by RAPD-PCR. Mikrobiyol Bul 2011; 45(2): 306-17.
APA Karabicak N, ALEM N (2016). Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması. , 122 - 132.
Chicago Karabicak Nilgun,ALEM Nihal Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması. (2016): 122 - 132.
MLA Karabicak Nilgun,ALEM Nihal Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması. , 2016, ss.122 - 132.
AMA Karabicak N,ALEM N Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması. . 2016; 122 - 132.
Vancouver Karabicak N,ALEM N Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması. . 2016; 122 - 132.
IEEE Karabicak N,ALEM N "Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması." , ss.122 - 132, 2016.
ISNAD Karabicak, Nilgun - ALEM, Nihal. "Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması". (2016), 122-132.
APA Karabicak N, ALEM N (2016). Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması. Mikrobiyoloji Bülteni, 50(1), 122 - 132.
Chicago Karabicak Nilgun,ALEM Nihal Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması. Mikrobiyoloji Bülteni 50, no.1 (2016): 122 - 132.
MLA Karabicak Nilgun,ALEM Nihal Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.50, no.1, 2016, ss.122 - 132.
AMA Karabicak N,ALEM N Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2016; 50(1): 122 - 132.
Vancouver Karabicak N,ALEM N Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2016; 50(1): 122 - 132.
IEEE Karabicak N,ALEM N "Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması." Mikrobiyoloji Bülteni, 50, ss.122 - 132, 2016.
ISNAD Karabicak, Nilgun - ALEM, Nihal. "Candida Türlerinin Triazol Antifungal Duyarlılık Profi lleri: Antifungal Direncin Belirlenmesinde Yeni CLSI Türe Özgü Klinik Direnç Sınır Değerleri ve Epidemiyolojik Eşik Değerlerinin Uygulanması". Mikrobiyoloji Bülteni 50/1 (2016), 122-132.