Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus)

ÇUHADAR, Tuğba; Kalkanci, Ayse

Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus)

Tuğba ÇUHADAR, (Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara.)

Ayşe KALKANCI (Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara.)

Mikrobiyoloji Bülteni

33 0

Yıl: 2017 Cilt: 51 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 387 - 395 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus)

Öz:

Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Merkez Laboratuvarında dikkat çekici bir şekilde 2016 yılında %5.3, 2017 yılında %9.3 oranında Candida kefyr izolasyonu yapılmış ve iki kat artış izlenmiştir. Bu çalışma, C.kefyr türünü, tür özelliklerini, antifungal duyarlılık ve in vitro virülans faktörlerini incelemeyi amaçlamıştır. Candida türlerinin tanımlanmasında çimlenme borusu oluşturma, mısır unutween 80 agarda morfolojik özelliklerin değerlendirilmesi ve karbonhidrat asimilasyonuna dayalı ID32C maya tanımlama sistemi kullanılmıştır. Çalışmada fungal rRNA'nın 5.8S ile 18S bölümleri arasındaki ITS1 gen bölgesini çoğaltan ITS1 ve ITS4 primerlerinin kullanıldığı DNA dizi analizi uygulanmıştır. Antifungal duyarlılık "Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)" tarafından önerilen M27A3 buyyon mikrodilüsyon yöntemine göre yapılmıştır. Amfoterisin B, flukonazol, vorikonazol ve itrakonazol için minimal inhibitör konsantrasyonu (MİK) değerleri elde edilmiştir. MİK dağılımı, MİK ve MİKdeğerleri ile geometrik ortalama (GM) hesaplanmıştır. Virülans faktörlerinden kazeinaz, salgısal aspartil proteinaz, esteraz ve fosfolipaz varlığı in vitro olarak araştırılmıştır. Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Merkez Laboratuvarında 2016 yılında çeşitli klinik örneklerden 865 adet Candida izolatı tür düzeyinde tanımlanmıştır. Bu izolatlardan 46 (%5.3)'sı C.kefyr olarak tanımlanmıştır. 2017 yılının ilk dört ayında 320 adet Candida cinsi içinde 30 (%9.3) C.kefyr izolatı tanımlanmıştır. Mısır unu agarda tipik morfoloji göstermeyen 10 adet izolat seçilmiştir. Bu seçilen 10 izolattan dokuzu ID32C maya tanımlama sisteminde ve DNA dizi analizi ile C.kefyr olarak tanımlanmıştır. Tanımlanan 46 izolatın birinde amfoterisin B MİK değeri 2 µg/ml, birinde flukonazol MİK değeri 8 µg/ml olarak bulunmuştur. 2017 yılında izole edilen 30 izolattan birinde flukonazol MİK değeri 8 µg/ml olarak bulunmuştur. Çalışmada yer alan izolat grubunda belirgin bir antifungal direnç saptanmamıştır. C.kefyr olarak tanımlanan dokuz izolattan, birinde kazeinaz ve sekiz izolatta fosfolipaz aktivitesi pozitif bulunmuştur. Belirgin bir direnç göstermeyen ve virülans faktörü olarak en fazla fosfolipaz aktivitesi içeren, bu Candida türünün, neden daha sık enfeksiyon etkeni olarak görülmeye başladığı daha ayrıntılı olarak araştırılmalıdır.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Emerging Pathogen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus)

Öz:

In the central microbiology laboratory of Gazi University Hospital Candida kefyr was isolated from different clinical samples as 5.3% in 2016 and in 2017 this rate increased to 9.3% which was nearly twofold and this has drawn our attention. The aim of this study was to evaluate the special characteristics, antifungal susceptibility and virulence properties of C.keyfr species. Germ tube, corn meal-tween 80 agar morphology and carbohydrate assimilation profiles on ID32C yeast identification system were used for the diagnosis of Candida species. In this study, DNA sequencing was performed using ITS1 and ITS4 primers amplifying fungal gene between 5.8S and 18S regions of rRNA. Antifungal susceptibility was performed using M27A microdilution method recommended by Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Minimum inhibitory concentration (MIC) values for amphotericin B, fluconazole, voriconazole and itraconazole were determined. MIC distribution, MIC and MIC values and geometric mean (GM) were detected. The existence of virulence factors caseinase, secreted aspartyl proteinase, esterase and phospholipase were investigated in vitro. A total of 865 Candida species were isolated from different clinical samples in the central microbiology laboratory of Gazi University Hospital in 2016. Among them, 46 (5.3%) were C.kefyr. In the first four months of 2017, 30 (9.3%) C.kefyr were identified among 320 Candida isolates. Ten isolates which have shown atypical morphology on corn meal agar were selected. Among these 10 isolates, nine of them were identified as C.kefyr by using ID32C system and DNA sequencing method. Amphotericin B MIC value was 2 µg/ml for one isolate, and fluconazole MIC value was 8 µg/ml for another isolate among 46 isolates. Among the 30 isolates of the year 2017, one of them presented MIC value for fluconazole as 8 µg/ml. No marked antifungal resistance was detected in our isolate group. Caseinase was positive in one C.kefyr isolate, and phospholipase were positive in eight of nine isolates. As a result, the reason of increase in the incidence of this Candida species, which does not show significant resistance and presents mostly phospholipase activity as a virulence factor, should be investigated in more detail.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Kısa Bildiri Erişim Türü: Bibliyografik

1. Dufresne SF, Marr KA, Sydnor E, et al. Epidemiology of Candida kefyr in patients with hematologic malignancies. J Clin Microbiol 2014; 52(6): 1830-7.
2. Cornely OA, Lass-Flörl C, Lagrou K, Arsic-Arsenijevic V, Hoenigl M. Improving outcome of fungal diseases: Guiding experts and patients towards excellence. Mycoses 2017; 60(7): 420-5.
3. Lachance MA. Current status of Kluvyeromyces systematics. FEMS Yeast Res 2007; 7(5): 642-5.
4. Taj-Aldeen SJ, AbdulWahab A, Kolecka A, Deshmukh A, Meis JF, Boekhout T. Uncommon opportunistic yeast bloodstream infections from Qatar. Med Mycol 2014; 52(5): 552-6.
5. Alanio A, Desnos-Ollivier M, Garcia-Hermoso D, Bretagne S. Investigating clinical issues by genotyping of medically important fungi: Why and how? Clin Microbiol Rev 2017; 30(3): 671-707.
6. Reference Method for Broth Dilution Antifungal Susceptibility Testing of Yeasts; Approved Standard. Third Edition M27A3. Clinical and Laboratory Standards Institute, 2008.
7. Atalay MA, Koc AN, Demir G, Sav H. Investigation of possible virulence factors in Candida strains isolated from blood cultures. Niger J Clin Pract 2015; 18: 52-5.
8. Dagi HT, Findik D, Senkeles C, Arslan U. Identification and antifungal susceptibility of Candida species isolated from bloodstream infections in Konya, Turkey. Ann Clin Microbiol Antimicrob 2016; 15: 36.
9. Karabıçak N, Alem N. Candida türlerinin triazol duyarlılık profilleri: Antifungal direncin belirlenmesinde yeni CLSI türe özgü klinik direnç sınır değerleri ve epidemiyolojik eşik değerlerinin uygulanması. Mikrobiyol Bul 2016; 50(1): 122-32.
10. Etiz P, Kibar F, Ekenoğlu Y, Yaman A. Kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımının ve antifungal duyarlılıklarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. ANKEM Derg 2015; 29(3): 105-13.
11. Yılmaz G, Çiftçioğlu A, Gündüz M, Özen M, Sarıcaoğlu EM, Akan H. Kandidemi saptanan hematolojik kanserli hastalarda etken dağılımı ve risk faktörlerinin değerlendirilmesi. Klimik Derg 2015; 28(3): 117-21.
12. Yapar N, Pullukcu H, Avkan-Oguz V, et al. Evaluation of species distribution and risk factors of candidemia: a multicenter case-control study. Med Mycol 2011; 49(1): 26-31.
13. Yiğit N, Aktaş E. Activities of amphotericin B, fluconazole and voriconazole against Candida bloodstream isolates determined by broth microdilution and disk diffusion methods. Turk Hij Den Biyol Derg 2014; 71(3): 131-40.
14. Mutlu Sarıgüzel F, Koç AN, Karagöz S. Kan kültürlerinden izole edilen maya türlerinin VITEK 2 sistemi ile tanımlanması ve antifungal duyarlılıkları. Harran Ünv Tıp Fak Derg 2015; 12(2): 261-8.
15. Bretagne S, Renaudat C, Desnos-Ollivier M, Sitbon K, Lortholary O, Dromer F; French Mycosis Study Group. Predisposing factors and outcome of uncommon yeast species-related fungemia based on an exhaustive surveillance programme (2002-14). J Antimicrob Chemother 2017; 72(6): 1784-93.
16. Al-Rawahi GN, Roscoe DL. Ten-year review of candidemia in a Canadian tertiary care centre: predominance of non-albicans Candida species. Can J Infect Dis Med Microbiol 2013; 24(3): e65-8.
17. Eddouzi J, Lohberger A, Vogne C, Manai M, Sanglard D. Identification and antifungal susceptibility of a large collection of yeast strains isolated in Tunisian hospitals. Med Mycol 2013; 51(7): 737-46.
18. Minea B, Nastasa V, Kolecka A, et al. Etiologic agents and antifungal susceptibility of oral candidiosis from Romanian patients with HIV-infection or type 1 diabetes mellitus. Pol J Microbiol 2016; 65(1): 123-9.
19. Fekkar A, Meyer I, Brossas JY, et al. Rapid emergence of echinocandin resistance during Candida kefyr fungemia treatment with caspofungin. Antimicrob Agents Chemother 2013; 57(5): 2380-2.
20. Espinel-Ingroff A, Pfaller MA, Bustamante B, et al. Multilaboratory study of epidemiological cutoff values for detection of resistance in eight Candida species to fluconazole, posaconazole and voriconazole. Antimicrob Agents Chemother 2014; 58(4): 2006-12.

APA	ÇUHADAR T, Kalkanci A (2017). Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus). , 387 - 395.
Chicago	ÇUHADAR Tuğba,Kalkanci Ayse Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus). (2017): 387 - 395.
MLA	ÇUHADAR Tuğba,Kalkanci Ayse Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus). , 2017, ss.387 - 395.
AMA	ÇUHADAR T,Kalkanci A Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus). . 2017; 387 - 395.
Vancouver	ÇUHADAR T,Kalkanci A Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus). . 2017; 387 - 395.
IEEE	ÇUHADAR T,Kalkanci A "Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus)." , ss.387 - 395, 2017.
ISNAD	ÇUHADAR, Tuğba - Kalkanci, Ayse. "Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus)". (2017), 387-395.

APA	ÇUHADAR T, Kalkanci A (2017). Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus). Mikrobiyoloji Bülteni, 51(4), 387 - 395.
Chicago	ÇUHADAR Tuğba,Kalkanci Ayse Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus). Mikrobiyoloji Bülteni 51, no.4 (2017): 387 - 395.
MLA	ÇUHADAR Tuğba,Kalkanci Ayse Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus). Mikrobiyoloji Bülteni, vol.51, no.4, 2017, ss.387 - 395.
AMA	ÇUHADAR T,Kalkanci A Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus). Mikrobiyoloji Bülteni. 2017; 51(4): 387 - 395.
Vancouver	ÇUHADAR T,Kalkanci A Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus). Mikrobiyoloji Bülteni. 2017; 51(4): 387 - 395.
IEEE	ÇUHADAR T,Kalkanci A "Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus)." Mikrobiyoloji Bülteni, 51, ss.387 - 395, 2017.
ISNAD	ÇUHADAR, Tuğba - Kalkanci, Ayse. "Önem Kazanan Patojen: Candida kefyr (Kluvyeromyces marxianus)". Mikrobiyoloji Bülteni 51/4 (2017), 387-395.