Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit

AKTAŞ, Elif; CEYLAN, Abdullah; Guducuoglu, Huseyin; BAYKAL, Sanem; AYGÜL, Kumru; ÖZLÜ, Nagihan; BERKTAŞ, Mustafa; CÖMERT, BEĞENDİK Füsun

Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit

Hüseyin GÜDÜCÜOĞLU, (Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Van, Türkiye)

Elif AKTAŞ, (Zonguldak Karaelmas Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Zonguldak, Türkiye)

Beğendik Füsun CÖMERT, (Zonguldak Karaelmas Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Zonguldak, Türkiye)

Kumru AYGÜL, (Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Van, Türkiye)

Nagihan ÖZLÜ, (Zonguldak Karaelmas Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Zonguldak, Türkiye)

Sanem BAYKAL, (Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Van, Türkiye)

Mustafa BERKTAŞ, (Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Van, Türkiye)

Abdullah CEYLAN (Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı, Van, Türkiye)

Mikrobiyoloji Bülteni

0 0

Yıl: 2009 Cilt: 43 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 535 - 543 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit

Öz:

Bu çalışmada, Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Tıp Fakültesi Hastanesi pediatri servisinde dokuz aylık bir hastanın idrarından, bu hastane ve bölgedeki ilk vankomisine dirençli enterokok (VRE) susunun izole edilmesi üzerine, bu serviste başka VRE izolatlarının varlığının araştırılması, direnç genotiplerinin tespiti ve izolatlar arasındaki klonal ilişkinin değerlendirilmesi planlanmıştır. Bu amaçla hastalardan 28 rektal sürün-tü, 28 cilt sürüntüsü, hastaların bakımından sorumlu personelden 12 cilt sürüntüsü, hastaların annelerinden 15 cilt sürüntüsü ve servisten 96 çevre örneği alınmıştır. İzole edilen suşlann antibiyotik duyarlılıkları ve direnç genotipleri tespit edilmiş; izolatların moleküler tiplendirmesi "pulsed-field" jel elektroforezi (PFCE) ile yapılmıştır. Birinci olgu dışında; biri başka bir hastanın idrarından, 12'si tarama örneklerinden (8 olgunun rektal sürüntü, bir olgunun cilt örneği ve üç hasta yatağı örneği) olmak üzere 13 izolat daha elde edilmiştir. Bütün izolatlar Enterococcus faecium olarak tanımlanmış ve benzer antibiyotik duyarlılık profillerine sahip oldukları gözlenmiştir, izolatların hepsinde vanA geni tespit edilmiştir. PFGE sonuçları, iki majör klon ve bu klonlarla yakın ilişkili beş klonun varlığını ortaya koymuştur. Sonuç olarak; Van bölgesinden ilk VRE izolasyonunun ve birden fazla klonun yayılımının bildirildiği bu çalışma, ülkemizde çok yaygın gibi görünmese de, giderek artan izolasyon oranları ile VRE'lerin potansiyel önemini vurgulamaktadır.

Anahtar Kelime: Bakteriyel proteinler Deri Karbon-oksijen ligazları Elektroforez, jel, pulzasyonlu alan Rektum Genotip Vankomisin direnci Gram-pozitif bakteriyel enfeksiyonlar Enterococcus faecium

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

First isolation and detection of multiple clones of vancomycin-resistant enterococci in the pediatric unit of Van Yuzuncu Yil University, Turkey

Öz:

Upon isolation of the first vancomycin resistant enterococcus (VRE) from the urine sample of a nine months old patient in pediatric unit of Van Yuzuncu Yil University Hospital (located in eastern part of Turkey), we aimed to search for the presence of VRE isolates in the unit, to determine the resistance genotypes and to evaluate the clonal relationships among isolates. A total of 28 rectal swabs and 28 skin swabs from the patients, 12 skin swabs from the staff giving care to the patients, 15 skin swabs from the mothers of the patients and 96 environmental samples from the pediatric unit were screened. Antibiotic susceptibilities were tested and the resistance genotypes were determined. Molecular typing of the isolates was performed using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). Apart from the first case, 13 more VRE isolates, one being a clinical isolate from the urine of a patient and 12 isolates from the screening samples (8 rectal swabs, one skin swab and three swabs from patients' beds) were obtained. All of the isolates were identified as Enterococcus faecium with similar antibiotic susceptibility patterns. VanA gene was present in all of the isolates. PFCE demonstrated two major clones and five clones closely related with the major ones. This was the first VRE isolation and colonization reported in our region. The isolates belonged to more than one clone. Currently, VRE did not seem to be a significant pathogen in Turkey, however, there may be an underestimation of the problem and continuous surveillance studies should be undertaken in every region.

Anahtar Kelime: Gram-Positive Bacterial Infections Enterococcus faecium Bacterial Proteins Skin Carbon-Oxygen Ligases Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field Rectum Genotype Vancomycin Resistance

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik

1.Cetinkaya Y, Faik P, Mayhall CG. Vancomycin-resistant enterococci. Clin Microbiol Rev 2000; 13: 686-707.
2.Schouten MA, Hoogkamp-Korstanje JA, Meis JF, Voss A; European VRE Study Group. Prevalence of vancomycin-resistant enterococci in Europe. Eur) Clin Microbiol Infect Dis 2000; 19: 816-22.
3.Çolak D, Naaş T, Gunseren F, et al. First outbreak of vancomycin-resistant enterococci in a tertiary hospital in Turkey. J Antimicrob Chemother 2002; 50: 397-401.
4.Basustaoglu, A, Aydogan H, Beyan C, Yalcin A, Unal S. First glycopeptide-resistant Enterococcus faecium isolate from blood culture in Ankara, Turkey. Emerg Infect Dis 2001; 7:160-1.
5.Citak EC, Oğuz A, Karadeniz C, Okur V, Basustaoglu A, Arman D. First recurrent infection with vancomycin-resistant enterococcus from Turkey, j Infect 2006; 53:147-50.
6.İnan D, Gunseren F, Çolak D, Saba R, Kazan S, Mamikoglu L. First confirmed case of vancomycin-resistant Enterococcus faecium meningitis in Turkey: case report and literature review. J Chemother 2004; 16: 608-11.
7.Cömert FB, Külah C, Aktas E, Ozlu N, Celebi G. First isolation of vancomycin-resistant enterococci and spread of a single clone in a university hospital in northwest Turkey. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2007; 26: 57-61.
8.Tasdelen Fişgin N, Darka O, Sünbül M, et al. Case report: a nosocomial infection caused by vancomycin resistant enterococcus. Mikrobiyol Bui 2005; 39: 351-5.
9.Yüce A, Karaman M, Gülay Z, Yulug N. Vancomycin-resistant enterococci in neonates. Scand J Infect Dis 2001; 33:803-5.
10.Kaçmaz B, Aksoy A. Antimicrobial resistance of enterococci in Turkey. Int ] Antimicrob Agents 2005; 25: 535-8 .
11.Ozkuyumcu C. Resistant enterococci: prevalence and factors associated with colonization in a Turkish university hospital. Acta Microbiol Pol 1999; 48: 203-7.
12.Kuzucu C, Çizmeci Z, Durmaz R, Durmaz B, Ozerol IH. The prevalence of fecal colonization of enterococci, the resistance of the isolates to ampicillin, vancomycin, and high-level aminoglycosides, and the clonal relationship among isolates. Microb Drug Resist 2005; 11:159-64.
13.Yıldırım M, Sencan I, Ozdemir D, Öksüz Ş, Yılmaz Z, Sahin I. Vancomycin and high-level aminoglycoside resistant Enterococcus carriage and the risk factors related to resistance in hospitalized patients. Mikrobiyol Bui 2007; 41: 271-7.
14.Özkuyumcu C, Köseoğlu Ö, Günalp A. Hastanede yatan hastalarda vankomisin ve yüksek düzey aminogli-kozid dirençli enterokok kolonizasyonunun araştırılması. Mikrobiyol Bul 1998; 32:185-94.
15.Furtado GH, Martins ST, Coutinho AP, Wey SB, Medeiros EA. Prevalence and factors associated with rectal vancomycin-resistant enterococci colonization in two intensive care units in Sao Paulo, Brazil. Braz ] Infect Dis 2005; 9: 64-9.
16.Christidou A, Gikas A, Scoulica E, et al. Emergence of vancomycin-resistant enterococci in a tertiary hospital in Crete, Greece: a cluster of cases and prevalence study on intestinal colonisation. Clin Microbiol Infect 2004; 10:999-1005.
17.Slaughter S, Hayden MK, Nathan C, et al. A comparison of the effect of universal use of gloves and gowns with that of glove use alone on acquisition of vancomycin-resistant enterococci in a medical intensive care unit. Ann Intern Med 1996; 125: 448-56.
18.Hota B. Contamination, disinfection, and cross-colonization: are hospital surfaces reservoirs for nosocomial infection? Clin Infect Dis 2004; 39: 1182-9.
19.Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. 15th Informational Supplement. CLSI/NCCLS Document M100-S15, 2005. CLSI, Wayne, Pennsylvania.
20.Welsh J, McClelland M. Characterization of pathogenic microorganisms by genomic fingerprinting used arbitrarily primed PCR, pp: 595-602. In: Persing DH, Smith TF, Tenover F, White TJ (eds), Diagnostic Molecular Microbiology. Principles and Applications. 1993. ASM Press, Washington, DC.
21.Dutka-Malen S, Evers S, Courvalin P. Detection of glycopeptide resistance genotypes and identification to the species level of clinically relevant enterococci by PCR. J Clin Microbiol 1995; 33: 24-7.
22.Elliott JA, Farmer KD, Facklam RR. Sudden increase in isolation of group B streptococci, serotype V, is not due to emergence of a new pulse field gel electrophoresis type. J Clin Microbiol 1998; 36: 2115-6.
23.Tenover FC, Arbeit RD, Goering RV, et al. Interpreting chromosomal DNA restriction patterns produced by pulsed-field gel electrophoresis: criteria for bacterial strain typing, j Clin Microbiol 1995; 33: 2233-9.
24.Bonten MJ, Willems R, Weinstein RA. Vancomycin-resistant enterococci: why are they here, and where do they come from? Lancet Infect Dis 2001; 1: 314-25.
25.Furtado GH, Mendes RE, Pignatari AC, Wey SB, Medeiros EA. Risk factors for vancomycin-resistant Enterococcus faecalis bacteremia in hospitalized patients: an analysis of two case-control studies. Am J Infect Control 2006; 34:447-51.

APA	Guducuoglu H, AKTAŞ E, CÖMERT B, AYGÜL K, ÖZLÜ N, BAYKAL S, BERKTAŞ M, CEYLAN A (2009). Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit. , 535 - 543.
Chicago	Guducuoglu Huseyin,AKTAŞ Elif,CÖMERT BEĞENDİK Füsun,AYGÜL Kumru,ÖZLÜ Nagihan,BAYKAL Sanem,BERKTAŞ Mustafa,CEYLAN Abdullah Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit. (2009): 535 - 543.
MLA	Guducuoglu Huseyin,AKTAŞ Elif,CÖMERT BEĞENDİK Füsun,AYGÜL Kumru,ÖZLÜ Nagihan,BAYKAL Sanem,BERKTAŞ Mustafa,CEYLAN Abdullah Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit. , 2009, ss.535 - 543.
AMA	Guducuoglu H,AKTAŞ E,CÖMERT B,AYGÜL K,ÖZLÜ N,BAYKAL S,BERKTAŞ M,CEYLAN A Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit. . 2009; 535 - 543.
Vancouver	Guducuoglu H,AKTAŞ E,CÖMERT B,AYGÜL K,ÖZLÜ N,BAYKAL S,BERKTAŞ M,CEYLAN A Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit. . 2009; 535 - 543.
IEEE	Guducuoglu H,AKTAŞ E,CÖMERT B,AYGÜL K,ÖZLÜ N,BAYKAL S,BERKTAŞ M,CEYLAN A "Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit." , ss.535 - 543, 2009.
ISNAD	Guducuoglu, Huseyin vd. "Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit". (2009), 535-543.

APA	Guducuoglu H, AKTAŞ E, CÖMERT B, AYGÜL K, ÖZLÜ N, BAYKAL S, BERKTAŞ M, CEYLAN A (2009). Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit. Mikrobiyoloji Bülteni, 43(4), 535 - 543.
Chicago	Guducuoglu Huseyin,AKTAŞ Elif,CÖMERT BEĞENDİK Füsun,AYGÜL Kumru,ÖZLÜ Nagihan,BAYKAL Sanem,BERKTAŞ Mustafa,CEYLAN Abdullah Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit. Mikrobiyoloji Bülteni 43, no.4 (2009): 535 - 543.
MLA	Guducuoglu Huseyin,AKTAŞ Elif,CÖMERT BEĞENDİK Füsun,AYGÜL Kumru,ÖZLÜ Nagihan,BAYKAL Sanem,BERKTAŞ Mustafa,CEYLAN Abdullah Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.43, no.4, 2009, ss.535 - 543.
AMA	Guducuoglu H,AKTAŞ E,CÖMERT B,AYGÜL K,ÖZLÜ N,BAYKAL S,BERKTAŞ M,CEYLAN A Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit. Mikrobiyoloji Bülteni. 2009; 43(4): 535 - 543.
Vancouver	Guducuoglu H,AKTAŞ E,CÖMERT B,AYGÜL K,ÖZLÜ N,BAYKAL S,BERKTAŞ M,CEYLAN A Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit. Mikrobiyoloji Bülteni. 2009; 43(4): 535 - 543.
IEEE	Guducuoglu H,AKTAŞ E,CÖMERT B,AYGÜL K,ÖZLÜ N,BAYKAL S,BERKTAŞ M,CEYLAN A "Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit." Mikrobiyoloji Bülteni, 43, ss.535 - 543, 2009.
ISNAD	Guducuoglu, Huseyin vd. "Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Pediatri Servisinde vankomisine dirençli enterokokların ilk izolasyonu ve çoğul klonların tespit". Mikrobiyoloji Bülteni 43/4 (2009), 535-543.