İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı

ÖZDİL, Kamil; YANILMAZ, Özgür; aksaray, sebahat; YÜCEL, Fatma Muhterem; ZEYTİNLİ, Ülkü ORAL; DİNÇER, Şölen DALDABAN

İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı

Ülkü ORAL ZEYTİNLİ, (Association of Public Hospitals Northern Anatolian Region of İstanbul Central Laboratory, İstanbul, Turkey)

Fatma MUHTEREM YÜCEL, (Association of Public Hospitals Northern Anatolian Region of İstanbul Central Laboratory, İstanbul, Turkey)

Şölen DALDABAN DİNÇER, (Association of Public Hospitals Northern Anatolian Region of İstanbul Central Laboratory, İstanbul, Turkey)

Özgür YANILMAZ, (Association of Public Hospitals Northern Anatolian Region of İstanbul Central Laboratory, İstanbul, Turkey)

Sebahat AKSARAY, (Association of Public Hospitals Northern Anatolian Region of İstanbul Central Laboratory, İstanbul, Turkey)

Kamil ÖZDİL (Association of Public Hospitals Northern Anatolian Region of İstanbul Central Laboratory, İstanbul, Turkey)

Viral Hepatitis Journal

5 1

Yıl: 2017 Cilt: 23 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 10 - 13 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı

Öz:

Amaç: Hepatit C virüsü (HCV) akut hepatitlerin %20'si, kronik hepatitlerin %70'inden sorumludur. HCV'nin genotip tayini tedavide ve klinik sürecin takibinde önemlidir. Bu çalışmada bölgemizdeki HCV genotiplerinin dağılımını belirlemek amacıyla İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Merkezi Laboratuvarı'nda çalışılmış olan test sonuçları retrospektif olarak değerlendirilmiştir.Gereç ve Yöntemler: HCV genotiplerinin tespiti için real time polimeraz zincir reaksiyonu (Qiagen, Almanya) ve reverse hibridizasyon line probe assay metodu kullanıldı (Nlm srl, İtalya).Bulgular: HCV RNA pozitif 554 hastada HCV genotiplerinin prevalansı genotip 1b: 312 (%56,5), genotip 1a: 127 (%23,1), genotip 3a: 94 (%17,3) ve genotip 4c/d: 3(%0,5), genotip 2a/c: 3 (%0,5), genotip 1a/1b: 3 (%0,5), genotip 1b/4: 1 (%0,2) olmak üzere 10 hastada (%1) mix tip olarak tespit edildi.Sonuç: Bölgemizde ülkemizdeki oranlara benzer şekilde HCV genotip 1b en yaygın genotiptir. Ancak oranları ülkemizde önceki yıllarda yapılan çalışmalara göre daha düşüktür. Muhtemelen bu genotip dağılımındaki farklılık, günümüzdeki globalleşme, teknolojideki gelişim, insan hareketlerinin ve sosyal davranışların değişimine bağlı olabilir. Yeni tedavi protokollerinin uygulanabilmesi ve prognozun belirlenmesi açısından HCV hastalarında genotip tayini önemlidir

Anahtar Kelime:

Konular: Viroloji

Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the Region of İstanbul Northern Anatolian Association of Public Hospitals

Öz:

Objective: Hepatitis C virus (HCV) is responsible for 20% of acute hepatitis and 70% of chronic hepatitis. Determination of HCV genotype is important in the regulation of treatment and the followup of clinical course. In this study, we retrospectively evaluated the results of test performed in the Central Laboratory of İstanbul Northern Anatolian Association of Public Hospitals to determine the genotype distribution of hepatitis C patients in our region. Materials and Methods: HCV genotypes were determined by real time polymerase chain reaction (Qiagen, Germany) and reverse hybridization line probe assay (Nlm srl, Italy) methods.Results: Among HCV RNA-positive 554 patients, 312 (56.5%) patients had genotype 1b, 127 (23.1%) - genotype 1a, and 94 (17.3%) patients had genotype 3a. A total of 10 samples were identified to be mixed genotype; 3 (0.5%) - genotype 4c/d, 3 (0.5%) - genotype 2a/c, 3 (0.5%) - genotype 1a/1b, and 1 (0.2%) - genotype 1b/4. Conclusion: HCV genotype 1b is the most common genotype in our region similar to country-wide results. However, the rates are lower in our country than in the previous years. Probably the difference in this genotype distribution may depend on globalization, developments in technology, changes in human movements and social behaviors. Genotype determination is important for the regulation of treatment and prognosis of HCV infection

Anahtar Kelime:

Konular: Viroloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Kalayci R, Altindiş M, Gülamber G, Demirtürk N, Akcan Y, Demirdal T. Kronik hepatit B ve hepatit C’li hastalarda genotip dağılımı ve hepatit B olgularında direnç paterninin araştırılması. Mikrobiyol Bul. 2010;44:237-243.
2. Koff RS. Hepatitis C. In: Gorbach SL, Bartlett JG, Blacklow NR, eds. Infectious Diseases. 3rd ed.Philadelphia: Lippincott Williams, 2004:779-784.
3. Yarkın F, Hafta A. Kronik hepatit C infeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotiplerinin dağılımı. Viral Hepatit Derg. 2000;3:164-167.
4. Okamoto H, Kobata S, Tokita H, Inoue T, Woodfield GD, Holland PV, Al-Knawy BA, Uzunalimoglu O, Miyakawa Y, Mayumi M. A second-generation method ofgenotyping hepatitis C virus by the polymerase chain reaction with sense andanti-sense primers deduced from the core gene. J Virol Methods. 1996;57:31-45.
5. Davis GL. Hepatitis C genotypes and quasispecies. Am J Med. 1999;107:21-26.
6. Naoumov NV. Hepatitis C virus infection in Eastern Europe. J Hepatol. 1999;31(Suppl 1):84-87.
7. Trepo C, Pradat P. Hepatitis C virus infection in Western Europe. J Hepatol. 1999;31(Suppl 1):80-83.
8. Murphy DG, Sablon E, Chamberland J, Fournier E, Dandavino R, Tremblay CL. Hepatitis C Virus Genotype 7, A New genotype originating from Central Africa. J Clin Microbiol. 2015;53:967-972.
9. Webster G. HCV genotypes-role in pathogenesis of disease and response to therapy.Bailliere’s Clinical Gastroenterology. 2000;14:229-240.
10. McCormick SE, Goodman ZD, Maydonovitch CL, Sjögren MH. Evaluation of liverhistology, ALT elevation, and HCV RNA titer in patients with chronic hepatitis C. Am J Gastroenterol. 1996;91:1516-1522.
11. Ohno O, Mizokami M, Wu RR, Saleh MG, Ohba K, Orito E, Mukaide M, Williams R, Lau JY. New hepatitis C virus (HCV) genotyping system that allows for identification of HCV genotypes 1a, 1b, 2a, 2b, 3a, 3b, 4, 5a, and 6a. J Clin Microbiol. 1997;35:201-207.
12. Furione M, Simoncini L, Gatti M, Baldanti F, Grazia Revello M, Gerna G. HCV genotyping by three methods: analysis of discordant results based on sequencing. J Clin Virol. 1999;13:121-130.
13. Ciotti M, Marcuccilli F, Guenci T, Babakir-Mina M, Chiodo F, Favarato M, Perno CF. A multicenter evaluation of the Abbott RealTime HCV Genotype II assay. J Virol Methods. 2010;167:205- 207.
14. Schutzbank TE, Sefers SE, Kahmann N, Li H, Tang YW. Comparative evaluation of three commercially available methodologies for hepatitis C virus genotyping. J Clin Microbiol. 2006;44:3797-3798.
15. Abacıoglu YH, Davidson F, Tuncer S, Yap PL, Ustacelebi S, Yulug N, Simmonds P. The distribution of hepatitis C virus genotypes in Turkish patients. J Viral Hepat. 1995;2:297-301.
16. Özaçar T, Altuglu I, Zeytinoglu A. Kronik C hepatitinde HCV genotiplerinin dağılımı. Mikrobiyol Bul. 2001;35:451-458.
17. Erensoy S, Göksel S, Akarca US, Özkahya M,Canatan D. Hepatit C virusun polimeraz zincir reaksiyonu ürünlerinin doğrudan dizi analizi ile genotiplendirilmesi. Flora. 2002;7:104-111.
18. Ural O, Arslan U, Fındık D. Konya bölgesinde hepatit C virusu genotip dağılımı. İnfeksiyon Derg. 2007;21:175-181.
19. Sönmez E, Taşyaran MA, Kızılkaya N, Korkut H, Tombul Z, Akçam Z. Hepatit C virus ile infekte 59 hastada HCV genotiplerinin dağılımı: Çok merkezli bir çalışma. Flora. 1996;2:92-95.
20. Altuglu I, Soyler I, Ozacar T, Erensoy S. Distribution of hepatitis C virus genotypes in patients with chronic hepatitis C infection in Western Turkey. Int J Infect Dis. 2008;12:239-244.
21. Sağlık İ, Mutlu D, Öngüt G, İnan D, Öğünç D, Can Sarınoğlu R, Özhak Baysan B, Meral Gültekin M, Çolak D. Akdeniz Üniversitesi Hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul. 2014;48:429-437.
22. Şanlıdağ T, Akçalı S, Özbakkaloğlu B, Ertekin D, Akduman E. Manisa bölgesinde hepatit C virus genotiplerinin dağılımı. Mikrobiyol Bul. 2009;43:613-618.
23. Kabakçı Alagöz G, Karataylı SC, Karataylı E, Celik E, Keskin O, Dinç B, Cınar K, Idilman R, Yurdaydın C, Bozdayı AM. Hepatitis C virus genotype distribution in Turkey remains unchanged after a decade: performance of phylogenetic analysis of the NS5B, E1, and 5’UTR regions in genotyping efficiency, Turk J Gastroenterol. 2014;25:405-410.
24. Oztürk AB, Doğan UB, Oztürk NA, Ozyazici G, Demir M, Akin MS, Böngöl AS. Hepatitis C virus genotypes in Adana and Antakya regions of Turkey. Turk J Med Sci. 2014;44:661-665.
25. Altindis M, Dal T, Akyar I, Karatuna O, Gokahmetoglu S, Ulger ST, Kulah C, Uzun B, Şener AG, Ozdemir M, Aydogan S, Kuskucu MA, Midilli K, Otlu B, Celen MK, Buruk K, Guducuoglu H. Six-year distribution pattern of hepatitis C virus in Turkey: a multicentre study. Biotechnology. 2016;30:335-340.
26. Uzun B, Şener AG, Güngör S, Afşar I. Distribution of Hepatitis C virus genotypes in western Turkey: experience of four years. Acta Medica Mediterranea. 2014;30:1109-1113.

APA	ZEYTİNLİ Ü, YÜCEL F, DİNÇER Ş, YANILMAZ Ö, aksaray s, ÖZDİL K (2017). İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. , 10 - 13.
Chicago	ZEYTİNLİ Ülkü ORAL,YÜCEL Fatma Muhterem,DİNÇER Şölen DALDABAN,YANILMAZ Özgür,aksaray sebahat,ÖZDİL Kamil İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. (2017): 10 - 13.
MLA	ZEYTİNLİ Ülkü ORAL,YÜCEL Fatma Muhterem,DİNÇER Şölen DALDABAN,YANILMAZ Özgür,aksaray sebahat,ÖZDİL Kamil İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. , 2017, ss.10 - 13.
AMA	ZEYTİNLİ Ü,YÜCEL F,DİNÇER Ş,YANILMAZ Ö,aksaray s,ÖZDİL K İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. . 2017; 10 - 13.
Vancouver	ZEYTİNLİ Ü,YÜCEL F,DİNÇER Ş,YANILMAZ Ö,aksaray s,ÖZDİL K İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. . 2017; 10 - 13.
IEEE	ZEYTİNLİ Ü,YÜCEL F,DİNÇER Ş,YANILMAZ Ö,aksaray s,ÖZDİL K "İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı." , ss.10 - 13, 2017.
ISNAD	ZEYTİNLİ, Ülkü ORAL vd. "İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı". (2017), 10-13.

APA	ZEYTİNLİ Ü, YÜCEL F, DİNÇER Ş, YANILMAZ Ö, aksaray s, ÖZDİL K (2017). İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. Viral Hepatitis Journal, 23(1), 10 - 13.
Chicago	ZEYTİNLİ Ülkü ORAL,YÜCEL Fatma Muhterem,DİNÇER Şölen DALDABAN,YANILMAZ Özgür,aksaray sebahat,ÖZDİL Kamil İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. Viral Hepatitis Journal 23, no.1 (2017): 10 - 13.
MLA	ZEYTİNLİ Ülkü ORAL,YÜCEL Fatma Muhterem,DİNÇER Şölen DALDABAN,YANILMAZ Özgür,aksaray sebahat,ÖZDİL Kamil İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. Viral Hepatitis Journal, vol.23, no.1, 2017, ss.10 - 13.
AMA	ZEYTİNLİ Ü,YÜCEL F,DİNÇER Ş,YANILMAZ Ö,aksaray s,ÖZDİL K İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. Viral Hepatitis Journal. 2017; 23(1): 10 - 13.
Vancouver	ZEYTİNLİ Ü,YÜCEL F,DİNÇER Ş,YANILMAZ Ö,aksaray s,ÖZDİL K İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı. Viral Hepatitis Journal. 2017; 23(1): 10 - 13.
IEEE	ZEYTİNLİ Ü,YÜCEL F,DİNÇER Ş,YANILMAZ Ö,aksaray s,ÖZDİL K "İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı." Viral Hepatitis Journal, 23, ss.10 - 13, 2017.
ISNAD	ZEYTİNLİ, Ülkü ORAL vd. "İstanbul Anadolu Kuzey Kamu Hastaneler Birliği Hizmet Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı". Viral Hepatitis Journal 23/1 (2017), 10-13.