Yıl: 2014 Cilt: 48 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 429 - 437 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi

Öz:
Hepatit C virusu (HCV) kronik hepatitlerin en önemli nedenlerinden biridir. HCV’ye bağlı kronik hepatitlerin seyrinde ve tedavinin planlanmasında HCV genotipleri önem taşımaktadır. Bu çalışmada, Akdeniz Üniversitesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında yapılan HCV genotiplendirilmesine ait sonuçların retrospektif olarak değerlendirilmesi ve son beş yıl içinde genotip dağılımındaki değişimin incelenmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya, 2009-2013 yılları arasında laboratuvarımıza HCV genotip tayini için gönderilen, HCV-RNA pozitif kronik hepatit C’li 422 hastaya (219 erkek, 203 kadın; yaş aralığı: 8-79 yıl, yaş ortalaması 46.3 ± 15.5 yıl) ait kan örnekleri dahil edilmiştir. Genotiplendirme için, plazma örneklerinden HCV-RNA ekstraksiyonu otomatize sistem (EZ1 Virus Mini Kit v2.0, Qiagen, Almanya) ile yapılmış ve ters hibridizasyon esaslı ticari bir “line prob assay” (LIPA; GEN-C RT-PCR, İtalya) yöntemi uygulanmıştır. Viral yük tayini için ise, HCV-RNA düzeyleri gerçek zamanlı PCR yöntemi (Cobas TaqMan HCV, Roche Diagnostics, Almanya) ile araştırılmıştır. Hastaların demografik verileri, hastane elektronik bilgi sisteminden ve hasta dosyalarından elde edilmiştir. Hastaların %63.3 (n= 267)’ünde genotip 1b, %14.7 (n= 62)’sinde genotip 1a, %11.1 (n= 47)’inde genotip 3a, %0.9 (n= 4)’unda genotip 2b ve %0.2 (n= 1)’sinde genotip 4e saptanmış; 1 hastada (%0.2) ise genotip 1 ve 4 birlikteliği izlenmiştir. Genotip 1, 2 ve 4 ile enfekte hastaların sırasıyla; %5.4 (n= 23), %2.6 (n= 11) ve %1.4 (n= 6)’ünde alt tip tayini yapılamamıştır. Kırk hastanın yabancı uyruklu olduğu (Rusya’dan 16; Ukrayna ve Gürcistan’dan dörder; Türkmenistan, Kırgızistan ve Almanya’dan üçer; Tacikistan, Azerbaycan, Özbekistan, Çeçenistan, Moldova, İsviçre ve Romanya’dan birer hasta) belirlenmiş; bu hastalarda en sık genotip 3a (19/40; %47.5) tespit edilmiş, genotip 1b ise ikinci sırayı (17/40; %42.5) almıştır. Ortanca HCV viral yük değerleri; tüm hastalar için 668.500 IU/ml (aralık 2.000-9.630.000), genotip 1 ile enfekte hastalar için 732.000 IU/ml (aralık 2.000-9.630.000) ve diğer genotipler ile enfekte hastalar için 444.000 IU/ml (aralık: 2.650- 8.330.000) olarak hesaplanmıştır (p> 0.05). Genotip 1 ile enfekte hastaların, diğer genotiplerle enfekte hastalara göre daha ileri yaşta oldukları (sırasıyla, 47 ± 15.7 yıl ve 39.5 ± 12.2 yıl; p< 0.001) görülmüştür. Farklı genotiplerle enfekte hastalar arasında cinsiyet dağılımı açısından anlamlı bir fark bulunmamıştır (p> 0.05). HCV genotiplerinin belirlenmesi, kronik HCV enfeksiyonlarının tedavisinde yol göstericidir, aynı zamanda HCV epidemiyolojisindeki değişikliklerin izlenmesine de olanak sağlamaktadır. Bu çalışmada, HCV genotip 1b en yüksek oranda görülmekle birlikte, genotip 1 dışındaki genotipler de saptanmış ve bu durumun bölgemizde yaşayan yabancı uyruklu kişilerle ve bölgemizin bir turizm merkezi olmasıyla ilgili olabileceği düşünülmüştür.
Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Viroloji

Distribution of hepatitis C virus genotypes among patients with chronic hepatitis C infection in Akdeniz University Hospital, Antalya, Turkey: A five-year evaluation

Öz:
Hepatitis C virus (HCV) is one of the major causes of chronic hepatitis. It is important to know the genotypes of HCV in the decision of the HCV related chronic hepatitis therapy. The aim of this study was to evaluate the HCV genotypes determined at the Microbiology Laboratory of Akdeniz University Hospital, and to evaluate the changes in the distribution of the genotypes within the last five years. A total of 422 blood samples from HCV-RNA positive chronic hepatitis C patients (219 male, 203 fema- le; age range: 8-79 yrs, mean age 46.3 ± 15.5 yrs) which were sent to our laboratory for genotyping between 2009-2013 period, were analyzed retrospectively. HCV-RNA extractions were performed in an automated system (EZ1 Virus Mini Kit v2.0, Qiagen, Germany), and a commercial reverse hybridizati- on line probe-based assay (LIPA; GEN-C RT-PCR, Italy) was carried out for genotyping, For viral load determinations, a real-time PCR method (Cobas TaqMan HCV, Roche Diagnostics, Germany) was used. Demographic data of the patients were obtained from the hospital information systems and electronic patients&#8217; files. Out of the 422 patients, genotype 1b was detected in 63.3% (n= 267), genotype 1a in 14.7% (n= 62), genotype 3a in 11.1% (n= 47), genotype 2b in 0.9% (n= 4), genotype 4e in 0.2% (n= 1). The subtypes couldn&#8217;t be determined for 5.4% (n= 23), 2.6% (n= 11) and 1.4% (n= 6) of the patients infected with genotype 1, 2 and 4, respectively. One (0.2%) patient, was coinfected with genotype 1 and 4. Of the patients, 40 were foreign-born (16 cases from Russia; 4 of each from Ukraine and Georgia; 3 of each from Turkmenistan, Kyrgyzstan, and Germany; one of each from Tajikistan, Azerbaijan, Uzbekistan, Chechnya, Moldova, Switzerland and Romania) and among these patients genotype 3a (19/40; 47.5%) was the most common genotype followed by genotype 1b (17/40; 42.5%). Median values of HCV viral load were 668.500 IU/ml (range: 2.000-9.630.000) in the whole group; while it was 732.000 IU/ml (range: 2.000-9.630.000) in patients infected with genotype 1 and 444.000 IU/ml (range: 2.650- 8.330.000) in patients infected with the other genotypes (p> 0.05). Patients infected with genotype 1 were found to be older than those infected with other genotypes (47 ± 15.7 and 39.5 ± 12.2, respectively; p< 0.001). Among patients infected with different genotypes, there was no statistically significant difference in terms of genders (p> 0.05). In conclusion, the determination of HCV genotypes is of crucial importance for treatment decision-making of chronic HCV infection. Besides, it also allows monitoring the changes in the epidemiology of HCV. In this study, although genotype 1b was determined as the most common HCV genotype, the detection of other genotypes was remarkable. This finding was attributed to the presence of many foreign national people in Antalya region which was a high capacity tourism area in Turkey.
Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Viroloji
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik
APA Sağlık İ, MUTLU D, ÖNGÜT G, İNAN D, ÖĞÜNÇ M, SARINOĞLU CAN R, BAYSAN ÖZHAK B, GÜLTEKİN M, Çolak D (2014). Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. , 429 - 437.
Chicago Sağlık İmran,MUTLU Derya,ÖNGÜT Gözde,İNAN DİLARA,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,SARINOĞLU CAN Rabia,BAYSAN ÖZHAK Betil,GÜLTEKİN Meral,Çolak Dilek Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. (2014): 429 - 437.
MLA Sağlık İmran,MUTLU Derya,ÖNGÜT Gözde,İNAN DİLARA,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,SARINOĞLU CAN Rabia,BAYSAN ÖZHAK Betil,GÜLTEKİN Meral,Çolak Dilek Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. , 2014, ss.429 - 437.
AMA Sağlık İ,MUTLU D,ÖNGÜT G,İNAN D,ÖĞÜNÇ M,SARINOĞLU CAN R,BAYSAN ÖZHAK B,GÜLTEKİN M,Çolak D Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. . 2014; 429 - 437.
Vancouver Sağlık İ,MUTLU D,ÖNGÜT G,İNAN D,ÖĞÜNÇ M,SARINOĞLU CAN R,BAYSAN ÖZHAK B,GÜLTEKİN M,Çolak D Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. . 2014; 429 - 437.
IEEE Sağlık İ,MUTLU D,ÖNGÜT G,İNAN D,ÖĞÜNÇ M,SARINOĞLU CAN R,BAYSAN ÖZHAK B,GÜLTEKİN M,Çolak D "Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi." , ss.429 - 437, 2014.
ISNAD Sağlık, İmran vd. "Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi". (2014), 429-437.
APA Sağlık İ, MUTLU D, ÖNGÜT G, İNAN D, ÖĞÜNÇ M, SARINOĞLU CAN R, BAYSAN ÖZHAK B, GÜLTEKİN M, Çolak D (2014). Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, 48(3), 429 - 437.
Chicago Sağlık İmran,MUTLU Derya,ÖNGÜT Gözde,İNAN DİLARA,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,SARINOĞLU CAN Rabia,BAYSAN ÖZHAK Betil,GÜLTEKİN Meral,Çolak Dilek Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni 48, no.3 (2014): 429 - 437.
MLA Sağlık İmran,MUTLU Derya,ÖNGÜT Gözde,İNAN DİLARA,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,SARINOĞLU CAN Rabia,BAYSAN ÖZHAK Betil,GÜLTEKİN Meral,Çolak Dilek Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.48, no.3, 2014, ss.429 - 437.
AMA Sağlık İ,MUTLU D,ÖNGÜT G,İNAN D,ÖĞÜNÇ M,SARINOĞLU CAN R,BAYSAN ÖZHAK B,GÜLTEKİN M,Çolak D Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2014; 48(3): 429 - 437.
Vancouver Sağlık İ,MUTLU D,ÖNGÜT G,İNAN D,ÖĞÜNÇ M,SARINOĞLU CAN R,BAYSAN ÖZHAK B,GÜLTEKİN M,Çolak D Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2014; 48(3): 429 - 437.
IEEE Sağlık İ,MUTLU D,ÖNGÜT G,İNAN D,ÖĞÜNÇ M,SARINOĞLU CAN R,BAYSAN ÖZHAK B,GÜLTEKİN M,Çolak D "Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi." Mikrobiyoloji Bülteni, 48, ss.429 - 437, 2014.
ISNAD Sağlık, İmran vd. "Akdeniz Üniversitesi hastanesinde kronik hepatit C enfeksiyonu olan hastalarda hepatit C virus genotipleri: Beş yıllık sonuçların değerlendirilmesi". Mikrobiyoloji Bülteni 48/3 (2014), 429-437.