Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları
Yıl: 2018 Cilt: 48 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 256 - 263 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5222/TMCD.2018.256 İndeks Tarihi: 30-04-2020
Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları
Öz: Amaç: Candida türleri, insanlarda en sık enfeksiyonaneden olan fungal patojenler olup, son yıllarda tanı vetedavi yaklaşımlarındaki gelişmelere paralel olarak gittikçeönemleri artmaktadır. Bu çalışmada, retrospektif olarakkan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımıve antifungal duyarlılıklarının belirlenmesi amaçlanmıştır.Gereç ve Yöntem: Ocak 2012-Mart 2018 dönemindeDüzce Üniversitesi Uygulama ve Araştırma HastanesiMikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen kan kültürlerindebelirlenen maya üremeleri, koloni morfolojisi, germ tüpoluşumu, mısır unu-Tween 80 agarda mikroskobikgörünümleri ve VITEK 2 Compact otomatize identifikasyonsistemi ile tiplendirilmiştir. Amfoterisin B, vorikonazol,flukonazol ve mikafungin duyarlılıkları aynı otomatizesistem ile belirlenmiştir.Bulgular: Toplam 81 Candida izolatının %55’i Candidaalbicans, %18’i Candida parapsilosis, %12’si Candidaglabrata, %12’si Candida tropicalis, %2’si Candidalipolytica ve %1’i Candida kefyr olarak tanımlanmıştır.İzolatların %7’si amfoterisin B’ye, %12’si vorikonazole,%11’i flukonazole, %19’u mikafungine dirençli olaraksaptanmıştır.Sonuç: Çalışmamızda, en sık izole edilen köken Candidaalbicans, non-albicans Candida türlerinde iseC. parapsilosis olmuştur. İzolatların antifungal dirençoranlarının türler arasında oldukça farklı olduğugözlenmiştir. Bu durum kandidemi gibi invazivenfeksiyonlarda, Candida’ların tür düzeyinde tanımlanmasıve antifungal duyarlılık testlerinin yapılması gerektiğini,duyarlılık testi ile Candida’ların antifungal direnç profilleribelirlenerek ampirik tedavide yol gösterici olacağınıdüşündürtmüştür.
Anahtar Kelime: Konular:
The Distribution and Antifungal Susceptibilities of Candida Species Isolated from Blood Cultures
Öz: Objective: Candida species are the most common fungal pathogens causing infection in human beings, and their importance is increasing in parallel with the developments in diagnosis and treatment approaches in recent years. In this study, it was aimed to determine retrospectively the distribution and antifungal susceptibilities of Candida species isolated from blood cultures. Material and Methods: Yeast growth in blood cultures sent to Microbiology Laboratory of Duzce University, Research and Training Hospital, during January 2012-March 2018 period, were identified by germ tube formation, microscopic appearance on corn meal-Tween 80 agar and typing was performed using VITEK 2 Compact automated identification system. Susceptibilities of amphotericin B, voriconazole, fluconazole and micafungin were determined using the same automated system. Results: A total of 81 Candida isolates were identified as Candida albicans (55%), Candida parapsilosis (18%), Candida glabrata (12%), Candida tropicalis (12%), Candida lipolytica (2%) and Candida kefyr (1%). Of the isolates 7% were found to be resistant to amphotericin B, 12% to voriconazole, 11% to fluconazole, 19% to micafungin. Conclusion: In conclusion, in our study, the most frequently isolated species was C. albicans and among the non-albicans Candida species it was C. parapsilosis. It was observed that the antifungal resistance rates of isolates are quite different among species. This suggests that Candida species should be identified at the species level and antifungal susceptibility tests should be performed in invasive infections such as candidiasis and determining the antifungal resistance profiles of Candida species will guide the empirical therapy.
Anahtar Kelime: Konular:
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- 1. Yücel A, Kantarcıoğlu AS. Hastane kaynaklı (nozokomiyal) mantar infeksiyonlarının epidemiyolojisi. Cerrahpaşa J Med. 2001;32(4):259-69.
- 2. Hazen KC, Howell SA. Candida, Cryptococcus and other medically important yeasts. In: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Landry ML, Pfaller MA (Eds.) Manual of Clinical Microbiology. Washington: ASM Press, 2009:1762-88.
- 3. Kuzucu C, Yetkin G, Çalışkan A. Bir yıl içerisinde kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. Erciyes Tıp Derg. 2007;29(2):115-9.
- 4. Pappas PG. Invasive candidiasis. Infect Dis Clin North Am. 2006;20(3):485-506. https://doi.org/10.1016/j.idc.2006.07.004
- 5. Pfaller MA, Diekema DJ. Epidemiology of invasive candidiasis: a persistant public health problem. Clin Microbiol Rev. 2007;20(1):133-63. https://doi.org/10.1128/CMR.00029-06
- 6. Tan TY, Tan AL, Tee NW, Ng LS, Chee CW. The increased role of non-albicans species in candidemia: results from a 3 year surveillance study. Mycoses. 2010;53(6):515-21. https://doi.org/10.1111/j.1439-0507.2009.01746.x
- 7. Bayram Y, Gültepe B, Özlük S, Güdücüoğlu H. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Candida kökenlerinin identifikasyonu ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması. Van Tıp Derg. 2012;19(4):177-81.
- 8. Keçeli Özcan S, Mutlu B, Dündar D, Willke A. Kan kültürlerinden izole edilen Candida spp. suşlarının antifungal ilaçlara karşı duyarlılıklarının belirlenmesinde buyyon mikrodilisyon ile E-test yöntemlerinin karşılaştırılması. Mikrobiyol Bul. 2010;44(2):263-71.
- 9. Arıkan S, Rex JH. Antifungal agents. In: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Landry ML, Pfaller MA (Eds.) Manual of Clinical Microbiology. Washington: ASM Press, 2009:1949-60.
- 10. Boschman CR, Bodnar UR, Tornatore MA. Thirteenyear evolution of azole resistance in yeast isolates and prevalence of resistant strains carried by cancer patients at a large medical center. Antimicrobial Agent Chemother. 1998;4(42):734-8. https://doi.org/10.1128/AAC.42.4.734
- 11. Bakır M, Cerikçioğlu N, Barton R. Epidemiyology of Candida in Turkish tertiary care hospital. APMIS 2006;114(5):601-10. https://doi.org/10.1111/j.1600-0463.2006.apm_359.x
- 12. Pfaller MA, Diekema DJ, Procop GW. Multicenter comparison of the VITEK2 Yeast susceptibility test with the CLSI broth microdilution reference method for testing fluconazole against Candida spp. J Clin Microbiol. 2007;45(3):796-802. https://doi.org/10.1128/JCM.01986-06
- 13. CLSI. Clinical and Laboratory Standarts Institute. Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts; approved Standard-3rd ed document M27-A3. Clinical and Laboratory Standarts Institute, Wayne, USA, 2008.
- 14. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing Clinical Breakpoints-fungi (v7.0), www.eucast. org/clinical_breakpoints/ (erişim tarihi 01.01.2016).
- 15. Pfaller MA, Rex JH, Rinaldi MG. Antifungal susceptibility testing: Technical advances and potential clinical applications. Clin Infect Dis. 1997;24(5):776-84. https://doi.org/10.1093/clinids/24.5.776
- 16. Saran B, Karahan ZC, Ağırbaşlı H, Tekeli A, Aksoy AM. Candida albicans klinik izolatlarının “randomly amplified polymorphic DNA” yöntemiyle genotiplendirmesinde kullanılan farklı primerlerin karşılaştırılması. Mikrobiyol Bul. 2008;42(4):645-54.
- 17. Trick W, Fridkin SK, Edwards JR, Hajjeh RA, Gaynes RP, National Nosocomial Infections Surveillance System Hospitals. Secular trend of hospital-acquired candidemia among intensive care uni tpatients in the United States during 1989-1999. Clin Infect Dis. 2002;35(5):627-30. https://doi.org/10.1086/342300
- 18. Bedini A, Venturelli C, Mussini C, et al. Epidemiology of candidaemia and antifungal susceptibility patterns in an Italian tertiary-care hospital. Clin Microbiol Infect. 2006;12(1):75-80. https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2005.01310.x
- 19. Pullukçu H. Kandidemi. Bamçag Bülteni. 2011;2:1-7.
- 20. Akgün S, Sayıner HS, Kayalı S. Distribution of Candida species isolated from blood cultures over aperiod of four years. EJMI. 2018:2(1)35-9. https://doi.org/10.14744/ejmi.2018.68077
- 21. Alışkan HE, Bozkırlı ED, Çolakoğlu Ş, Demirbilek M. Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin incelenmesi. Türk Hij Den Biyol Derg. 2016;73(1):15-24. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2016.49369
- 22. Çalışkan E, Dede A, Biten Güven G. Kan kültürlerinde saptanan Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. ANKEM Derg. 2013;27(1):25-30. https://doi.org/10.5222/ankem.2013.025
- 23. Savcı Ü, Yılmaz N. Çeşitli örneklerden izole edilen Candidaların tür dağılımı ve antifungal direnç oranları. Turk J Clin Lab. 2017;8(3):85-90.
- 24. Ener B. Mantar infeksiyonlarında klinikten laboratuvara tanı sorunları. ANKEM Derg. 1998;12(3):248-52.
- 25. Johnson E, Espinel-Ingroff A, Szekelya A, Hockeyc H, Troked P. Activity of voriconazole, itraconazole, fluconazole and amphotericin B in vitro against 1763 yeasts from 472 patients in the voriconazole phase III clinical studies. Int J Antimicrob Agents. 2008;32(6):511-4. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2008.05.023
- 26. Kooshki P, Rezaei-Matehkolaei A, Mahmoudabadi AZ. The patterns of colonization and antifungal susceptibility of Candida, isolated from preterm neonates in Khorramabad, South West of Iran. J Mycol Med. 2018;5233(17):30355-4. https://doi.org/10.1016/j.mycmed.2018.02.010
- 27. Márquez F, Iturrieta I, Calvo M, Urrutia M, GodoyMartínez P. Epidemiology and antifungal susceptibility of species producing candidemia in Valdivia, Chile. Rev Chilena Infectol. 2017;34(5):441-6. https://doi.org/10.4067/S0716-10182017000500441
- 28. Etiz P, Kibar F, Ekenoğlu Y, Yaman A. Kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımının ve antifungal duyarlılıklarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. ANKEM Derg. 2015;29(3):105-13. https://doi.org/10.5222/ankem.2015.0105
- 29. Gültekin B, Eyigör M, Telli M, Aksoy M, Aydın N. Yedi yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin retrospektif olarak incelenmesi. ANKEM Derg. 2010;24(4):202-8.
- 30. Gültekin B, Eyigör M, Tiryaki Y, Kırdar S, Aydın N. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarında antifungal duyarlılığın ve bazı virülans faktörlerinin araştırılması ve RAPD-PCR ile genotiplendirilmesi. Mikrobiyol Bul. 2011;45(2):306-17.
- 31. Öztürk T, Özseven AG, Sesli Çetin E, Kaya S. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarının tiplendirilmesi ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması. Kocatepe Tıp Derg. 2013;14(1):17-22.
- 32. Hospenthal DR, Murray CK, Rinaldi MG. The role of antifungal susceptibility testing in the therapy of candidiasis. Diagn Microbiol Infect Dis. 2004;48(3):153- 60. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2003.10.003
- 33. Pfaller MA. Nosocomial candidiasis: emerging species, reservoirs, and modes of transmission. Clin Infect Dis. 1996;22(supp 2):S89-94. https://doi.org/10.1093/clinids/22.Supplement_2.S89
- 34. Yenişehirli G, Bulut Y, Günday E. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans suşlarında antifungallere duyarlılık. ANKEM Derg. 2007;21(3):146-9.
- 35. Zer Y, Balcı İ. Yoğun bakım ünitesindeki hastalardan izole edilen Candida suşlarının identifikasyonu ve antifungal duyarlılıkları. Turk Mikrobiyol Cem Derg. 2002;32(3-4):230-4.
- 36. Spiliopoulou A, Vamvakopoulou S, Bartzavali C, Dimitracopoulos G, Anastassiou ED, Christofidou M. Eleven-year retrospective survey of candidemia in a university hospital in South western Greece. Clin Microbiol Infect. 2010;16(9):1378-81. https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2010.03193.x
- 37. Santos ER, Dal Forno CF, Hernandez MG, et al. Susceptibility of Candida spp. Isolated from blood cultures as evulated using the M27-A3 and new M27- S4 approves breakpoints. Rev Inst Med Trop Sao Paulo. 2014;56(6):477-82. https://doi.org/10.1590/S0036-46652014000600004
- 38. Borg-von Zepelin M, Kunz L, Rüchel R, Reichard U, Weig M, Gross U. Epidemiology and antifungal susceptibilities of Candida spp. to six antifungal agents: results from a surveillance study on fungaemia in Germany from July 2004 to August 2005. J Antimicrob Chemother. 2007;60(2):424-8. https://doi.org/10.1093/jac/dkm145
- 39. Garnacho-Montero J, Diaz-Martín A, García-Cabrera E, et al. Risk factors for fluconazole-resistant candidemia. Antimicrob Agents Chemother. 2010;54(8):3149- 54. https://doi.org/10.1128/AAC.00479-10
- 40. Pfaller MA, Diekema DJ, International Fungal Surveillance Participant Group. Twelve years of fluconazole in clinical practice: global trends in species distribution and fluconazole susceptibility of blood stream isolates of Candida. Clin Microbiol Infect. 2004;10(Suppl1):S11-23. https://doi.org/10.1111/j.1470-9465.2004.t01-1-00844.x
- 41. Diekema DJ, Messer SA, Boyken LB, et al. In vitro activity of seven systemically active antifungal agents against a large global collection of rare Candida species as determined by CLSI broth microdilution methods. J Clin Microbiol. 2009;47(10):3170-7. https://doi.org/10.1128/JCM.00942-09
- 42. McCarty TP, Lockhart SR, Moser SA, et al. Echinocandin resistance among Candida isolates at an academic medical centre 2005-15: analysis of trends and outcomes. J Antimicrob Chemother. 2018;73(6):1677-80. https://doi.org/10.1093/jac/dky059
- 43. Arendrup MC, Dzajic E, Jensen RH, et al. Epidemiological changes with potential implication for antifungal prescription recommendations for fungaemia: data from a nationwide fungaemia surveillance programme. Clin Microbiol Infect. 2013;19(8):343- 53. https://doi.org/10.1111/1469-0691.12212
- 44. Pfaller MA, Diekema DJ, Gibbs DL, et al. Results from the ARTEMIS DISK Global Antifungal Surveillance Study, 1997 to 2007: a 10.5-year analysis of susceptibilities of Candida Species to fluconazole and voriconazole as determined by CLSI standardized disk diffusion. J Clin Microbiol. 2010;48(4):1366-77. https://doi.org/10.1128/JCM.02117-09
APA | Kılınçel Ö, AKAR N, karamurat d, CALISKAN E, ÖKSÜZ Ş, ÖZTÜRK C, Şahin İ (2018). Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. , 256 - 263. 10.5222/TMCD.2018.256 |
Chicago | Kılınçel Özge,AKAR Nida,karamurat dilara,CALISKAN Emel,ÖKSÜZ Şükrü,ÖZTÜRK CİHADİYE ELİF,Şahin İdris Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. (2018): 256 - 263. 10.5222/TMCD.2018.256 |
MLA | Kılınçel Özge,AKAR Nida,karamurat dilara,CALISKAN Emel,ÖKSÜZ Şükrü,ÖZTÜRK CİHADİYE ELİF,Şahin İdris Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. , 2018, ss.256 - 263. 10.5222/TMCD.2018.256 |
AMA | Kılınçel Ö,AKAR N,karamurat d,CALISKAN E,ÖKSÜZ Ş,ÖZTÜRK C,Şahin İ Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. . 2018; 256 - 263. 10.5222/TMCD.2018.256 |
Vancouver | Kılınçel Ö,AKAR N,karamurat d,CALISKAN E,ÖKSÜZ Ş,ÖZTÜRK C,Şahin İ Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. . 2018; 256 - 263. 10.5222/TMCD.2018.256 |
IEEE | Kılınçel Ö,AKAR N,karamurat d,CALISKAN E,ÖKSÜZ Ş,ÖZTÜRK C,Şahin İ "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları." , ss.256 - 263, 2018. 10.5222/TMCD.2018.256 |
ISNAD | Kılınçel, Özge vd. "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları". (2018), 256-263. https://doi.org/10.5222/TMCD.2018.256 |
APA | Kılınçel Ö, AKAR N, karamurat d, CALISKAN E, ÖKSÜZ Ş, ÖZTÜRK C, Şahin İ (2018). Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 48(4), 256 - 263. 10.5222/TMCD.2018.256 |
Chicago | Kılınçel Özge,AKAR Nida,karamurat dilara,CALISKAN Emel,ÖKSÜZ Şükrü,ÖZTÜRK CİHADİYE ELİF,Şahin İdris Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 48, no.4 (2018): 256 - 263. 10.5222/TMCD.2018.256 |
MLA | Kılınçel Özge,AKAR Nida,karamurat dilara,CALISKAN Emel,ÖKSÜZ Şükrü,ÖZTÜRK CİHADİYE ELİF,Şahin İdris Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, vol.48, no.4, 2018, ss.256 - 263. 10.5222/TMCD.2018.256 |
AMA | Kılınçel Ö,AKAR N,karamurat d,CALISKAN E,ÖKSÜZ Ş,ÖZTÜRK C,Şahin İ Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2018; 48(4): 256 - 263. 10.5222/TMCD.2018.256 |
Vancouver | Kılınçel Ö,AKAR N,karamurat d,CALISKAN E,ÖKSÜZ Ş,ÖZTÜRK C,Şahin İ Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2018; 48(4): 256 - 263. 10.5222/TMCD.2018.256 |
IEEE | Kılınçel Ö,AKAR N,karamurat d,CALISKAN E,ÖKSÜZ Ş,ÖZTÜRK C,Şahin İ "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları." Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 48, ss.256 - 263, 2018. 10.5222/TMCD.2018.256 |
ISNAD | Kılınçel, Özge vd. "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları". Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 48/4 (2018), 256-263. https://doi.org/10.5222/TMCD.2018.256 |