Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması

ASLAN, GÖNÜL; DİREKEL, ŞAHİN; EMEKDAŞ, Gürol; OTAĞ, Feza; ÇEBER, Kemal; BAYRAM ABİHA, GÜL; Taylan Ozkan, Aysegul

Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması

Gönül ASLAN, (Mersin Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mersin, Türkiye)

GÜL BAYRAM ABİHA, (Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Laboratuvar Hizmetleri Bölümü, Mersin.Türkiye)

Feza OTAĞ, (Mersin Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mersin, Türkiye)

Şahin DİREKEL, (Mersin Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mersin, Türkiye)

HİKMET AYŞEGÜL TAYLAN ÖZKAN, (Refik Saydam Hıfzıssıhha Merkezi Başkanlığı, Salgın Hastalıklar Araştırma Md. Parazitoloji Laboratuvarı, Ankara, Türkiye)

Kemal ÇEBER, (Niğde Devlet Hastanesi, Mikrobiyoloji Bölümü, Niğde.Türkiye)

Gürol EMEKDAŞ (Mersin Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mersin, Türkiye)

Mikrobiyoloji Bülteni

2 0

Yıl: 2012 Cilt: 46 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 93 - 100 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması

Öz:

Cryptosporidium, insan ve hayvanlarda enterit etkeni olan hücre içi bir protozoondur. Oral-fekal yolla bulaşan parazitin en önemli kaynağı kontamine su ve besinlerdir. Gelişmekte olan ülkelerde kriptosporidiyoz prevalansının gelişmiş ülkelere oranla daha yüksek olduğu ve bu durumun içme sularının sanitasyon ve dezenfeksiyonunda uygulanan kuralların yetersiz olmasından kaynaklandığı bildirilmektedir. Cryptosporidium türleri arasında en sık saptanan enfeksiyon etkeni Cryptosporidium parvum olup, enfeksiyon sağlıklı kişilerde yüksek morbidite, immün sistemi baskılanmış hastalarda ise yüksek mortalite ile seyredebilir. Kriptosporidiyozun laboratuvar tanısında genellikle aside dirençli boyama tekniği kullanılmaktadır. Günümüzde geliştirilen moleküler yöntemler sayesinde, epidemiyolojik verilerin elde edilmesine yönelik olarak su kaynaklarında ve asemptomatik taşıyıcılarda Cryptosporidium saptanması ve tür düzeyinde tanımlanması mümkün olmuştur. Bu çalışmada, Mersin ilindeki farklı su kaynaklarında Cryptosporidium ookistlerinin varlığının belirlenmesi ve bunların tiplendirilmesi amaçlanmıştır. Mart 2007-Mayıs 2009 tarihleri arasında gerçekleştirilen çalışmada, Mersin şehir merkezi (n= 25) ile Tarsus (n= 32), Mezitli (n= 33) ve Karaduvar (n= 45) ilçelerinden alınan toplam 135 farklı su kaynağına ait örnekler (70 musluk suyu, 50 kuyu suyu, 15 atık su) değerlendirilmiştir. Su örnekleri 10ar litrelik hacimlerde alınarak por çapı 0.45 μm olan selüloz asetat membran filtresi bulunan vakum pompalı filtrasyon cihazında süzülmüştür. Süzüntüden Cryptosporidium ookistleri, modifiye Kinyounnun aside dirençli (soğuk) boyama yöntemi (MKSA) ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile saptanmış ve RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) yöntemiyle tiplendirilmiştir. Çalışmamızda MKSA yöntemiyle üç, PCR ile yedi örnekte Cryptosporidium varlığı saptanmış ve tüm suşlar C.parvum olarak tanımlanmıştır. MKSA ile Cryptosporidium ookistlerinin saptandığı üç örneğin hepsi PCR ile de pozitif sonuç vermiş, buna karşın dört örnek MKSA ile negatif bulunmuştur. Buna göre bölgemizdeki su kaynaklarında C.parvum prevalansı %5.2 (7/135) olarak tespit edilmiştir. Pozitifliğin saptandığı yedi örnekten biri şehir merkezinden alınan atık su örneği, altısı (iki musluk suyu, iki kuyu suyu, iki atık su) ise Karaduvardan alınan örnekler olup, bu sonuç dikkat çekici bulunmuştur. Karaduvar bölgesinde parazit oranının yüksek (6/45; %13.3) olması, bölgedeki alt yapının yetersiz olmasından ve kuyu sularının içme ve kullanma suyu olarak kullanılmasından kaynaklandığını düşündürmektedir. Gelecekte planlanacak epidemiyolojik çalışmalarla Cryptosporidium spp. genotiplendirmesi ve filogenetik ilişkinin belirlenmesi bulaş kaynaklarının saptanmasında yararlı olacaktır.

Anahtar Kelime: Polimeraz zincir reaksiyonu Su Cryptosporidium parvum Cryptosporidium

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji

Investigation of the presence of Cryptosporidium spp. in different water sources in Mersin province, Turkey

Öz:

Cryptosporidium is an intracellular protozoon that causes enteritis in human and animals. Contaminated water and food are the major sources for the transmission of oocysts via oral-fecal route. It is reported that the prevalence of cryptosporidiosis is higher in developing countries than developed countries because of inefficient sanitation and disinfection facilities for drinking water. The most frequently detected species is Cryptosporidium parvum leading to high morbidity in healthy subjects and also fatal infections in immunocompromised patients. The acid-fast staining method is widely used in the diagnosis of cryptosporidiosis. Nowadays, Cryptosporidium could easily be detected in water supplies and asymptomatic carriers by molecular techniques to obtain epidemiological data. In this study it was aimed to detect and identify Cryptosporidium oocysts in different water sources in Mersin province, Turkey. A total of 135 water samples (70 taps, 50 wells and 15 sewage) collected from city center (n= 25) and from Tarsus (n= 32), Mezitli (n= 33) and Karaduvar (n= 45) counties between March 2007 and May 2009 were included in the study. Water samples in 10 liter volumes, were filtered by 0.45 μm pore-sized membrane filter vacuum/ pressure pumping technique. Cryptosporidium oocysts in filtrates were detected by modified cold Kinyoun acid-fast stain (MCK) technique and also identified and typed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. MCK yielded three and PCR yielded seven positive results. All the strains were identified as C.parvum by PCR-RFLP method. All of the three MCK-positive samples were also found positive with PCR, however four PCR positive samples were MCK-negative. Thus, the prevalence of C.parvum was estimated as 5.2% (7/135) in our region. Of seven positive samples, one was a sewage water sample collected from the city center, while the remaining (two tap water, two well water and two sewage water samples) belonged to the samples collected from Karaduvar county, interestingly. It was thought that deficient infrastructure and use of well water as drinking water supply in Karaduvar region might be the cause of high rate of Cryptosporidium (6/45; 13.3%). Further studies which will determine the genotypes and investigate the phylogenetic relationship between these Cryptosporidium spp., might aid to the epidemiology of cryptosporidiosis in our region.

Anahtar Kelime: Water Cryptosporidium parvum Cryptosporidium Polymerase Chain Reaction

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik

1. Fahey T. Cryptosporidiosis. Primary Care Update for OB/GYNS 2003; 10(2): 75-80.
2. Fayer R. Cryptosporidium: a water-borne zoonotic parasite. Vet Parasitol 2004; 126(1-2): 37-56.
3. Hunter PR, Nichols G. Epidemiology and clinical features of Cryptosporidium infections in immunocomprimised patients. Clin Microbiol Rev 2002; 15(1): 145-54.
4. Brescia CC, Griffin SM, Ware MW. Cryptosporidium propidium monoazide-PCR, a molecular biology-based technique for genotyping of viable Cryptosporidium oocysts. Appl Environ Microbiol 2009; 75(21): 6856-63.
5. Moulin L, Richard F, Stefania S, et al. Contribution of treated wastewater to the microbiological quality of Seine River in Paris. Water Res 2010; 44(18): 5222-31.
6. Redder A, Dürr M, Daeschlein G, et al. Constructed wetlands-Are they safe in reducing protozoan parasites? Int J Hyg Environ Health 2010; 213(1): 72-7.
7. Garcia LS (ed). Diagnostic Medical Parasitology, pp: 30-60. 2001, 4th ed. ASM Press, Washington DC.
8. Sungur T, Kar S, Güven E, Aktaş M, Karaer Z, Vatansever Z. Detection of Cryptosporidium spp. in feces with nested PCR and carbol fuchsin staining method. Turkiye Parazitol Derg 2008; 32(4): 305-8.
9. Dirim Erdoğan D, Dağci H, Turgay N, Akarca US, Alkan MZ. The molecular diagnosis of cryptosporidiosis in fresh and formalin preserved fecal samples. Turkiye Parazitol Derg 2009; 33(2): 120-4.
10. Carraway M, Tzipori S, Widmer G. Identification of genetic heterogenity in the Cryptosporidium parvum ribosomal repeat. Appl Environ Microbiol 1996; 62(2): 712-6.
11. Robertson LJ, Campbell AT, Smith HV. Survival of Cryptosporidium parvum oocysts under various environmental pressures. Appl Environ Microbiol 1992; 58(11): 3494-500.
12. Lowery CJ, Moore JE, Millar BC, et al. Detection and speciation of Cryptosporidium spp. in environmental water samples by immunomagnetic separation, PCR and endonuclease restriction. J Med Microbiol 2000; 49(9): 779-85.
13. Fayer R, Lewis EJ, Trout JM, et al. Cryptosporidium parvum in oysters from Commercial harvesting sites in the Chesapeake Bay. Emerg Infect Dis 1999; 5(5): 706-10.
14. Mead PS, Slutsker L, Dietz V, et al. Food-related illness and death in the United States. Emerg Infect Dis 1999; 5(5): 607-25.
15. Mac Kenzie WR, Hoxie NJ, Proctor ME, et al. A massive outbreak in Milwaukee of Cryptosporidium infection transmitted through the public water supply. N Engl J Med 1994; 331(3): 161-7.
16. Robertson LJ, Gjerde B. Occurrence of Cryptosporidium oocysts and Giardia cysts in raw waters in Norway. Scand J Public Health 2001; 29(3): 200-7.
17. Ono K, Tsuji H, Rai SK, et al. Contamination of river water by Cryptosporidium parvum oocysts in western Japan. Appl Environ Microbiol 2001; 67(9): 3832-6.
18. Rose JB, Gerba CP, Jakubowski W. Survey of potable water supplies for Cryptosporidium and Giardia. Environ Sci Technol 1991; 25(8): 1393-400.
19. Liu A, Ji H, Wang E, et al. Molecular identification and distribution of Cryptosporidium and Giardia duodenalis in raw urban wastewater in Harbin, China. Parasitol Res 2011; 109(3): 913-8.
20. Doğan N, Sağlik I. Cyclospora cayetanensis and Cryptosporidium parvum coinfection in a pregnant woman with prolonged diarrhoea. Mikrobiyol Bul 2010; 44(1): 155-9.
21. Otağ F, Aslan G, Emekdaş G, Aydın E, Özkan AT, Çeber K. Mersin ilinde ilkokul öğrencilerinde Cryptosporidium spp. ookistlerinin araştırılması. Turkiye Parazitol Derg 2007; 31(1): 17-9.
22. Ceber K, Aslan G, Otağ F, et al. Investigation of Cryptosporidium spp. oocysts in tap water, well water, sewage water and sea water in Mersin, Turkey. Turkiye Parazitol Derg 2005; 29(4): 224-8.
23. Bakir B, Tanyuksel M, Saylam F. Investigation of waterborne parasites in drinking water sources of Ankara. J Microbiol 2003; 41(2): 148-51.
24. Köksal F. Kaynak sularının Cryptosporidium ve Giardia yönünden incelenmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2002; 32(3-4): 275-7.
25. Över U, Söyletir G. İshalle seyreden hastalıklarda kriptosporidyumun rolü. FLORA 1997; 2(2): 98-104.
26. Akyön Y, Ergüven S, Arikan S, Yurdakök K, Günalp A. Cryptosporidium parvum prevalence in a group of Turkish children. Turk J Pediatr 1999; 41(2):189-96.
27. Babür C, Kılıç S, Taylan Ozkan A, Esen B. Refik Saydam Hıfzıssıhha Merkezi Başkanlığı Parazitoloji Laboratuvarında 1995-2000 yıllarında saptanan bağırsak parazitlerinin değerlendirilmesi. Turkiye Parazitol Derg 2002; 26(3): 286-91.
28. Nihal Doğan N, Demirüstü C, Aybey A. The prevalence of intestinal parasites according to the distribution of the patients gender and parasite species for five years at the Osmangazi University Medical Faculty. Turkiye Parazitol Derg 2008; 32(2): 120-5.
29. Uyar Y, Taylan Ozkan A. Antigen detection methods in diagnosis of amebiasis, giardiasis and cryptosporidiosis. Turkiye Parazitol Derg 2009; 33(2): 140-50.
30. Xiao L. Molecular epidemiology of cryptosporidiosis: an update. Exp Parasitol 2010; 124(1): 80-9.
31. Feng Y, Li N, Duan L, Xiao L. Cryptosporidium genotype and subtype distribution in raw wastewater in Shanghai, China: evidence for possible unique Cryptosporidium hominis transmission. J Clin Microbiol 2009; 47(1): 153-7.

APA	ASLAN G, BAYRAM ABİHA G, OTAĞ F, DİREKEL Ş, Taylan Ozkan A, ÇEBER K, EMEKDAŞ G (2012). Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması. , 93 - 100.
Chicago	ASLAN GÖNÜL,BAYRAM ABİHA GÜL,OTAĞ Feza,DİREKEL ŞAHİN,Taylan Ozkan Aysegul,ÇEBER Kemal,EMEKDAŞ Gürol Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması. (2012): 93 - 100.
MLA	ASLAN GÖNÜL,BAYRAM ABİHA GÜL,OTAĞ Feza,DİREKEL ŞAHİN,Taylan Ozkan Aysegul,ÇEBER Kemal,EMEKDAŞ Gürol Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması. , 2012, ss.93 - 100.
AMA	ASLAN G,BAYRAM ABİHA G,OTAĞ F,DİREKEL Ş,Taylan Ozkan A,ÇEBER K,EMEKDAŞ G Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması. . 2012; 93 - 100.
Vancouver	ASLAN G,BAYRAM ABİHA G,OTAĞ F,DİREKEL Ş,Taylan Ozkan A,ÇEBER K,EMEKDAŞ G Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması. . 2012; 93 - 100.
IEEE	ASLAN G,BAYRAM ABİHA G,OTAĞ F,DİREKEL Ş,Taylan Ozkan A,ÇEBER K,EMEKDAŞ G "Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması." , ss.93 - 100, 2012.
ISNAD	ASLAN, GÖNÜL vd. "Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması". (2012), 93-100.

APA	ASLAN G, BAYRAM ABİHA G, OTAĞ F, DİREKEL Ş, Taylan Ozkan A, ÇEBER K, EMEKDAŞ G (2012). Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, 46(1), 93 - 100.
Chicago	ASLAN GÖNÜL,BAYRAM ABİHA GÜL,OTAĞ Feza,DİREKEL ŞAHİN,Taylan Ozkan Aysegul,ÇEBER Kemal,EMEKDAŞ Gürol Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni 46, no.1 (2012): 93 - 100.
MLA	ASLAN GÖNÜL,BAYRAM ABİHA GÜL,OTAĞ Feza,DİREKEL ŞAHİN,Taylan Ozkan Aysegul,ÇEBER Kemal,EMEKDAŞ Gürol Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.46, no.1, 2012, ss.93 - 100.
AMA	ASLAN G,BAYRAM ABİHA G,OTAĞ F,DİREKEL Ş,Taylan Ozkan A,ÇEBER K,EMEKDAŞ G Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2012; 46(1): 93 - 100.
Vancouver	ASLAN G,BAYRAM ABİHA G,OTAĞ F,DİREKEL Ş,Taylan Ozkan A,ÇEBER K,EMEKDAŞ G Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2012; 46(1): 93 - 100.
IEEE	ASLAN G,BAYRAM ABİHA G,OTAĞ F,DİREKEL Ş,Taylan Ozkan A,ÇEBER K,EMEKDAŞ G "Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması." Mikrobiyoloji Bülteni, 46, ss.93 - 100, 2012.
ISNAD	ASLAN, GÖNÜL vd. "Mersin ilinde farklı su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması". Mikrobiyoloji Bülteni 46/1 (2012), 93-100.