Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması

Karvar, Şinasi; Delialioğlu, Nuran

doi:10.5578/flora.20239703

Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması

Şinasi KARVAR, (Sağlık Bilimleri Üniversitesi Van Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Kliniği, Van, Türkiye)

Nuran DELİALİOĞLU (Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mersin, Türkiye)

Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi

11 1

Yıl: 2023 Cilt: 28 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 331 - 340 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/flora.20239703 İndeks Tarihi: 28-10-2023

Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması

Öz:

Giriş: Günümüzde malignite, kemoterapi, immünsüpresif tedavilerin artması ve yoğun bakım ünitelerinde uzayan yatış süreleri kandidemi insidansında artışa neden olmuştur. En sık kandidemi etkeni olarak Candida albicans görülmekle birlikte son yıllarda yapılan çalışmalar C. albicans dışı türlerde izolasyon sıklığının arttığını göstermiştir. Ayrıca tedavide kullanılan antifungal ilaçlara karşı direnç sorunu görülmeye başlamıştır. Bu sebeple tedavi seçiminde mayaların türü ve antifungal duyarlılığın bilinmesi önemlidir. Bu çalışmada kan kültürlerinden izole edilen Candidaların tür dağılımı ve antifungal duyarlılıklarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Materyal ve Metod: Mersin Üniversitesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına 01.01.2020 ile 31.12.2020 tarihleri arasında gönderilen kan kültürlerinden izole edilen 110 Candida izolatının tanımlanması klasik yöntemler ve VITEK 2 YST maya tanımlama panelleri (bioMerieux, Fransa) kullanılarak yapıldı. İzolatların antifungal (amfoterisin B, flukonazol, vorikonazol, itrakonazol, mikafungin ve anidulafungin) duyarlılıkları EUCAST referans sıvı mikrodilüsyon yöntemi kullanılarak çalışıldı. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen izolatların 39 (%35.5)’u kadın, 71 (%64.5)’i erkek hastaya ait kan kültürlerinden izole edilmiştir. Çalışmada kan kültüründen en sık izole edilen tür C. parapsilosis 48 (%43.6), bunu takiben C. albicans 29 (%26.3), C. tropicalis 16 (%14.5), C. glabrata 15 (%13.6) ve C. krusei 2 (%1.8) olarak bulunmuştur. C. parapsilosis için direnç oranları: flukonazol %16.6, vorikonazol %8.3 ve anidulafungin %8.3, amfoterisin B %4.3, mikafungin %6.2 ve itrakonazol %6.2 olarak; C. albicans için direnç oranları: amfoterisin B %10.4, flukonazol %3.5, vorikonazol %3.4, itrakonazol %3.4, mikafungin %3.4 ve anidulafungin %3.4 olarak; C. tropicalis için direnç oranları: flukonazol %25, amfoterisin B %18.8, itrakonazol %18.8, anidulafungin %6.3 olarak; C. glabrata için direnç oranları: amfoterisin B %18.8, flukonazol %6.7 olarak tespit edilmiştir. C. tropicalis izolatlarında vorikonazole, C. glabrata izolatlarında ise mikafungin ve anidulafungine direnç bulunmamıştır. Sonuç: Çalışmamızda kandidemi vakalarından en sık C. parapsilosis’in izole edildiği ve flukonazol direncinin diğer antifungallere göre daha yüksek olduğu saptanmıştır. Candida infeksiyonlarında etkenin tür düzeyinde saptanması ve antifungal duyarlılığının araştırılmasının tedavinin etkinliği ve direnç gelişiminin önlenmesi açısından yararlı olacağı düşünülmektedir.

Anahtar Kelime: Maya Candida türleri Kandidemi Antifungal duyarlılık

Evaluation of Species Distribution and Antifungal Susceptibility of Candida Species Isolated from Blood Culture

Öz:

Introduction: Today, the increase in malignancy, chemotherapy, immunosuppressive treatments, and prolonged hospitalization in intensive care units have caused an increase in the incidence of candidemia. Although Candida albicans is the most common cause of candidemia, recent studies have shown an increased frequency of isolation in non-C. albicans species. In addition, resistance to anti- fungal drugs used in treatment has started to emerge. Consequently, it is important to identify the yeast type and assess antifungal susceptibility when selecting appropriate treatment. This study aims to determine the distribution of Candida species and their suscep- tibility to antifungal agents in Candida spp. isolated from blood cultures. Materials and Methods: Identification of 110 Candida isolated from blood cultures sent to Mersin University Hospital Medical Microbiology Laboratory between 01.01.2020 and 31.12.2020 was performed by using classical methods and VITEK 2 YST yeast identification panels (bioMerieux, France). Antifungal (amphotericin B, fluconazole, voriconazole, itraconazole, micafungin, and anidu- lafungin) susceptibilities of the isolates were studied by using the EUCAST reference broth microdilution method. Results: The strains included in the study were isolated from blood cultures of 39 (35.5%) female and 71 (64.5%) male patients. The most frequently isolated species from the blood cultures in the study was C. parapsilosis 48 (43.6%), followed by C. albicans 29 (26.3%), C. tropicalis 16 (14.5%), C. glabrata 15 (13.6%) and C. krusei 2 (1.8%). Resistance rates for C. parapsilosis were determined as follows: fluconazole 16.6%, voriconazole 8.3%, anidulafungin 8.3%, amphotericin B 4.3%, micafungin 6.2%, and itraconazole 6.2%. For C. albicans, the resistance rates were as follows: amphotericin B 10.4%, fluconazole 3.5%, voriconazole 3.4%, itraconazole 3.4%, micafungin 3.4%, and anidulafungin 3.4%. As for C. tropicalis, the resistance rates observed were as follows: fluconazole 25%, amphotericin B 18.8%, itraconazole 18.8%, and anidulafungin 6.3%. Lastly, for C. glabrata, the resistance rates were as follows: amphotericin B 18.8% and fluconazole 6.7%. There was no resistance to voriconazole among C. tropicalis isolates, and no resistance to micafungin and anidulafungin among C. glabrata isolates. Conclusion: C. parapsilosis has been identified as the most commonly isolated species in cases of candidemia, and our study has shown a higher resistance rate to fluconazole compared to other antifungal agents. The findings suggest that identifying the specific species in Candida infections and assessing their antifungal susceptibility could be advantageous in terms of treatment effectiveness and pre- vention of resistance development.

Anahtar Kelime: Yeast Candida species Candidemia Antifungal susceptibility

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Murray PR, Rosenthal KS, Pfaller MA. Opportunistic mycoses. In: Murray PR, Rosenthal KS, Pfaller MA (eds). Medical Microbiology (9th ed.) Philadelphia: Elsevier Saunders 2021:649-74.
2. Edwards JE Jr. Candida species. In: Mandell G, Bennett JE, Dolin R (eds). Mandell, Douglas, and Bennett’s principles and practice of infectious diseases (7th ed.) Philadelphia: Elsevier 2009:3225-41. https://doi.org/10.1016/B978-0- 443-06839-3.00257-5
3. Taei M, Chadeganipour M, Mohammadi R. An alarming rise of non-albicans Candida species and uncommon yeasts in the clinical samples; a combination of various molecular techniques for identification of etiologic agents. BMC Res Notes 2019;12:1-7. https://doi.org/10.1186/s13104- 019-4811-1
4. Hazen KC. New and emerging yeast pathogens. Clin Microbiol Rev 1995;8:462-78. https://doi.org/10.1128/ CMR.8.4.462
5. Arastehfar A, Daneshnia F, Hafez A, Khodavaisy S, Najafzadeh MJ, Charsizadeh A, et al. Antifungal susceptibility, genotyping, resistance mechanism, and clinical profile of Candida tropicalis blood isolates. Med Mycol 2020;58:766-73. https://doi.org/10.1093/mmy/myz124
6. Arendrup MC, Meletiadis J, Mouton JW, Lagrou K, Hamal P, Guinea J, et al. Method for the determination of broth dilution minimum inhibitory concentrations of antifungal agents for yeasts. EUCAST E.DEF 7.3.2 2020;1-21.
7. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Available from: https://www.eucast.org/ fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/AFST/Files/EUCAST_E_Def_7.3.2_Yeast_testing_definitive_revised_2020. pdf (Accessed date: 09.06.2022).
8. Epelbaum O, Chasan R. Candidemia in the intensive care unit. Clin Chest Med 2017;38:493-509. https://doi. org/10.1016/j.ccm.2017.04.010
9. Pfaller MA, Diekema DJ. Epidemiology of invasive candidiasis: A persistent public health problem. Clin Microbiol Rev 2007;20:133-63. https://doi.org/10.1128/CMR.00029- 06
10. Alışkan HE, Bozkirli ED, Çolakoğlu Ş, Demirbilek M. Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. Turk Hij Den Biyol Derg 2016;73:15-24. https://doi. org/10.5505/TurkHijyen.2016.49369
11. Antinori S, Milazzo L, Sollima S, Galli M, Corbellino M. Candidemia and invasive candidiasis in adults: A narrative review. Eur J Intern Med 2016;34:21-8. https://doi. org/10.1016/j.ejim.2016.06.029
12. Yapar N. Epidemiology and risk factors for invasive candidiasis. Ther Clin Risk Manag 2014;10:95-105. https://doi. org/10.2147/TCRM.S40160
13. Pfaller MA, Diekema DJ; International Fungal Surveillance Participant Group. Twelve years of fluconazole in clinical practice: Global-trends in species distribution and fluconazole susceptibility of bloodstream isolates of Candida. Clin Microbiol Infect 2004;10:11-23. https://doi. org/10.1111/j.1470-9465.2004.t01-1-00844.x
14. Bakır M, Cerikcioglu N, Barton R, Yagci A. Epidemiology of Candidemia in a Turkish tertiary care hospital. Apmis 2006;114:601-10. https://doi. org/10.1111/j.1600-0463.2006.apm_359.x
15. Yapar N, Pullukcu H, Avkan Oguz V, Sayın Kutlu S, Ertugrul B, Sacar S, et al. Evaluation of species distribution and risk factors of candidemia: A multicenter case-control study. Med Mycol 2010;49:26-31. https://doi. org/10.3109/13693786.2010.501344
16. Mutlu Sarıgüzel F, Koç AN, Karagöz S. Kan kültürlerinden izole edilen maya türlerinin Vitek 2 sistemi ile tanımlanması ve antifungal duyarlılıkları. Harran Üni Tıp Fak Derg 2015;12:261-8.
17. Kuşoğlu H, Besli Y, Gündeş S, Akyar I. İki yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin tiplendirilmesi ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması. 7. Türkiye Ekmud Uluslararası Kongresi 2018; PS-013.
18. Er H, Özkalay Yılmaz N, Karaca Derici Y, Hancı S, Saba Çopur Ş. Kandidemi etkenlerinin tür dağılımı ve duyarlılıkları: Hastanemizde ampirik antifungal tedavi politikası değiştirilmeli mi? Türk Mikrobiyol Cemiy Derg 2021;51:150-5.
19. Etiz P, Kibar F, Ekenoğlu Y, Yaman A. Kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımının ve antifungal duyarlılıklarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. ANKEM Derg 2015;29:105-13.
20. Otağ F, Aslan G, Şen S, Özturhan H, Emekdaş G. 2003- 2005 süresinde klinik örneklerden izole edilen maya türlerinin değerlendirilmesi. İnfeksiyon Derg 2005;19:435-43.
21. Kaur R, Dhakad MS, Goyal R, Haque A, Mukhopadhyay G. Identification and antifungal susceptibility testing of Candida species: A comparison of Vitek-2 system with conventional and molecular methods. J Glob Infect Dis 2016;8:139- 46. https://doi.org/10.4103/0974-777X.192969
22. Vazquez JA, Sobel JD. Candidiasis. In: Kauffman CA, Pappas PG, Sobel JD DW (eds). Essentials of clinical mycology. New York: Springer New York, 2011:162-206. https://doi. org/10.1007/978-1-4419-6640-7_11
23. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts; approved standard-third edition. Available from: https://clsi.org/media/1461/m27a3_sample. pdf (Accessed date: 09.06.2022).
24. Márquez F, Iturrieta I, Calvo M, Urrutia M, GodoyMartínez P. Epidemiology and antifungal susceptibility of species producing candidemia in Valdivia, Chile. Rev Chil Infectol 2017;34:441-6. https://doi.org/10.4067/S0716- 10182017000500441
25. Zer Y, Balcı İ. Yoğun bakım ünitesindeki hastalardan izole edilen candida suşlarının identifikasyonu ve antifungal duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cemiy Derg 2002;32:230-4.
26. Kılınçel Ö, Akar N, Karamurat ZD, Çalışkan E, Öksüz Ş, Öztürk CE, ve ark. Kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cemiy Derg 2018;48:256-63.
27. Garnacho-Montero J, Díaz-Martín A, García-Cabrera E, Ruiz Pérez de Pipaon M, Hernandez-Caballero C, Aznar-Martin J, et al. Risk factors for fluconazole-resistant candidemia. Antimicrob Agents Chemother 2010;54:3149-54. https:// doi.org/10.1128/AAC.00479-10
28. Boschman CR, Bodnar UR, Tornatore MA, Obias AA, Noskin GA, Englund K, et al. Thirteen-year evolution of azole resistance in yeast isolates and prevalence of resistant strains carried by cancer patients at a large medical center. Antimicrob Agents Chemother 1998;42:734-8. https://doi. org/10.1128/AAC.42.4.734
29. Borg-von Zepelin M, Kunz L, Rüchel R, Reichard U, Weig M, Gross U. Epidemiology and antifungal susceptibilities of Candida spp. to six antifungal agents: Results from a surveillance study on fungaemia in Germany from July 2004 to August 2005. J Antimicrob Chemother 2007;60:424-8. https://doi.org/10.1093/jac/dkm145
30. Öztürk T, Gül Özseven A, Sesli Çetin E, Kaya S. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarının tiplendirilmesi ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması. Kocatepe Tıp Derg 2013;14:17-22.
31. Tortorano AM, Prigitano A, Biraghi E, Viviani MA; FIMUA-ECMM Candidaemia Study Group. The European Confederation of Medical Mycology (ECMM) survey of candidaemia in Italy: In vitro susceptibility of 375 Candida albicans isolates and biofilm production. J Antimicrob Chemother 2005;56:777-9. https://doi.org/10.1093/jac/dki310
32. Kooshki P, Rezaei-Matehkolaei A, Mahmoudabadi AZ. The patterns of colonization and antifungal susceptibility of Candida, isolated from preterm neonates in Khorramabad, South West of Iran. J Mycol Med 2018;28:340-4. https:// doi.org/10.1016/j.mycmed.2018.02.010
33. Pfaller MA, Messer SA, Woosley LN, Jones RN, Castanheira M. Echinocandin and triazole antifungal susceptibility profiles for clinical opportunistic yeast and mold isolates collected from 2010 to 2011: Application of new CLSI clinical breakpoints and epidemiological cutoff values for characterization of geographic. J Clin Microbiol 2013;51:2571- 81. https://doi.org/10.1128/JCM.00308-13
34. Pfaller MA, Boyken L, Hollis RJ, Kroeger J, Messer SA, Tendolkar S, et al. In vitro susceptibility of invasive isolates of Candida spp. to anidulafungin, caspofungin, and micafungin: Six years of global surveillance. J Clin Microbiol 2008;46:150-6. https://doi.org/10.1128/JCM.01901-07
35. Diekema DJ, Messer SA, Boyken LB, Hollis RJ, Kroeger J, Tendolkar S, et al. In vitro activity of seven systemically active antifungal agents against a large global collection of rare Candida species as determined by CLSI broth microdilution methods. J Clin Microbiol 2009;47:3170-7. https://doi. org/10.1128/JCM.00942-09
36. McCarty TP, Lockhart SR, Moser SA, Whiddon J, Zurko J, Pham CD, et al. Echinocandin resistance among Candida isolates at an academic medical centre 2005-15: Analysis of trends and outcomes. J Antimicrob Chemother 2018;73:1677-80. https://doi.org/10.1093/jac/dky059
37. Sig AK, Sonmezer MC, Gülmez D, Duyan S, Uzun Ö, Arikan Akdagli S. The emergence of echinocandin-resistant Candida glabrata exhibiting high mics and related fks mutations in Turkey. J Fungi 2021;7:4-9. https://doi.org/10.3390/ jof7090691
38. Pfaller MA, Moet GJ, Messer SA, Jones RN, Castanheira M. Candida bloodstream infections: Comparison of species distributions and antifungal resistance patterns in community-onset and nosocomial isolates in the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program, 2008-2009. Antimicrob Agents Chemother 2011;55:561-6. https://doi.org/10.1128/ AAC.01079-10

APA	Karvar Ş, Delialioğlu N (2023). Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması. , 331 - 340. 10.5578/flora.20239703
Chicago	Karvar Şinasi,Delialioğlu Nuran Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması. (2023): 331 - 340. 10.5578/flora.20239703
MLA	Karvar Şinasi,Delialioğlu Nuran Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması. , 2023, ss.331 - 340. 10.5578/flora.20239703
AMA	Karvar Ş,Delialioğlu N Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması. . 2023; 331 - 340. 10.5578/flora.20239703
Vancouver	Karvar Ş,Delialioğlu N Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması. . 2023; 331 - 340. 10.5578/flora.20239703
IEEE	Karvar Ş,Delialioğlu N "Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması." , ss.331 - 340, 2023. 10.5578/flora.20239703
ISNAD	Karvar, Şinasi - Delialioğlu, Nuran. "Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması". (2023), 331-340. https://doi.org/10.5578/flora.20239703

APA	Karvar Ş, Delialioğlu N (2023). Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 28(3), 331 - 340. 10.5578/flora.20239703
Chicago	Karvar Şinasi,Delialioğlu Nuran Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 28, no.3 (2023): 331 - 340. 10.5578/flora.20239703
MLA	Karvar Şinasi,Delialioğlu Nuran Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, vol.28, no.3, 2023, ss.331 - 340. 10.5578/flora.20239703
AMA	Karvar Ş,Delialioğlu N Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2023; 28(3): 331 - 340. 10.5578/flora.20239703
Vancouver	Karvar Ş,Delialioğlu N Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2023; 28(3): 331 - 340. 10.5578/flora.20239703
IEEE	Karvar Ş,Delialioğlu N "Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması." Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 28, ss.331 - 340, 2023. 10.5578/flora.20239703
ISNAD	Karvar, Şinasi - Delialioğlu, Nuran. "Kan Kültüründen İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılığının Araştırılması". Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 28/3 (2023), 331-340. https://doi.org/10.5578/flora.20239703