Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region

AGCA, HARUN; Kazak, Esra; mıstık, reşit

Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region

Harun AĞCA, (Uludağ Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Bursa, Türkiye)

Reşit MISTIK, (Uludağ Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı, Bursa, Türkiye)

Esra KAZAK (Uludağ Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı, Bursa, Türkiye)

Journal of Clinical and Analytical Medicine

0 0

Yıl: 2015 Cilt: 6 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 190 - 192 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region

Öz:

Amaç: Hepatit C virüsü, dünyada ve ülkemizde hepatit, siroz ve hepatosellüler karsinomun önemli bir nedenidir. Altı genotipi ve 100 civarında türümsü tanımlanmış olan HCV enfeksiyonun seyri ve tedaviye yanıtı genotip ileilişkilidir. HCV genotiplerinin bilinmesi epidemiyolojik verilerin belirlenmesi açısından da önemlidir. Bu çalışmada Güney Marmara Bölgesinin referans merkezi olan Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen HCV genotiplerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışma Temmuz 2010- Aralık 2012 döneminde laboratuvarımıza genotipleme için gönderilen HCV enfeksiyonu olan hastaların serum örnekleri ile retrospektif olarak yapıldı. Çalışmada HCV RNA içinRotor-Gene Q (Qiagene, Hilden Germany) cihazında Artus HCV QS-RGQ PCRkiti (Qiagene,Hilden, Germany) kullanıldı. HCV RNA pozitif bulunan hastalarda Linear Array HCV genotyping test (Roche, NJ, USA) kiti ile HCV genotip çalışması gerçekleştirildi. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 231 hastadan214ü (%92.6) genotip 1, biri (%0.4) genotip 2, dokuzu (%3.9) genotip 3, yedisi (%3.1) genotip 4 olarak bulundu. Genotipi 3 olan hastalardan üçünün yabancı uyruklu, ikisinin ise yurt dışında doğmuş olduğu, genotip 4 olan hastalardan birisinin de yurt dışında doğmuş olduğu belirlendi. Tartışma: Ülkemizverileriyle uyumlu olarak en yaygın görülen genotipin 1 olduğu, genotip 3ünözellikle yurtdışıyla ilişkili hastalarda pozitif olduğu, genotip 4ün ise daha azgörüldüğü belirlendi. Ülkemizde ve bölgemizde en sık olduğu saptanan genotip 1in önemi ; kronik hepatit C hastalığında antiviral tedaviye direncin fazlaolması ve daha uzun süre tedavi gerektirmesidir.

Anahtar Kelime:

Konular: Genel ve Dahili Tıp

Güney Marmara Bölgesinde Hepatit C Virüs Genotiplerinin Dağılımı

Öz:

Aim: Hepatitis C virus (HCV) is an important caustive agent of hepatitis, cirrhosis and hepatocellular carcinoma both in our country and the world. Prognosis and response to treatment is related with the genotype of HCV whichhas six genotypes and over a hundred quasispecies. Knowing the HCV genotype is also important for epidemiological data. In this study we aimed toinvestigate the HCV genotypes of samples sent to Uludağ University HospitalMicrobiology Laboratory which is the reference centre in the South MarmaraRegion. Material and Method: This study was done retrospectively to analysethe HCV patients sera sent to our laboratory between July 2010and Decem- ber 2012 for HCV genotyping. Artus HCV QS-RGQ PCR kit (Qiagene,Hilden,Germany) was used in Rotor-Gene Q (Qiagene, Hilden Germany) for detectionof HCV RNA. HCV RNA positive samples of patients sera were were used forgenotyping by the Linear Array HCV genotyping test (Roche, NJ, USA).Results:214 (92.6 %) of total 231 patients included in the study were genotype 1,one (0.4 %) was genotype 2, nine (3.9 %) were genotype 3 and, seven (3.4%) were found genotype 4. Three of genotype 3 patients were of foreignnationality, two were born abroad and one of the genotype 4 patients wereborn abroad. Discussion: Concordant with our country data the most frequentgenotype was 1, genotype 2 was seen in patients especially related withforeign countries and genotype 4 was seen rare. The importance of genotype1, which is seen more frequent in our country and region is; resistance toantiviral treatment and prolonged treatment duration in chronic hepatitisC patients.

Anahtar Kelime:

Konular: Genel ve Dahili Tıp

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Lee CM, Hung CH, Lu SN, Changchien CS. Hepatitis C virus genotypes: clinical relevance and therapeutic implications. Chang Gung Med J 2008;31:16-25.
2. Schröter M, Zöllner B, Schäfer P, Landt O, Lass O, Laufs R et al. Genotyping of hepatitis C virus types 1, 2, 3 and 4 by one-step LigthCycler method using three different pairs of hybridization probes. J Clin Microbiol 2002;40(6):2046-50.
3. Krekulova L, Rehak V, Wakil AE, Haris E, Riley LW. Nested restriction site-specific PCR to detect and type hepatitis C virus (HCV): A rapid method to distinguish HCV subtype 1b from other genotypes. J Clin Microbiol 2001;39:1774-80.
4. Martial J, Morice Y, Abel S, Cabie A, Rat C, Lombard F et al. Hepatitis C virus (HCV) genotypes in the Caribbean island of Martinique: Evidence for a large radiation of HCV-2 and for a recent introduction from Europe of HCV-4. J Clin Microbiol 2004;42(2):784-91.
5. Aman W, Mousa S, Shiha S, Mousa SA. Current status and future directions in the management of chronic hepatitis C. Virol J 2012;9:57.
6. Jacobson IM, Marcellin P, Zauzem S, Sulkowski MS, Esteban R, Poordad F et al. Refinement of stopping rules during treatment of hepatitis C genotype 1 infection with boceprevir and peginterferon/ribavirin. Hepatology 2012;56(2):567-75.
7. Sherman KE, Flamm SL, Afdhal NH, Nelson DR, Sulkowski MS, Everson GT et al. Response-guided telaprevir combination treatment for hepatitis C virus infection. N Engl J Med 2011;365:1014-24.
8. Hawkins A, Davidson F, Simmonds P. Comparison of plasma virus loads among individuals infected with hepatitis C virus (HCV) genotype 1, 2 and 3 by Quantiplex HCV RNA asay versions 1 and 2, Roche monitör assay and an in-house limiting dilution method. J Clin Microbiol 1997;35:187-92.
9. Mutlu G, İmir T, Cengiz AT, Ustaçelebi Ş, Tümbay E, Mete Ö editors. Temel ve Klinik Mikrobiyoloji. Ankara: Güneş Kitabevi Ltd. Şti; 1997.p.881-93.
10. Abacıoglu YH, Davidson F, Tuncer S, Yap PL, Ustacelebi S, Yulug N et al. The distribution of hepatitis C virus genotypes in Turkish patients. J Viral Hepat 1995;2(6):297-301.
11. Şanlıdağ T, Akçalı S, Özbakkaloğlu B, Ertekin D, Akduman E. Manisa Bölgesinde hepatit C virus genotiplerinin dağılımı. Mikrobiyol Bul 2009;43:613-8.
12. Aktaş E, Ögedey ED, Külah C, Beğendik Cömert F. Zonguldak bölgesinde Hepatit C virüsü genotipleri. Mikrobiyol Bul 2010;44:647-50.
13. Tabak F, Tosun S editors. Viral Hepatit 2013. İstanbul: İstanbul Tıp Kitabevi; 2013.p.81-112.
14. Gökahmetoğlu S, Atalay MA, Kılınç A. Hepatit C virüs genotiplerinin pirosekanslama yöntemi ile belirlenmesi. Erciyes Tıp Dergisi 2011;33:99-102.
15. Kuşçu F, Kömür S, İnal AS, Ulu AC, Kurtaran B, Taşova Y et al. Changing epidemiology of chronic hepatitis C in Adana. Viral Hepatitis Journal 2014;20(1):15-8.
16. Çiftçi İH, Er H, Aşık G, Aktepe OC, Altındiş M. Hepatit C virusu (HCV) RNA pozitif olgularda genotip dağılımı. Kocatepe Tıp Dergisi 2009;10:21-4.
17. Tezcan S, Ülger M, Aslan G, Yaraş S, Altıntaş E, Sezgin O et al. Mersin ilinde Hepatit C virüsü genotip dağılımının belirlenmesi. Mikrobiyol Bul 2013;47:332-8.
18. Poordad F, Mc Cone Jr J, Bacon BR, Bruno S, Manns MP, Sulkowski MS et al. Boceprevir for untreated chronic HCV genotype 1 infection. N Engl J Med 2011;364(13):1195-206.
19. Zeuzem S, Andreone P, Pol S, Lawitz E, Diago M, Roberts S et al. Telaprevir for treatment of HCV infection. N Engl J Med 2011;364(25):2417-28.

APA	AGCA H, mıstık r, Kazak E (2015). Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region. , 190 - 192.
Chicago	AGCA HARUN,mıstık reşit,Kazak Esra Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region. (2015): 190 - 192.
MLA	AGCA HARUN,mıstık reşit,Kazak Esra Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region. , 2015, ss.190 - 192.
AMA	AGCA H,mıstık r,Kazak E Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region. . 2015; 190 - 192.
Vancouver	AGCA H,mıstık r,Kazak E Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region. . 2015; 190 - 192.
IEEE	AGCA H,mıstık r,Kazak E "Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region." , ss.190 - 192, 2015.
ISNAD	AGCA, HARUN vd. "Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region". (2015), 190-192.

APA	AGCA H, mıstık r, Kazak E (2015). Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region. Journal of Clinical and Analytical Medicine, 6(2), 190 - 192.
Chicago	AGCA HARUN,mıstık reşit,Kazak Esra Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region. Journal of Clinical and Analytical Medicine 6, no.2 (2015): 190 - 192.
MLA	AGCA HARUN,mıstık reşit,Kazak Esra Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region. Journal of Clinical and Analytical Medicine, vol.6, no.2, 2015, ss.190 - 192.
AMA	AGCA H,mıstık r,Kazak E Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region. Journal of Clinical and Analytical Medicine. 2015; 6(2): 190 - 192.
Vancouver	AGCA H,mıstık r,Kazak E Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region. Journal of Clinical and Analytical Medicine. 2015; 6(2): 190 - 192.
IEEE	AGCA H,mıstık r,Kazak E "Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region." Journal of Clinical and Analytical Medicine, 6, ss.190 - 192, 2015.
ISNAD	AGCA, HARUN vd. "Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in the South Marmara Region". Journal of Clinical and Analytical Medicine 6/2 (2015), 190-192.